Dergiler / Türk Mikrobiyoloji Cemiyeti Dergisi / 2015 / Cilt: 45 - Sayı: 1

Yoğun Bakım Ünitesi Hastaları Kan Kültürlerinden İzole Edilen Candida parapsilosis Suşlarının Mini Epidemiler Bakımından Araştırılması

Investigating of Candida parapsilosis Strains Isolated from Blood Cultures of Patients in Intensive Care Unit in Terms of Mini-Epidemics

Sayfa
41–47
Yayın Tarihi
2022-11-05
DOI
—
🏛️Bu makalenin bibliyografik verileri ve tam metin bağlantısı DergiPark üzerinden sağlanmıştır.
DergiPark Kaydı ↗
✨

Yapay Zeka Hızlı Bakış & Çıkarımlar

AI Insight
⚡ TL;DR(1 Cümlede Hızlı Çıkarım)

Klasik yöntemlerle tür tanısı yapılan suşların klonal ilişkileri rep-PCR DiversiLab® sistemi ile belirlenmiştir.Bulgular: Rep-PCR DiversiLab® sistemi ile yapılan klonal ilişki analizi sonucunda üç (A-C) farklı klon tespit edilmiş, A klonunun (%87.8, n=29) baskın tip olduğu belirlenmiştir.

📌 3 Maddede Bu Makale

🎯
Amaç & Hipotez:Amaç: Yoğun bakım ünitelerinde yatan hastalarda kateterizasyona bağlı olarak gelişen fungal enfeksiyonlar arasında en sık kan dolaşımı enfeksiyonları görülmektedir.
📊
Temel Bulgular & Veri:Antifungal tedaviye daha zor yanıt veren Candida tropicalis, Candida parapsilosis, Candida glabrata gibi albicans-dışı Candida türleriyle karsılaşma oranı hızla artmaktadır.
💡
Sonuç & Katkı:Klasik yöntemlerle tür tanısı yapılan suşların klonal ilişkileri rep-PCR DiversiLab® sistemi ile belirlenmiştir.Bulgular: Rep-PCR DiversiLab® sistemi ile yapılan klonal ilişki analizi sonucunda üç (A-C) farklı klon tespit edilmiş, A klonunun (%87.8, n=29) baskın tip olduğu belirlenmiştir.
🔬Tür:Araştırma Makalesi
📍Kapsam:2012 Verileri
⚙️Değişkenler:Alan Parametreleri

Özet

Amaç: Yoğun bakım ünitelerinde yatan hastalarda kateterizasyona bağlı olarak gelişen fungal enfeksiyonlar arasında en sık kan dolaşımı enfeksiyonları görülmektedir. Candida albicans endojen kaynaklı olmasından dolayı nozokomiyal fungal enfeksiyonlarda ilk sırada yer almaktadır. Antifungal tedaviye daha zor yanıt veren Candida tropicalis, Candida parapsilosis, Candida glabrata gibi albicans-dışı Candida türleriyle karsılaşma oranı hızla artmaktadır. Bu çalışmada, nozokomiyal potansiyeli bulunduğu bilinen C. parapsilosis suşlarının klonal yakınlıklarının rep-PCR (Repetitive Extragenic Palindromic ElementPolimeraz Zincir Reaksiyonu, bioMeriéux, Fransa) DiversiLab® yöntemiyle belirlenmesi amaçlanmıştır.Gereç ve Yöntem: Ocak 2012 ve Haziran 2013 yılları arasında santral venöz kateterden alınan kan örneklerinden izole edilen 33 C. parapsilosis suşu çalışmaya dâhil edilmiştir. Klasik yöntemlerle tür tanısı yapılan suşların klonal ilişkileri rep-PCR DiversiLab® sistemi ile belirlenmiştir.Bulgular: Rep-PCR DiversiLab® sistemi ile yapılan klonal ilişki analizi sonucunda üç (A-C) farklı klon tespit edilmiş, A klonunun (%87.8, n=29) baskın tip olduğu belirlenmiştir. B klonuna ait 3 suş, C klonunda ise bir suş saptanmıştır. A klonu, reanimasyon ünitesi örneklerinin %48.2'sinden, pediyatri yoğun bakım ünitesi örneklerinin %20.6'sı, cerrahi yoğun bakım ünitesi örneklerinin %17.2'sinden ve dahiliye yoğun bakım ünitesi örneklerinin %13.7'sinden izole edilmiştir. İlk ve son suşun izolasyon tarihleri arasında on sekiz aylık süre olduğu belirlenmiştir.Sonuç: C. parapsilosis suşlarının servisler arası transfer edilen hastalar ve çapraz bulaşlar sonucu yayıldığı düşünülmüştür. Çalışmada kullanılan rep-PCR DiversiLab® sisteminin epidemiyolojik çalışmalarda ve enfeksiyon kontrolünde kullanılabilecek kolay uygulanabilen, hızlı ve başarılı bir yöntem olduğu kanısına varılmıştır. Suşların hastane ortamındaki dağılımının klonal ilişki göstermesi, enfeksiyon kontrol önlemlerinin önemini bir kez daha vurgulamaktadır

