Dergiler / Türk Nöroloji Dergisi / 2006 / Cilt: 12 - Sayı: 5

Spinal müsküler atrofi hastalarında SMN geni ekzon 7 ve 8'in moleküler analizi

Molecular analysis of exon 7 and 8 of SMN gene in spinal muscular atrophy patients

Sayfa
353–361
Yayın Tarihi
2022-11-05
DOI
—
🏛️Bu makalenin bibliyografik verileri ve tam metin bağlantısı DergiPark üzerinden sağlanmıştır.
DergiPark Kaydı ↗
✨

Yapay Zeka Hızlı Bakış & Çıkarımlar

AI Insight
⚡ TL;DR(1 Cümlede Hızlı Çıkarım)

PCR -SSCP methodu, hem diğer intragenik mutasyonlar ve özellikle birleşik (compound) heterozigotları hem de RFLP yöntemi ile homozigot delesyon saptanan bazı'SMA hastalarının sonuçlarını konfirme etmek için kullanılmıştır.Sonuçlar: ' RFLP yöntemi ile tüm SMA hastalarının (tiplerine bakılmaksızın) %92.4 (49/53)'ünde SMN1 geni homozigot ekzon 7 ve 8 delesyonu tespit edilmiştir.

📌 3 Maddede Bu Makale

🎯
Amaç & Hipotez:Bilimsel zemin:Spinal müsküler atrofi (SMA), 6.000-10.000 canlı doğumda bir görülen, 1/40-60 oranında taşıyıcı frekansına sahip, omuriliğin ön boynuz hücrelerinde dejenerasyona neden olan otozomal. resesif kalıtılan bir hastalıktır.
📊
Temel Bulgular & Veri:SMA moleküler düzeyde, SMN1 geninin exöh 7 ve 8 veya yalnızca exon 7 homozigot delesyonunun saptanması ile teşhis edilir.
💡
Sonuç & Katkı:PCR -SSCP methodu, hem diğer intragenik mutasyonlar ve özellikle birleşik (compound) heterozigotları hem de RFLP yöntemi ile homozigot delesyon saptanan bazı'SMA hastalarının sonuçlarını konfirme etmek için kullanılmıştır.Sonuçlar: ' RFLP yöntemi ile tüm SMA hastalarının (tiplerine bakılmaksızın) %92.4 (49/53)'ünde SMN1 geni homozigot ekzon 7 ve 8 delesyonu tespit edilmiştir.
🔬Tür:Laboratuvar & Saha Deneyi
📍Kapsam:53 hasta
⚙️Değişkenler:Alan Parametreleri

Özet

Bilimsel zemin:Spinal müsküler atrofi (SMA), 6.000-10.000 canlı doğumda bir görülen, 1/40-60 oranında taşıyıcı frekansına sahip, omuriliğin ön boynuz hücrelerinde dejenerasyona neden olan otozomal. resesif kalıtılan bir hastalıktır. SMA moleküler düzeyde, SMN1 geninin exöh 7 ve 8 veya yalnızca exon 7 homozigot delesyonunun saptanması ile teşhis edilir. Amaç: SMA tanısı alan veya SMA olasılığı taşıyan 108 kişide (53 hasta ve 55 olası hasta) SMN geni ekzon 7 ve 8'in moleküler analizi amaçlanmıştır. Yöntem: PCR-RFLP yöntemi homozigot ekzon 7 ve 8 delesyonlarını belirlemek için kullanılmıştır. PCR -SSCP methodu, hem diğer intragenik mutasyonlar ve özellikle birleşik (compound) heterozigotları hem de RFLP yöntemi ile homozigot delesyon saptanan bazı'SMA hastalarının sonuçlarını konfirme etmek için kullanılmıştır.Sonuçlar: ' RFLP yöntemi ile tüm SMA hastalarının (tiplerine bakılmaksızın) %92.4 (49/53)'ünde SMN1 geni homozigot ekzon 7 ve 8 delesyonu tespit edilmiştir. Tipleri dikkate alındığında ise Tip 1 hastalarının %94,7 (18/19), Tip 2 hastalarının %91.6 (11/12), Tip 3 hastalarının %89.4 (17/19)'ünde homozigot delesyon bulunmuştur. PCR-RFLP yöntemi ile ekzon 7 ve 8'de homozigot delesyonunun olmadığı belirlenen fakat klinik olarak SMA hastası olan 4 olguda ise SSCP yöntemi kullanılmış ve sonuçlar değerlendirildiğinde ise birleşik heterozigot veya intragenik mutasyonlu hasta olabileceği sonucuna varılmıştır.

