Dergiler / Türk Biyokimya Dergisi / 2015 / Cilt: 40 - Sayı: 2

Screening and molecular characterization of polycyclic aromatic hydrocarbons degrading yeasts

[Polisiklik aromatik hidrokarbonları parçalayan mayaların taranması ve moleküler karakterizasyonu]

Sayfa
105–110
Yayın Tarihi
2022-11-05
DOI
—
🏛️Bu makalenin bibliyografik verileri ve tam metin bağlantısı DergiPark üzerinden sağlanmıştır.
DergiPark Kaydı ↗
✨

Yapay Zeka Hızlı Bakış & Çıkarımlar

AI Insight
⚡ TL;DR(1 Cümlede Hızlı Çıkarım)

Mayaların moleküler karakterizasyonu, ITS1-5.8S rRNA-ITS2 ve 26S rRNA bölgelerinin dizi analizi ile gerçekleştirilmiştir.Bulgular: Toplamda, dört farklı örnekten 100 maya izolatı elde edilmiştir.

📌 3 Maddede Bu Makale

🎯
Amaç & Hipotez:Amaç: Petrol endüstrisi ürünleri ile oluşturulan sızıntılar ve kazalar gibi felaketler, çevresel kirliliğe neden olan ana faktörlerdir.
📊
Temel Bulgular & Veri:Mayaların moleküler karakterizasyonu, ITS1-5.8S rRNA-ITS2 ve 26S rRNA bölgelerinin dizi analizi ile gerçekleştirilmiştir.Bulgular: Toplamda, dört farklı örnekten 100 maya izolatı elde edilmiştir.
💡
Sonuç & Katkı:Sonuç: Birden fazla polisiklik aromatik hidrokarbon bileşiğini parçalayan maya suşları, ileriki araştırmalarda kullanım potansiyeline sahiptir.
🔬Tür:Araştırma Makalesi
📍Kapsam:Genişletilmiş Akademik Örneklem
⚙️Değişkenler:Alan Parametreleri

Özet

Amaç: Petrol endüstrisi ürünleri ile oluşturulan sızıntılar ve kazalar gibi felaketler, çevresel kirliliğe neden olan ana faktörlerdir. Mevcut durumda, biyo-parçalama kapasitesine sahip ticari bir maya suşu bulunmamaktadır. Bu yüzden, geniş hidrokarbon parçalama aktivitesine sahip maya suşlarının saptanması, bu kirliliklerin azaltılmasında önemli bir rol oynamaktadır. Belirtilen bu sebeple, çalışmamızda, hidrokarbon parçalayan mayaların izolasyonu ve karakterizasyonu amaçlanmıştır.Metod: Çalışmada kullanılan maya izolatları, petrol rafinerisinden alınmış atık su, aktif çamur ve petrol örnekleri ve petrol ile kontamine olmuş toprak örneklerinden izole edilmiştir. Naftalen, fenantren, piren ve ham petrolün mayalar tarafından parçalanması, mikrotitre plaka yöntemi kullanılarak saptanmıştır. Mayaların moleküler karakterizasyonu, ITS1-5.8S rRNA-ITS2 ve 26S rRNA bölgelerinin dizi analizi ile gerçekleştirilmiştir.Bulgular: Toplamda, dört farklı örnekten 100 maya izolatı elde edilmiştir. Farklı polisiklik aromatik hidrokarbon bileşikleri (naftalen, fenantren, piren) ve ham petrol içeren ortamlarda inkübasyondan sonra, 12 maya izolatının birden fazla poliaromatik hidrokarbonu parçalayabildiği bulunmuştur. rRNA bölgelerinin dizi analizi, tanılanan mayaların 6 genusa dahil olan 10 türü temsil ettiklerini göstermiştir. İzolatlar, Candida parasilopsis, Candida sinolaborantium, Cryptococcus albidus, Cryptococcus diffluens, Cryptococcus uzbekistanensis, Pichia kudriavzevii, Rhodosporidium diobovatum, Rhodotorula glutinis, Rhodotorula muciloginosa ve Saccharomyces cerevisiae olarak tanılanmıştır. Sonuç: Birden fazla polisiklik aromatik hidrokarbon bileşiğini parçalayan maya suşları, ileriki araştırmalarda kullanım potansiyeline sahiptir.