Abstract

Objective: Bloodstream infections are seen the most common fungal infections which is caused by catheterization in the hospitalized patients in intensive care units. Candida albicans is the first nosocomial fungal infection owing to endogenous origin. Incidence of non-albicans Candida species (Candida tropicalis, Candida parapsilosis, Candida glabrata) that have antifungal treatment problems, are increasing rapidly. The aim of this study was to determine the clonal relationship between strains of C. parapsilosis by using rep-PCR (Repetitive Extragenic Palindromic Element-Polymerase Chain Reaction, bioMeriéux, Fransa) DiversiLab® method. Materials and Methods: A total of 33 C. parapsilosis strains isolated from blood samples obtained from central venous catheter between January 2010-June 2013 were included in the study. Clonal relationships of Candida parapsilosis strains which were type diagnosed by the conventional methods were determined by rep-PCR DiversiLab® system. Results: Rep-PCR DiversiLab® analysis have shown the presence of three clones (A-C). Clone A was found to be the dominant type. Twenty nine (87.8%) of the 33 C. parapsilosis strains belonged to clone A, 3 (9.0%) to clone B, one strains to clone C. Clone A was isolated from 48.2%, 20.6%, 17.2%, 13.7% of the samples sent from reanimation unit, pediatric intensive care unit, surgical intensive care unit, internal diseases intensive care units, respectively. Eight month interval has been found between first and last isolations. C. parapsilosis strains were scattered as a result of cross transmission and patient transfer among clinics. The repPCR DiversiLab® system which was used in this study has been evaluated as a rapid, easily applicable and successful procedure for epidemiological studies. Clonal distribution of strains in the hospital environment emphasizes the significance of infection control measures

🔖

Bu Makaleye Atıf Yap

ÖZGÜR, D., OKTAY, E., GÜLBUDAK, H., OTAĞ, F. (2022). Yoğun Bakım Ünitesi Hastaları Kan Kültürlerinden İzole Edilen Candida parapsilosis Suşlarının Mini Epidemiler Bakımından Araştırılması. Türk Mikrobiyoloji Cemiyeti Dergisi, Cilt: 45 - Sayı: 1, 41–47. https://ajindex.com/articles/635936

📄 Tam Metin PDF Okuyucu

📄

PDF görüntüleyici hazırlanıyor...

Kaynakça (13)

  1. Soll DR. The ins and outs of DNA fingerprinting the infectious fungi. Clin Microbiol Rev 2000; 13:332-70.
  2. Samaranayake LP, Fidel PL, Naglik JR, et al. Fungal infections associated with HIV infection. Oral Dis 2002; 8(Suppl 2):S151-60.
  3. Hagerty JA, Ortiz J, Reich D, Manzarbeitia C. Fungal infections in solid organ transplant patients. Surg Infect (Larchmt) 2003; 4:263-71.
  4. Bassetti M, Righi E, Costa A, et al. Epidemiological trends in nosocomial candidemia in intensive care. BMC Infect Dis 2006; 6:21.
  5. Colombo AL, Perfect J, DiNubile M, et al. Global distribution and outcomes for Candida species causing invasive candidiasis: results from an international randomized doubleblind study of caspofungin versus amphotericin B for the treatment of invasive candidiasis. Eur J Clin Microbiol 2003; 22:470-4.
  6. Yüksekkaya Ş, Fındık D, Arslan U. Yoğun bakım ünitesinde yatan hastaların idrarlarından izole edilen Candida türlerinin moleküler epidemiyolojisi ve antifungal duyarlılıkları. Mikrobiyol Bul 2011; 45:137-49
  7. Fridkin SK, Jarvis WR. Epidemiology of nosocomial fungal infections. Clin Microbiol Rev 1996; 9:499-511
  8. Horasan EŞ, Ersöz G, Göksu M, et al. Increase in Candida parapsilosis fungemia in critical care units: a 6-years study. Mycopathologia 2010; 170:263-8.
  9. Ergüt Sezer B, Arman D. Yoğun bakım ünitesinde gelişen fungal enfeksiyonlar. Yoğun Bakım Dergisi 2010; 9:121-8
  10. Otağ F, Aslan G, Şen S, Özturhan H, Emekdaş G. 2003- 2005 süresinde klinik örneklerden izole edilen maya türlerinin değerlendirilmesi. Infeks Derg 2005; 19:435-43
  11. Gülbudak H, Oktay E, Direkel Ş, Elçi K, Emekdaş G, Otağ F. Bir üniversite hastanesinde mayaların 9 yıllık profili. I. Ulusal Mikoloji Günleri Simpozyum Kitabı, Erzurum: Türkiye, 2014; 19
  12. Neppelenbroek KH, Seô RS, Urban VM, et al. Identification of Candida species in the clinical laboratory: a review of conventional, commercial, and molecular techniques. Oral Dis 2014; 20:329-44.
  13. Wise MG, Healy M, Reece K, et al. Species identification and strain differentiation of clinical Candida isolates using the DiversiLab system of automated repetitive sequence-based PCR. J Med Microbiol 2007; 56:778-87. http: