Dergiler / Acta Veterinaria Eurasia / 2018 / Cilt: 44 - Sayı: 2

Kuzeybatı İran'da Koyun ve Broyler Tavuğundan Elde Edilen Verotoksijenik Escherichia coli (VTEC) Filogenetik Grubu

Phylogenetic Grouping of Verotoxigenic Escherichia coli (VTEC) Obtained from Sheep and Broiler Chicken in Northwestern Iran

Sayfa
53–58
Yayın Tarihi
2022-11-05
DOI
—
🏛️Bu makalenin bibliyografik verileri ve tam metin bağlantısı DergiPark üzerinden sağlanmıştır.
DergiPark Kaydı ↗
✨

Yapay Zeka Hızlı Bakış & Çıkarımlar

AI Insight
⚡ TL;DR(1 Cümlede Hızlı Çıkarım)

Sonuç olarak, koyun kaynaklı izolatların %46,4’ünde (45/97) vtx geni taşıyan E. coli saptanmış ve broylerler için saptanan yüzdeler ise %8,3 (29/349) olmuştur.

📌 3 Maddede Bu Makale

🎯
Amaç & Hipotez:Verotoksijenik Escherichia coli (VTEC), artan bir halk sağlığı sorunu olan başlıca gıda kaynaklı patojenlerdir.
📊
Temel Bulgular & Veri:Bu çalışmada, 446 E. coli izolatı (koyundan 97 ve broyler tavuktarından 349), polimeraz zincir reaksiyonu (PCR) kullanılarak Vtx-kodlayan genlerin (vtx1 ve vtx2) oluşumu için test edilmiştir.
💡
Sonuç & Katkı:Sonuç olarak, koyun kaynaklı izolatların %46,4’ünde (45/97) vtx geni taşıyan E. coli saptanmış ve broylerler için saptanan yüzdeler ise %8,3 (29/349) olmuştur.
🔬Tür:Araştırma Makalesi
📍Kapsam:Genişletilmiş Akademik Örneklem
⚙️Değişkenler:Alan Parametreleri

Özet

Verotoksijenik Escherichia coli (VTEC), artan bir halk sağlığı sorunu olan başlıca gıda kaynaklı patojenlerdir. Çalışmanın amacı, Kuzeybatı İran’ın Urmia bölgesinde kesilen sağlıklı koyun ve broyler tavuklarının dışkılarından VTEC izolatlarının oluşum ve filogenetik gruplarını araştırmaktır. Bu çalışmada, 446 E. coli izolatı (koyundan 97 ve broyler tavuktarından 349), polimeraz zincir reaksiyonu (PCR) kullanılarak Vtx-kodlayan genlerin (vtx1 ve vtx2) oluşumu için test edilmiştir. Daha sonra, tüm geri kazanılmış VTEC izolatları, chuA, yjaA ve TSPE4.C2 olarak adlandırılan üç genetik sekans kullanılarak Clermont filotiplemeye dayanan filogenetik olarak gruplandırılmıştır. Sonuç olarak, koyun kaynaklı izolatların %46,4’ünde (45/97) vtx geni taşıyan E. coli saptanmış ve broylerler için saptanan yüzdeler ise %8,3 (29/349) olmuştur. Genel olarak, filotipleme, 74 VTEC izolatının, filogenetik olarak grup A (%32,4, VTEC-A olarak belirlenmiş), B1 (%44,6; VTEC-B1), B2 (%9,5; VTEC-B2) ve D (%13,5; VTEC-D) olarak ayrıldığını ortaya koymuştur. Buna ek olarak, sonuçlar ayrıca, koyun ve broyler tavuklarının VTEC izolatlarının yayılmasının B1 ve D filogenetik grupları arasında belirgin olarak farklılık gösterdiğini göstermiştir (p