Abstract

ABSTRACT Molecular Analysis of Exon 7 and 8 of SMN Gene in Spinal Muscular Atrophy Patients Scientific background: The spinal muscular atrophy (SMA) causing degeneration of the anterior horn cells of the spinal cord is the most common autosomal recessive disease, affecting approximately 1 in 6.000- 10.000 live births and having a carrier frequency of approximately 1 in 40-60. SMA is diagnosed with detection of homozygous deletions of SMN1 (exon 7 - 8 or exon 7) gene in molecular level. Objectives: It is aimed to conduct molecular analysis of exon 7 and 8 of SMN gene in a hundred and eight subjects of SMA (53 patients and 55 suspected subjects). Materials and methods: PCR-RFLP method is used for detection of homozygous exon 7 -~8 deletions. PCR-SSCP method was used either to identify for intragenic mutations and especially compound heterozygotes or to confirm some SMA patients homozygous deletions detected by RFLP. Conclusion: In this study, 92.4% (49/53) of SMA patients including all types were found homozygous for exon 7 and 8 deletions with RFLP method. The rate of homozygous deletions determined was 94.7% (18/19) in type I patients, 91.6% (11/12) in typell and 89.4% (17/19) intype III. SSCP method was used only for 4 subjects who are clinically diagnosed as SMA patients but not confirmed with RFLP analysis. The results of SSCP analyses led to decision that patients may be of compound heterozygous or intragenic mutations.

🔖

Bu Makaleye Atıf Yap

GÜZEL, A. İ., KOÇ, F., HERGÜNER, Ö., KASAP, H., SARICA, Y., SEL, K. S. (2022). Spinal müsküler atrofi hastalarında SMN geni ekzon 7 ve 8'in moleküler analizi. Türk Nöroloji Dergisi, Cilt: 12 - Sayı: 5, 353–361. https://ajindex.com/articles/637159

📄 Tam Metin PDF Okuyucu

📄

PDF görüntüleyici hazırlanıyor...

Kaynakça (12)

  1. Sarıca Y ve Özeren A. Spinal Müsküler Atrofiler. Ç. Ü. Arşiv Kaynak Tarama Dergisi, 1996,;5(3):202-219
  2. Erişim:http://www.ncbi.nlrn.nih.gov/entrez/disporrıim.cgi?id=253300 Erişim tarih:01.04.2004 3. Lefebvre S, Bürglen L, Frezal J, Munnich A, Melki J. The role of the SMN gene in proximal spinal muscular atrophy. Human Molecular Genetics, 1998;7(10): 1531-1536
  3. Scheffer H, Cobben JM, Matthijs G and Wirth B. Best practice guidelines for molecular analysis in spinal muscular atrophy. Eur J Hum Genet, 2001;9:484-491
  4. Panigrahi I, Kesari A, Fadke SR and Mittal B. Clinical and Molecular Diagnosis of Spinal Muscular Atrophy. Neurology India, 2002; 50:117-122
  5. Wang CH, Xu J, Carter Ta, Ross BM, Dominski MK, Bellcross CA, Penchaszadeh GK,Munsat TL and Gilliam TC. Characterization of survival motor neuron (SMNT) gene deletions in asymptomatic carriers of spinal muscular atrophy. Human Molecular Genetics, 1996;5(3):359-365
  6. Chang J-G, Jong Y-J, Lin S-P, Soong B-W, Tsai C-H, Yang T-Y, Chang C-P and Wang W-S. Molecular analysis of Survival motor neuron (SMN) and neuronal apoptosisi inhibitory protein (NAİP) genes ao spinal muscular atrophy patients and their parents. Hum Genet, 1997; 100: 577-581
  7. Scheffer H, Cobben JM, Mensink RGJ, Stulp RP, Buys C HCM and van der Steege G. SMA carrier testing - validation of hemizygous SMN exon 7 deletion test for the identification of proximal spinal muscular atrophy carriers and patients with a single allele deletion. European Journal of Human Genetics, 2000;8:79-86
  8. McAndrew PE, Parsons DW, Simard LR, Rochette C, Ray PN, Mendell JR and Prior TW, Burghes AH. Identification of proximal spinal muscular atrophy carriers and patients by analysis of SMNT and SMNC gene copy number. Am J Hum Genet, 1997; 60:1411- 1422
  9. Parsons DW, McAndrew PE, Monani UR, Mendell JR, Burghes AH, Prior TW. An 11 base pair duplication in exon 6 of the SMN gene produces a type I spinal muscular atrophy (SMA) phenotype: further evidence for SMN as the primary SMA-determining gene. Hum Mol Genet. 1996;5:1727-1732
  10. Cusco' I, Barcelo' MJ, Baiget M, Tizzano EF. Implementation of SMA carrier testing in genetic Laboratories: comparison of two methods for quantifying the SMNIgene. Human Mutation, 2002;20:452 459
  11. Munsat TM, Davies KE. Meeting report: International SMA consortium meeting. Neuromuscular Disord 1992; 2:423-428
  12. Scheffer H, Cobben JM, Matthijs G and Wirth B. Best practice guidelines for molecular analysis in spina