Dergiler / Gümüşhane Üniversitesi Fen Bilimleri Dergisi / 2018 / Cilt: 8 - Sayı: 2

Glikoz İzomeraz Üreticisi Dört Geobacillus Suşunun İzolasyonu ve Moleküler Metotlar Kullanarak Tanımlanması

Isolation of Four Glucose Isomerase Producing Strains of Geobacillus and Their Identification Using Molecular Methods

Sayfa
299–308
Yayın Tarihi
2022-11-03
DOI
—
🏛️Bu makalenin bibliyografik verileri ve tam metin bağlantısı DergiPark üzerinden sağlanmıştır.
DergiPark Kaydı ↗
✨

Yapay Zeka Hızlı Bakış & Çıkarımlar

AI Insight
⚡ TL;DR(1 Cümlede Hızlı Çıkarım)

Bu enzimler arasında BT1 izolatının optimal büyüme sıcaklığı 75 °C olarak belirlenirken, diğer üç izolatın enzimleri ise 80 °C'de optimal büyüme gösterdi. 16S rRNA gen dizi analizleri ile 4 izolatın, Geobacillus cinsine ait türler oldukları belirlendi. recN dizisi benzerlik analizine dayanarak, izolat CT6SARI’nın, G. termodenitficans’a; izolat BT1’in de, G. stearothermophilus’a ait suşlar oldukları belirlendi.BT5 ve CT1.2 izolatlarının kesin tür tayinleri yapılamadı.

📌 3 Maddede Bu Makale

🎯
Amaç & Hipotez:Türkiye'nin batısındaki iki kaplıca, termofilik mikroorganizmaların mevcudiyetine göre araştırıldı ve iki termal kaplıcadan,23 termofilik bakteri izole edildi.
📊
Temel Bulgular & Veri:İzolatlardan, 4 tanesinin glikoz izomeraz üretimi açısından pozitif olduğu belirlendi.
💡
Sonuç & Katkı:Bu enzimler arasında BT1 izolatının optimal büyüme sıcaklığı 75 °C olarak belirlenirken, diğer üç izolatın enzimleri ise 80 °C'de optimal büyüme gösterdi. 16S rRNA gen dizi analizleri ile 4 izolatın, Geobacillus cinsine ait türler oldukları belirlendi. recN dizisi benzerlik analizine dayanarak, izolat CT6SARI’nın, G. termodenitficans’a; izolat BT1’in de, G. stearothermophilus’a ait suşlar oldukları belirlendi.BT5 ve CT1.2 izolatlarının kesin tür tayinleri yapılamadı.
🔬Tür:Araştırma Makalesi
📍Kapsam:Genişletilmiş Akademik Örneklem
⚙️Değişkenler:Geobacillus · Glikoz izomeraz · recN

Özet

Türkiye'nin batısındaki iki kaplıca, termofilik mikroorganizmaların mevcudiyetine göre araştırıldı ve iki termal kaplıcadan,23 termofilik bakteri izole edildi. İzolatlardan, 4 tanesinin glikoz izomeraz üretimi açısından pozitif olduğu belirlendi. BT5, CT6SARI ve CT1.2 izolatlarının glikoz izomerazları, pH 6.5'te optimum büyüme gösterdi; buna karşılık izolat BT1 enzimi, pH 7.5'te optimal aktivite gösterdi. Bu enzimler arasında BT1 izolatının optimal büyüme sıcaklığı 75 °C olarak belirlenirken, diğer üç izolatın enzimleri ise 80 °C'de optimal büyüme gösterdi. 16S rRNA gen dizi analizleri ile 4 izolatın, Geobacillus cinsine ait türler oldukları belirlendi. recN dizisi benzerlik analizine dayanarak, izolat CT6SARI’nın, G. termodenitficans’a; izolat BT1’in de, G. stearothermophilus’a ait suşlar oldukları belirlendi.BT5 ve CT1.2 izolatlarının kesin tür tayinleri yapılamadı.