Abstract

Objective: Disasters such as leakages and accidental falls are the main causes of environmental pollution by the petroleum industry product. Since no commercial yeast strain with biodegradation capacity is available, we aimed to isolate and characterize hydrocarbon degrading yeasts.Methods: Yeast isolates used in the study were isolated from samples of wastewater, active sludge and crude oil, which was obtained from a petroleum refinery as well as from soil samples, which were contaminated with crude oil. Yeast isolates used in the study were isolated from wastewater, active sludge and petroleum samples obtained from petroleum refinery and soil samples contaminated with petroleum. Degradation of naphthalene, phenanthrene, pyrene and crude petroleum by yeasts were determined using a microtiter plate-based method. Molecular characterization was achieved by performing a sequence analysis of the ITS1-5.8S rRNA-ITS2 and 26S rRNA regions.Results: In total, 100 yeast isolates were obtained from four different samples. Following the incubation in media containing different polycyclic aromatic hydrocarbon compounds (naphthalene, phenanthrene, pyrene) and crude petroleum, 12 yeast isolates were detected to degrade more than one polyaromatic hydrocarbon. Sequence analyses of rRNA regions revealed that the identified yeasts represented 10 species belonging to 6 genera. The isolates were identified as Candida parasilopsis, Candida sinolaborantium, Cryptococcus albidus, Cryptococcus diffluens, Cryptococcus uzbekistanensis, Pichia kudriavzevii, Rhodosporidium diobovatum, Rhodotorula glutinis, Rhodotorula muciloginosa and Saccharomyces cerevisiae.Conclusion: Yeast strains that are capable of degrading more than one polycyclic aromatic hydrocarbon compound have the potential of being utilized in future research.

🔖

Bu Makaleye Atıf Yap

ÇORBACI, C., YALÇIN, H. T., BOZ, D. T., UÇAR, F. B. (2022). Screening and molecular characterization of polycyclic aromatic hydrocarbons degrading yeasts. Türk Biyokimya Dergisi, Cilt: 40 - Sayı: 2, 105–110. https://ajindex.com/articles/621147

📄 Tam Metin PDF Okuyucu

📄

PDF görüntüleyici hazırlanıyor...

Kaynakça (13)

  1. Das N, Chandran P. Microbial degradation of petroleum hy- drocarbon contaminants: an overview. Biotechnol Res Int 2011; 2011:941810. Okah AI. Biodegradation alternative in the cleanup of petroleum hy- drocarbon pollutants. Biotechnol Mol Biol Rev 2006; 1(2): 38-50.
  2. Wrenn BA, Venosa AD. Selective enumeration of aromatic and ali- phatic hydrocarbon degrading bacteria by a most-probable-number procedure. Can J Microbiol 1996; 42(3):252-8.
  3. Juhasz AL, Naidu R. Bioremediation of high molecular weight polycyclic aromatic hydrocarbons: a review of the microbial degradation of benzo[a]pyrene. Int Biodeterior Biodegrad 2000; 45:57-88
  4. Parviz S, Abbas SS, Hossein CA. Biodegradation of polycyclic aromatic hydrocarbons by aerobic mixed bacterial culture isolated from hydrocarbon polluted soils. Iran J Chem Chem Eng 2006; 25(3):73-8.
  5. Miranda RC, Souza CS, Gomes EB, Lovaglio RB, Lopes CE, et al. Biodegradation of diesel oil by yeasts isolated from the vicinity of CAPITAL LETTER? suape port in the state of Pernambuco-Brazil. Braz Arch Biol Technol 2007; 50(1):147-52.
  6. Jacques RJ, Okeke BC, Bento FM, Teixeira AS, Peralba MC, et al. Microbial consortium bioaugmentation of a polycyclic aromatic hydrocarbons contaminated soil. Bioresour Technol 2008; 99(7):2637-43.
  7. Hesham AE, Alamri SA, Khan S, Mahmoud ME, Mahmoud HM. Isolation and molecular genetic characterization of a yeast strain able to degrade petroleum polycyclic aromatic hydrocarbons. Afr J Biotechnol 2009; 8(10):2218-23.
  8. Farag S, Soliman NA. Biodegradation of crude petroleum oil and environmental pollutants by Candida tropicalis strain. Braz Arch Biol Technol 2011; 54(4):821-30.
  9. Shumin Y, Na N, Zhaoyanga X, Jinglia T. Screening and identification of halotolerant yeast for hydrocarbon degrading and its properties studies. Afr J Microbiol Res 2012; 6(8):1819-28.
  10. Pan F, Yang Q, Zhang Y, Zhang S, Yang M. Biodegradation of polycyclic aromatic hydrocarbons by Pichia anomala. Biotechnol Lett 2004; 26(10):803-6.
  11. Hesham A, Wang Z, Zhang Y, Zhang J, Wenzhou L, et al. Isolation and identification of a yeast strain capable of degrading four and five ring aromatic hydrocarbons. Ann Microbiol 2006; 56:109-12. Atlas RM. Microbial degradation of petroleum hydrocarbons; an environmental perspective. Microbiol Rev 1981; 45(1):180-209.
  12. Chrzanowski L, Kaczorek E, Olszanowski A. The ability of Candida maltosa for hydrocarbon and emulsified hydrocarbon degradation. Pol J Environ Stud 2006; 15(1):47-51.
  13. Santos EC, Jacques RJ, Bento FM, Peral