Abstract

Verotoxigenic Escherichia coli (VTEC) are major foodborne pathogens with an increasing public health concern. The purposeof this study was to investigate the occurrence and the phylogenetic groups of VTEC isolates from the feces of healthy sheepand broiler chickens at a slaughterhouse in Urmia region, Northwestern Iran. A total of 446 E. coli isolates (97 from sheep and349 from broiler chickens) were assessed for the occurrence ofthe Vtx-encoding genes (vtx1 and vtx2) using polymerase chainreaction. Then, all the recovered VTEC isolates were phylogenetically grouped based on the Clermont phylotyping methodusing three genetic sequences, the so-called chuA, yjaA, andTSPE4.C2. The vtx gene-carrying E. coli was identified in 46.4%(45/97) of sheep-originated isolates and in 8.3% (29/349) of broiler chicken-originated isolates. In general, phylotyping revealed that 74 VTEC isolates segregated in the phylogenetic groupsA (32.4%; designated as VTEC-A), B1 (44.6%; VTEC-B1), B2 (9.5%;VTEC-B2), and D (13.5%; VTEC-D). The results also showed thatthe dissemination of VTEC isolates of sheep and broiler chickenorigin varied noticeably in their assignment to B1 and D phylogenetic groups (p

🔖

Bu Makaleye Atıf Yap

ZAVARSHANI, M., SAEI, H. D. (2022). Kuzeybatı İran'da Koyun ve Broyler Tavuğundan Elde Edilen Verotoksijenik Escherichia coli (VTEC) Filogenetik Grubu. Acta Veterinaria Eurasia, Cilt: 44 - Sayı: 2, 53–58. https://ajindex.com/articles/655790

📄 Tam Metin PDF Okuyucu

📄

PDF görüntüleyici hazırlanıyor...

Kaynakça (2)

  1. Alonso, M.Z., Lucchesi, P.M.A., Rodríguez, E.M., Parma, A.E., Padola, N.L., 2012. Enteropathogenic (EPEC) and Shigatoxigenic Escherichia coli (STEC) in broiler chickens and derived products at different retail stores. Food Control 23(2), 351-355. [Crossref] Bagheri, M., Ghanbarpour, R., Alizade, H., 2014. Shiga toxin and beta-lactamases genes in Escherichia coli phylotypes isolated from carcasses of broiler chickens slaughtered in Iran. International Journal of Food Microbiology 177, 16-20. [Crossref] Bergthorsson, U., Ochman, H., 1998. Distribution of chromosome length variation in natural isolates of Escherichia coli. Molecular Biology and Evolution 15(1), 6-16. [Crossref] Blanco, M., Blanco, J.E., Mora, A., Rey, J., Alonso, J.M., Hermoso, M., Hermoso, J., Alonso, M.P., Dahbi, G., Gonzalez, E.A., Bernardez, M.I., Blanco, J., 2003. Serotypes, virulence genes, and intimin types of Shiga toxin (verotoxin)-producing Escherichia coli isolates from healthy sheep in Spain. Journal of Clinical Microbiology 41(4), 1351-1356. [Crossref] Carlos, C., Pires, M.M., Stoppe, N.C., Hachich, E.M., Sato, M.I., Gomes, T.A., Amaral, L.A., Ottoboni, L.M., 2010. Escherichia coli phylogenetic group determination and its application in the identification of the major animal source of fecal contamination. BMC Microbiology 10, 161. [Crossref] Cho, S., Fossler, C.P., Diez-Gonzalez, F., Wells, S.J., Hedberg, C.W., Kaneene, J.B., Ruegg, P.L., Warnick, L.D., Bender, J.B., 2013. Herd-level risk factors associated with fecal shedding of Shiga toxin-encoding bacteria on dairy farms in Minnesota, USA. Canadian Veterinary Journal 54(7), 693-697.
  2. Clermont, O., Bonacorsi, S., Bingen, E., 2000. Rapid and simple determination of the Escherichia coli phylogenetic group. Applied and Environmental Microbiology 66(10), 4555-4558. [Crossref] Clermont, O., Olier, M., Hoede, C., Diancourt, L., Brisse, S., Keroudean, M., Glodt, J., Picard, B., Oswald, E., Denamur, E., 2011. Animal and human pathogenic Escherichia coli strains share common genetic backgrounds. Infection, Genetics and Evolution 11(3), 654-662. [Crossref] Dixit, S.M., Gordon, D.M., Wu, X.Y., Chapman, T., Kailasapathy, K., Chin, J.J., 2004. Diversity analysis of commensal porcine Escherichia coli - associations between genotypes and habitat in the porcine gastrointestinal tract. Microbiology 150(Pt 6), 1735-1740. [Crossref] Escobar-Paramo, P., Grenet, K., Le Menac’h, A., Rode, L., Salgado, E., Amorin, C., Gouriou, S., Picard, B., Rahimy,