KaydedilenlerDerginizi ekleyin

Dergiler / Türk Biyokimya Dergisi / 2015 / Cilt: 40 - Sayı: 3

Characterization of three new plasmids from Lactobacillus paracasei 54

Lactobacillus paracasei 54 suşundan izole edilen üç yeni plazmidin karakterizasyonu

Qing GU
Yizhen ZHAO
Chen ZHANG
Han JİANG
Lei SHEN
Xuan ZHU
Sayfa
265–270
Yayın Tarihi
2022-11-05
DOI
—
🏛️Bu makalenin bibliyografik verileri ve tam metin bağlantısı DergiPark üzerinden sağlanmıştır.
DergiPark Kaydı ↗
✨

Yapay Zeka Hızlı Bakış & Çıkarımlar

AI Insight
⚡ TL;DR(1 Cümlede Hızlı Çıkarım)

Bulgular: Lactobacillus paracasei 54 suşundan 3 plazmid izole edilmiştir.

📌 3 Maddede Bu Makale

🎯
Amaç & Hipotez:Amaç: Sağlıklı bebek dışkılarından elde edilen Lactobacillus paracasei 54 suşunda üç yeni plazmid izole edilmiştir.
📊
Temel Bulgular & Veri:İzole edilen plazmidlerin sekanslaması Roche 454 Genome Sequencer FLX ile yapılmıştır.
💡
Sonuç & Katkı:Bulgular: Lactobacillus paracasei 54 suşundan 3 plazmid izole edilmiştir.
🔬Tür:Araştırma Makalesi
📍Kapsam:Genişletilmiş Akademik Örneklem
⚙️Değişkenler:Alan Parametreleri

Özet

Amaç: Sağlıklı bebek dışkılarından elde edilen Lactobacillus paracasei 54 suşunda üç yeni plazmid izole edilmiştir. Metod: Plazmidler AxyPrep Plasmid Miniprep Kiti kullanarak izole edilmiştir. İzole edilen plazmidlerin sekanslaması Roche 454 Genome Sequencer FLX ile yapılmıştır. Bulgular: Lactobacillus paracasei 54 suşundan 3 plazmid izole edilmiştir. Boyutları 9754, 6650 ve 1788 bç olan bu plazmidler pLP5401-03 olarak adlandırılmıştır. Sonuç: Plazmid pLP5401 ve pLP5402 nin teta-tipi bir mekanizma ile çalışması muhtemel replikasyon genleri olduğu tespit edilmiştir. Plazmid pLP5403 'nin ise kayan-dairesel replikasyon mekanizması ile replike olduğu düşünülmektedir. Bu tür bir mekanizma ile replike olan muhtemel bir plazmid gıda edistürisinde kullanılabilir.

Abstract

Objective: Three plasmids from Lactobacillus paracasei 54 were isolated from healthy newborn infant fecal samples.Methods: Plasmid was extracted using an AxyPrep Plasmid Miniprep Kit and lysozyme. The extracted plasmids were sequenced using a Roche 454 Genome Sequencer FLX.Results: Three plasmids were isolated from Lactobacillus paracasei 54. These plasmids are designated pLP5401-03, and they are 9754, 6650, and 1788 bp in size.Conclusion: Plasmids pLP5401 and pLP5402 were found to contain replication genes that are likely to function via the theta-type mechanism. Plasmid pLP5403 is predicted to replicate via the rolling-circle replication (RCR) mechanism. The RCR replication plasmid can be applied as a useful vector in the food industry.

🔖

Bu Makaleye Atıf Yap

GU, Q., ZHAO, Y., ZHANG, C., JİANG, H., SHEN, L., ZHU, X. (2022). Characterization of three new plasmids from Lactobacillus paracasei 54. Türk Biyokimya Dergisi, Cilt: 40 - Sayı: 3, 265–270. https://ajindex.com/articles/621154

📄 Tam Metin PDF Okuyucu

📄

PDF görüntüleyici hazırlanıyor...

Kaynakça (10)

  1. Kask s, Adamberg K, Orlowski A, Vogensen FK, Moller PL, et al. Physiological properties of Lactobacillus paracasei, L. danicus and L. curvatus strains isolated from Estonian semi-hard cheese. Food Res Int 2003; 36:1037-46.
  2. Hao Y, Zhao L, Zhang H, Zhai Z, Huang Y, et al. Identification of the bacterial biodiversity in koumiss by denaturing gradient gel electrophoresis and species-specific polymerase chain reaction. J Dairy sci 2010; 93(5):1926-33.
  3. Verdenelli MC, Ghelfi F, silvi s, Orpianesi C, Cecchini C, et al. Probiotic properties of Lactobacillus rhamnosus and Lactobacillus paracasei isolated from human faeces. Eur J Nutr 2009; 48(6):355-63.
  4. Wang s, Zhu H, He F, Luo Y, Kang Z, et al. Whole Genome sequence of the Probiotic strain Lactobacillus paracasei N1115, Isolated from Traditional Chinese Fermented Milk. Genome Announc 2014; 2(2). smokvina T, Wels M, Polka J, Chervaux C, Brisse s, et al. Lactobacillus paracasei comparative genomics: towards species pan-genome definition and exploitation of diversity. PLos One 2013; 8(7):e68731. Feld L, Bielak E, Hammer K, Wilcks A. Characterization of a small erythromycin resistance plasmid pLFE1 from the food-isolate Lactobacillus plantarum M345. Plasmid 2009; 61(3):159-70.
  5. Toh H, Oshima K, Nakano A, Takahata M, Murakami M, et al. Genomic adaptation of the Lactobacillus casei group. PLos One 2013; 8(10):e75073. Desmond C, Ross RP, Fitzgerald G, stanton C. sequence analysis of the plasmid genome of the probiotic strain Lactobacillus paracasei NFBC338 which includes the plasmids pCD01 and pCD02. Plasmid 2005; 54(2):160-75.
  6. Kojic M, Lozo J, Jovcic B, strahinic I, Fira D, et al. Construction of a new shuttle vector and its use for cloning and expression of two plasmid-encoded bacteriocins from Lactobacillus paracasei subsp. paracasei BGsJ2-8. Int J Food Microbiol 2010; 140(2-3):117-24.
  7. Kullen MJ, Klaenhammer TR. Genetic modification of intestinal lactobacilli and bifidobacteria. Curr Issues Mol Biol 2000; 2(2):41-50.
  8. Alpert CA, Crutz-Le Coq AM, Malleret C, Zagorec M. Charac- terization of a theta-type plasmid from Lactobacillus sakei: a potential basis for low-copy-number vectors in lactobacilli. Appl Environ Microbiol 2003; 69(9):5574-84.
  9. Zhu X, Zhao Y, sun Y, Gu Q. Purification and characterisation of plantaricin ZJ008, a novel bacteriocin against Staphylococcus spp. from Lactobacillus plantarum ZJ008. Food Chem 2014; 165:216-23.
  10. Anderson DG, McKay LL. simple and rapid method for isolating large plasmid DNA from lacti