Dergiler / Türk Mikrobiyoloji Cemiyeti Dergisi / 2018 / Cilt: 48 - Sayı: 3

Giardia intestinalis Genotiplerinin, Real-Time PCR Yöntemi ile Dışkı Örneklerinden Belirlenmesi

Determination of Giardia intestinalis Genotypes in Stool Specimens by Real-Time PCR Method

Sayfa
187–191
Yayın Tarihi
2022-11-04
DOI
—
🏛️Bu makalenin bibliyografik verileri ve tam metin bağlantısı DergiPark üzerinden sağlanmıştır.
DergiPark Kaydı ↗
✨

Yapay Zeka Hızlı Bakış & Çıkarımlar

AI Insight
⚡ TL;DR(1 Cümlede Hızlı Çıkarım)

Dışkı örneklerinden DNA izolasyonu gerçekleştirildikten sonra genotip Ave genotip B için spesifik primerler kullanılarak real-timePCR ile analiz edildi.Bulgular: Çalışmamıza dâhil edilen 50 giardiyaz tanılıhastanın dışkı örneklerinde, 28’inde (%56) A genotipi saptanırken, 17’sinde (%34) B genotipi, 5’inde (%10) ise hemA, hem de B genotipi bulundu.

📌 3 Maddede Bu Makale

🎯
Amaç & Hipotez:Amaç: Giardia intestinalis flagellalı, Giardiyaz’a nedenolan bir protozoondur ve dünya çapında önemli bir sorundur.
📊
Temel Bulgular & Veri:Moleküler yöntemlerle sekiz farklı genotipisaptanan G. intestinalis’de, A ve B genotipinin, insan vememelilerde hastalıklarla ilişkili olduğu ve farklı genotiplerin, farklı klinik tablolar meydana getirebildiği bildirilmektedir.
💡
Sonuç & Katkı:Dışkı örneklerinden DNA izolasyonu gerçekleştirildikten sonra genotip Ave genotip B için spesifik primerler kullanılarak real-timePCR ile analiz edildi.Bulgular: Çalışmamıza dâhil edilen 50 giardiyaz tanılıhastanın dışkı örneklerinde, 28’inde (%56) A genotipi saptanırken, 17’sinde (%34) B genotipi, 5’inde (%10) ise hemA, hem de B genotipi bulundu.
🔬Tür:Araştırma Makalesi
📍Kapsam:2016 Verileri
⚙️Değişkenler:Alan Parametreleri

Özet

Amaç: Giardia intestinalis flagellalı, Giardiyaz’a nedenolan bir protozoondur ve dünya çapında önemli bir sorundur. Moleküler yöntemlerle sekiz farklı genotipisaptanan G. intestinalis’de, A ve B genotipinin, insan vememelilerde hastalıklarla ilişkili olduğu ve farklı genotiplerin, farklı klinik tablolar meydana getirebildiği bildirilmektedir. Biz de bu bilgiler ışığında, giardiyaz tanısı almışve G. intestinalis pozitif saptanan dışkı örneklerinde bulunan G. intestinalis genotiplerinin dağılımını real-time PCRyöntemi ile belirlemeyi ve moleküler epidemiyolojik birveri sunmayı amaçladık.Gereç ve Yöntem: Ocak 2016-Ocak 2018 tarihleri arasında, hem nativ hem de lugol ile mikroskobik olarak incelenen dışkı örnekleri içinde G. intestinalis kist ve/veyatrofozoit’i pozitif bulunan 50 G. intestinalis pozitif hastanındışkı numuneleri çalışmaya dâhil edildi. Dışkı örneklerinden DNA izolasyonu gerçekleştirildikten sonra genotip Ave genotip B için spesifik primerler kullanılarak real-timePCR ile analiz edildi.Bulgular: Çalışmamıza dâhil edilen 50 giardiyaz tanılıhastanın dışkı örneklerinde, 28’inde (%56) A genotipi saptanırken, 17’sinde (%34) B genotipi, 5’inde (%10) ise hemA, hem de B genotipi bulundu. Cinsiyete göre saptanangenotipler incelendiğinde, erkeklerde ve kadınlarda sırasıyla 25 (%50) ve 25 (%50) olarak bulundu.Sonuç: Sonuç olarak, çalışmamız ile ülkemizde giardiyazaneden olan ama ayrımı yalnızca moleküler yöntemlerleortaya konabilen G. intestinalis genotipleri incelenerek, G. intestinalis’in A genotipinin, B genotipineoranla biraz daha fazla olduğu belirlendi. ÜlkemizdeG. intestinalis’in moleküler epidemiyolojisine yönelik veriler sınırlıdır. Bu çalışmanın buna katkı sağlayacağı düşüncesindeyiz.

