Dergiler / Biyolojik Çeşitlilik ve Koruma / 2015 / Cilt: 8 - Sayı: 3

Bazı endemik Salvia türleri arasındaki genetik akrabalığın RAPD belirteçleri ile saptanması

Determination of genetic relationships between some endemic Salvia species using RAPD markers

Sayfa
248–253
Yayın Tarihi
2015-12-15
DOI
—
🏛️Bu makalenin bibliyografik verileri ve tam metin bağlantısı DergiPark üzerinden sağlanmıştır.
DergiPark Kaydı ↗
✨

Yapay Zeka Hızlı Bakış & Çıkarımlar

AI Insight
⚡ TL;DR(1 Cümlede Hızlı Çıkarım)

RAPD analizi ile belirlenen bu genetik ilişki temelde morfolojik verilerle uyum göstermektedir.

📌 3 Maddede Bu Makale

🎯
Amaç & Hipotez:Bu çalışmada, rastgele çoğaltılmış polimorfik DNA RAPD analizi 4 endemik Salvia türü arasındaki genetik akrabalığı belirlemek amacıyla kullanılmıştır.
📊
Temel Bulgular & Veri:Toplamda 15 primer denenmiş bunlardan 7’si polimorfik ve tekrar çoğaltılabilen bantlar oluşturmuştur.
💡
Sonuç & Katkı:RAPD analizi ile belirlenen bu genetik ilişki temelde morfolojik verilerle uyum göstermektedir.
🔬Tür:Laboratuvar & Saha Deneyi
📍Kapsam:Genişletilmiş Akademik Örneklem
⚙️Değişkenler:Salvia · genetik ilişki · RAPD

Özet

Bu çalışmada, rastgele çoğaltılmış polimorfik DNA RAPD analizi 4 endemik Salvia türü arasındaki genetik akrabalığı belirlemek amacıyla kullanılmıştır. Toplamda 15 primer denenmiş bunlardan 7’si polimorfik ve tekrar çoğaltılabilen bantlar oluşturmuştur. Çoğaltılan 81 banttan 80’i %98.7 polimorfiktir. Primer başına çoğaltılan bant sayısı 7 ila 14 arasında değişmiştir. Benzerlik katsayısı hesaplanarak UPGMA işlemi ile dendrogram oluşturulmuştur. Bu dendrogramda 4 Salvia türü iki ana kümeye ayrılmıştır. Birinci küme iki alt kümeye ayrılarak ilki S. wiedemannii’ye ait bireyleri, diğer alt küme ise S. tchihatcheffii’ye ait bireyleri içermiştir. İkinci küme de iki alt kümeye ayrılmıştır. İlk alt küme S. crypthanta’ya ait bireyleri içerirken ikinci alt küme S. cyanescens’i içermiştir. RAPD analizi ile belirlenen bu genetik ilişki temelde morfolojik verilerle uyum göstermektedir. Dolayısıyla, RAPD tekniği Salvia cinsi içerisinde genetik akrabalık çalışmalarında kullanılabilir, güvenilir bir belirteç sistemidir

Abstract

In this study, randomly amplified polymorphic DNA RAPD analysis was used to determine genetic relationship among four endemic Salvia species. A total of 15 primers were screened, among them 7 primers produced polymorphic and reproducible bands. Eighty one DNA bands were amplified, among which 80 bands 98.7% were polymorphic. The number of bands amplified per primer varied from 7 to 14. Similarity coefficients were calculated and a dendrogram was constructed by using UPGMA algorithm. In dendrogram, the four Salvia species were divided into two major clusters. Cluster I included two subclusters, one containing all accessions of S. wiedemannii and the other one containing accessions of S. tchihatcheffii. Cluster II was also separated into two subclusters. The first subcluster contained all accessions belonging to S. crypthanta and the second subcluster contained S. cyanescens. The genetic relationships estimated by the RAPD analysis are basically in agreement with morphological data. Thus, RAPD technique is a reliable marker system that can be used to study genetic relationship in the genus Salvia

🔖

Bu Makaleye Atıf Yap

SÖZEN, E., YÜCEL, E. (2015). Bazı endemik Salvia türleri arasındaki genetik akrabalığın RAPD belirteçleri ile saptanması. Biyolojik Çeşitlilik ve Koruma, Cilt: 8 - Sayı: 3, 248–253. https://ajindex.com/articles/744634

📄 Tam Metin PDF Okuyucu

📄

PDF görüntüleyici hazırlanıyor...

Kaynakça (16)

  1. Agostini, G., Echeverrigaray, S., Souza-Chies, T. T. 2008. Genetic relationships among South American species of Cunila D. Royen ex L. based on ISSR. Plant Systematics and Evolution 274/3: 135-141.
  2. Başer, K.H.C. 1995. Composition of the essential oil of Salvia cryptantha from Turkey, Journal of Essential Oil Research, 7: 113-114.
  3. Başer, K.H.C. 2000. In: A. Güner vd. (ed.) Index to Turkish Plant Chemical Contents, Flora of Turkey and the East Aegean Islands, Vol. 11: 538-542.
  4. Belaj, A., Trujilo, I., Rosa, R., Rallo, L., Gimenez, M.J. 2001. Polymorphism and discrimination capacity of randomly amplified polymorphic markers in an olive germplasm bank. J Am Soc Hort Sci 126: 64–71
  5. Botstein, D., White R.L., Skolnick, M., Davis, R.W. 1980. Construction of a genetic linkage map in man using restriction fragment length polymorphism. American Journal of Human Genetics 32: 314–331.
  6. Deshwall, R.P.S., Singh, R., Malik, K., Randhawa, G.J. 2005. Assessment of genetic diversity and genetic relationships among 29 populations of Azadirachta indica A. Juss. using RAPD markers. Genetic Resources and Crop Evolution 52: 285–292
  7. Echeverrigaray, S.; Agostini, G. 2006. Genetic relationships between commercial cultivars and Brazilian accessions of Salvia officinalis L. based on RAPD markers. Rev. Bras. Pl. Med. 8: 13-17.
  8. Echeverrigaray, S.; Agostini, G.; Atti-Serfini, L.; Paroul, N.; Pauletti, G. F.; Atti dos Santos, A. C. 2001. Correlation between the chemical and genetic relationships among commercial thyme cultivars. Journal of Agricultural and Food Chemistry 49: 4220–4223.
  9. Ekim T., Koyuncu, M., Vural, M., Duman, H., Aytaç, Z. & Adıgüzel, N. 2000.
  10. Turkish Plants Red Data Book., Doğal Hayatı Koruma Derneği ve Yüzüncüyıl Üniversitesi,
  11. Ankara.
  12. Fracaro, F.; Zacaria, J.; Echeverrigaray, S. 2005. RAPD based genetic relationships between populations of three chemotypes of Cunila galioides Benth. Biochemical Systematics and Ecology 33: 409–417.
  13. Hedge, I.C., 1982. Salvia L. In: Davis, P.H. (Ed.), Flora of Turkey and the East Aegean Islands, vol. 7. Edinburgh University Press, Edinburgh, pp.400-461.
  14. Jaccard, P. 1908. Novelles recherches sur la distribution florale. Bullettin de la Societe Vaudoise des Science Naturelles 44: 223–270.
  15. Kapteyn, J., Goldsbrough, P. B., Simon, J. E. 2002. Genetic relationships and diversity of commercially relevant Echinacea species. Theoretical and Applied Genetics 105: 369–376.
  16. Karaca, M., Ince, A. G., Tugrul Ay, S., Turgut, K., Onus, A. N. 2008. PCR-RFLP an