Abstract

Two hot springs located in west of Turkey were investigated with respect to presence of thermophilic microorganisms. 23 thermophilic bacteria were isolated from two hot springs. Among these, 4 strains were found positive for glucose isomerase production. The glucose isomerases of strains BT5, CT6SARI and CT1.2 showed optimal growth at pH 6.5, whereas the enzyme of strain BT1 represented optimal activity at pH 7.5. The strain BT1 had the lowest temperature optima (75°C) among these strains whereas the other three strains showed optimal growth at 80 °C. On the basis of the 16S rRNA gene sequence analysis, the 4 isolates are members of the genus Geobacillus. Based on recN sequence similarity analysis, the isolate CT6SARI is a strain of G. thermodenitficans. The isolate BT1 is a strain of G. stearothermophilus. The species identity for the isolates BT5 and CT1.2are uncertain.

🔖

Bu Makaleye Atıf Yap

BEKTAŞ, K. İ. (2022). Glikoz İzomeraz Üreticisi Dört Geobacillus Suşunun İzolasyonu ve Moleküler Metotlar Kullanarak Tanımlanması. Gümüşhane Üniversitesi Fen Bilimleri Dergisi, Cilt: 8 - Sayı: 2, 299–308. https://ajindex.com/articles/651161

📄 Tam Metin PDF Okuyucu

📄

PDF görüntüleyici hazırlanıyor...

Kaynakça (16)

  1. Abdel-rassol, T.M.A., Badr, S.A. ve Omran, H.T., 2012. Glucose (xylose) isomerase production from thermotolerant and thermophilic bacteria, African Journal of Biotechnology, 11, 15798-15801.
  2. Altschul, S.F., Gish, W. ve Miller, W., 1990.
  3. Basic local aligment search tool, Journal Molecular Biology, 215, 403-410.
  4. Bandlish, R.K., Michael, H.J., Epting, K.L., Vieille, C. ve Kelly, R.M., 2002. Glucose-to-fructose conversion at high temperatures with xylose (glucose) isomerases from Streptomyces murinus and two hyperthermophilic Thermotoga species. Biotechnology Bioenergy, 80, 185-194.
  5. Beffa, T., Blanc, M., Lyon, P.F., Vogt, G., Marchiani, M., Fischer, J.L. ve Aragno, M., 1996. Isolation of Thermus strains from hot compost (60 to 80 ˚C). Applied and Environmental Microbiology, 62, 1723-1727.
  6. Beg, O.K., Bhushan, B., Kapoor, M. ve Hoondal, G.S., 2000. Production and characterization of thermostable xylanase and pectinase from Streptomyces sp. QG-11-3, Journal of Industrial Microbiology and Biotechnology, 24, 396-402.
  7. Benson, D.A., Boguski, M.S., Lipman, D.J., Oulette, B.F.F., Rapp, B.A. ve Wheelet, D.L., 1999.
  8. GenBank, Nucleic Acids Research, 27, 12-17.
  9. Bhosale, S.H., Rao, M.B. ve Deshpande, V.V., 1996. Molecular and industrial aspects of glucose isomerase, Microbiological Reviews, 60, 280-300.
  10. Brosius, J., Palmer, M.L., Kennedy, P.J. ve Noller, H.F., 1978. Complete nucleotide sequence of a 16S ribosomal RNA gene from Escherichia coli, Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States, 75, 4801-4805
  11. Calik, P., Angardi, V. ve Isik, N., 2009. Glucose isomerase production on a xylan-based medium by Bacillus thermoantarcticus, Biochemical Engineering Journal, 43, 8–15.
  12. Canakci, S., Inan, K., Kacagan, M. ve Belduz, A.O., 2007. Evaluation of Arabinofuranosidase and Xylanase Activities of Geobacillus spp. Isolated from Some Hot Springs in Turkey, Journal of Microbiology and Biotechnology, 17, 1262-1270.
  13. Chauthaiwale, J.V. ve Rao, M.B., 1994. Production and purification of extracellular xylose ısomerase from an alkaliphilic, thermophilic Bacillus sp, Applied Environmental Microbiology, 60, 4495–4499.
  14. Dische, Z. ve Borenfreund, E., 1951. A new spectrophotometric method for the detection and determination of ketosugars and trioses, The Journal of Biological Chemistry, 192, 583-587.
  15. Dussault, HP., 1955. An improved technique for staining red halophilic bacteria. Journal Bacteriology, 70, 484–485.
  16. Felsenstein, J., 1985. Confidence limits on phylogenies: an a