Abstract

Objective: As a causative agent giardiasis, Giardia intestinalis is a flagellated protozoa, and it is a major problem worldwide. Eight different genotypes have been identified in G. intestinalis by molecular method. It has been reported that the genotypes A and B are related to diseases in human and mammals and different genotypes cause different clinical pictures. In this study, we aimed to determine the distribution of G. intestinalis genotypes in stool specimens of G. intestinalis positive patients by realtime PCR and to present a molecular epidemiological data. Material and Methods: Between January 2016 and January 2018, stool samples from fifty G. intestinalis cyst and / or trophozoite positive patients were included in the study. Native andlugol-treated stool specimens were microscopically examined. DNA isolation from stool specimens was performed and then analyzed by real-time PCR using specific primers for genotypes A and B. Results: In stool samples of fifty patients with diagnosis of giardiasis included in our study, genotype A (n=28: 56%), genotype B (n=17: 34%) and both genotype A and genotype B (n=5: 10%) were detected. These genotypes were found in 25 (50%) male, and 25 (50%) female patients. Conclusion: In conclusion, we investigated G. intestinalis genotypes which cause giardiasis in our country but these genotypes can only be distinguished by molecular methods. We found that G. intestinalis genotype A is slightly more frequent than genotype B. In our country, the data on the molecular epidemiology of G. intestinalis genotypes are very limited. We believe this work will contribute to this.

🔖

Bu Makaleye Atıf Yap

ACEL, D. P., DEMİRCİ, M., DEMİR, C., YİĞİN, A. (2022). Giardia intestinalis Genotiplerinin, Real-Time PCR Yöntemi ile Dışkı Örneklerinden Belirlenmesi. Türk Mikrobiyoloji Cemiyeti Dergisi, Cilt: 48 - Sayı: 3, 187–191. https://ajindex.com/articles/635857

📄 Tam Metin PDF Okuyucu

📄

PDF görüntüleyici hazırlanıyor...

Kaynakça (11)

  1. Lloyd D, Harris JC, Maroulis S, et al. The “primitive” microaerophile Giardia intestinalis (syn. lamblia, duodenalis) has specialized membranes with electron transport and membrane-potential-generating functions. Microbiology. 2002;148(5):1349-54.
  2. Vanni I, Cacciò SM, van Lith L, et al. Detection of Giardia duodenalis assemblages A and B in human feces by simple, assemblage-specific PCR assays. PLoS Negl Trop Dis. 2012;6(8):e1776.
  3. Thompson RC, Monis P. Giardia-from genome to proteome. Adv Parasitol. 2012;78:57-95.
  4. Helmy YA, Spierling NG, Schmidt S, et al. Occurrence and distribution of Giardia species in wild rodents in Germany. Parasit Vectors. 2018;11(1):213.
  5. Vurupalmaz Y, Öter V. Giardiasis tanılı hastaların dışkı örneklerinde TPI gen lokusu hedeflenerek G. intestinalis genotiplerinin PCR–RFLP yöntemiyle araştırılması. Kocatepe Tıp Derg. 2016;17(4):109-17.
  6. Guy RA, Xiao C, Horgen PA. Real-time PCR assay for detection and genotype differentiation of Giardia lamblia in stool specimens. J Clin Microbiol. 2004;42(7):3317-20.
  7. Van Lith L, Šoba B, Vizcaino VV, et al. A real-time assemblage-specific PCR assay for the detection of Giardia duodenalis assemblages A, B and E in fecal samples. Vet Parasitol. 2015;30;211(1-2):28-34.
  8. Kırkoyun Uysal H, Akgül O, Purisa S, Oner YA. İstanbul Üniversitesi Tıp Fakültesi’nde 25 yıllık intestinal parazit prevalansı: Retrospektif bir çalışma. Turkiye Parazitol Derg. 2014;38(2):97-101.
  9. Minetti C, Taweenan W, Hogg R, et al. Occurrence and diversity of Giardia duodenalis assemblages in livestock in the UK. Transbound Emerg Dis. 2014;61(6):e60-7.
  10. Jerez Puebla LE, Núñez FA, Santos LP, et al. Molecular analysis of Giardia duodenalis isolates from symptomatic and asymptomatic children from La Habana, Cuba. Parasite Epidemiol Control. 2017;24;2(3):105-13.
  11. Okyay P, Ertug S, Gultekin B, Onen O, Beser E. Intestinal parasites prevalence and related factors in school children, a western city sample-Turkey. BMC Public Health. 2004;4:64. https://doi.org/10.1186/1471-2458-4-64 12.