Yapay Zeka Hızlı Bakış & Çıkarımlar
AI InsightYapılan çalışmalar kromozom 5q31.1 lokusundayer alan TGFBI geninin ekzon 4 ve ekzon 12 bölgelerinde sırasıyla R124H ve R555W değişimlerinin GKD gelişimine yol açansıcak nokta mutasyonları olduğunu göstermektedir.
📌 3 Maddede Bu Makale
Özet
Amaç: Granüler kornea distrofisinin (GKD) karakteristik özellikleri kornea stromasında yerleşim gösteren küçük, ayrık,keskin kenarlı, grimsi beyaz opasitelerdir. GKD’nin gelişiminden sorumlu tutulan genler içinde en kuvvetli ilişkilendirilen gentransforme edici büyüme faktörü beta tarafından indüklenen (TGFBI) genidir. Yapılan çalışmalar kromozom 5q31.1 lokusundayer alan TGFBI geninin ekzon 4 ve ekzon 12 bölgelerinde sırasıyla R124H ve R555W değişimlerinin GKD gelişimine yol açansıcak nokta mutasyonları olduğunu göstermektedir. Bu çalışmada GKD Tip 1 Türk ailelerde TGFBI geninde ekzon 4 ve 12bölgelerinde yer alan iki sıcak nokta mutasyonunun ve varsa proteinde önemli işlevsel bölgeleri kodlayan bu ekzon bölgelerindekibaşka mutasyonların araştırılması ve belirlenen mutasyonların hastalıkla ve ilgili fenotiplerle ilişkisinin belirlenmesi amaçlanmıştır.Gereç ve Yöntem: Çalışmamıza GKD tip 1 (GKD1), tanısı alan 16 hasta ile bu bireylerin aile ağaçlarından belirlenen 11 sağlıklıbirey ve bu ailelerle akraba olmayan 28 sağlıklı birey dahil edildi. Her bir bireyden alınan periferik kan örneklerinden DNA elde edildive polimeraz zincir yöntemi tekniği ile hedef gen bölgeleri çoğaltıldı. Genotipleme çalışmaları Dizi Analizi yöntemiyle gerçekleştirildi.Bulgular: Hasta ve sağlıklı bireylerin TGFBI geninin ekzon 4 bölgesinde R124S mutasyonu belirlenmedi. Ancak GKD1 tanısıalan tüm bireylerde TGFBI geninin ekzon 12 bölgesinde R555W mutasyonu heterozigot olarak tespit edildi. Ailelerin sağlıklıbireyleri ve bu ailelerle akraba olmayan kontrol bireylerinde ise bu mutasyon gözlenmedi. Ayrıca çalışmamızda bazı hasta vesağlıklı bireylerde sessiz bir mutasyon olan F540F değişimi ile intronik bölgede yer alan c.32924G>A değişimi tespit edildi.Sonuç: Bulgularımız, TGFBI geninin ekzon 12 bölgesinde yer alan bir sıcak nokta mutasyonu olan R555W mutasyonunun GKD1 ileliteratürde rapor edilen ilişkisini kuvvetli şekilde desteklemektedir.
Abstract
Objectives: Granular corneal dystrophies (GCD) are characterized by small, discrete, sharp-edged, grayish-white opacities in the corneal stroma. Among the genes responsible for the development of GCD, the most strongly related gene is transforming growth factor beta-induced (TGFBI), located in the 5q31.1 locus. Studies show that R124H in exon 4 and R555W in exon 12 are hot-spot mutations in the TGFBI gene that lead to GCD development. In this study, we aimed to investigate these two hotspot mutations in exons 4 and 12 of the TGFBI gene and other possible mutations in the same regions, which code important functional regions of the protein, in Turkish families with GCD1 and to determine the relationship between the mutations and disease and related phenotypes. Materials and Methods: The study included, 16 individuals diagnosed with GCD type 1 (GCD1), 11 of these patients’ healthy relatives, and 28 unrelated healthy individuals. DNA was obtained from peripheral blood samples taken from each individual and polymerase chain reaction was used to amplify target gene regions. Genotyping studies were done by sequence analysis. Results: The R124S mutation in exon 4 of TGFBI was not detected in the patients or healthy individuals in our study. However, all individuals diagnosed as having GCD1 were found to be heterozygous carriers of the R555W mutation in exon 12 of TGFBI. This mutation was not detected in healthy family members or control individuals unrelated to these families. In addition, we detected the silent mutation F540F in exon 12 and c.32924 G>A substitution in an intronic region of the gene in a few patients and healthy individuals. Conclusion: Our study strongly supports the association of GCD1 with R555W mutation in exon 12 region of the TGFBI gene, as reported in the literature.