Dergiler / Turkish Journal of Immunology / 2019 / Cilt: 7 - Sayı: 3

Enfeksiyon Hastalıklarına Karşı Geliştirilen Aşıların Geliştirilmesinde Kullanılan Gereç ve Veri Tabanlarının Derlemesi

A Review on Computational Tools and Databases for the Development of Vaccines Against Infectious Diseases

Sayfa
137–148
Yayın Tarihi
2022-11-05
DOI
—
🏛️Bu makalenin bibliyografik verileri ve tam metin bağlantısı DergiPark üzerinden sağlanmıştır.
DergiPark Kaydı ↗
✨

Yapay Zeka Hızlı Bakış & Çıkarımlar

AI Insight
⚡ TL;DR(1 Cümlede Hızlı Çıkarım)

Bu makale, aşı tasarımında yararlı olabilecek çevrimiçi kaynaklar, veri tabanı ve benzeri olanakların derlemesini içermektedir.

📌 3 Maddede Bu Makale

🎯
Amaç & Hipotez:Biyobilişim ve hesaplama teknolojilerinin moleküler biyolojinin farklı alanlarında yeni gelişen ve başarılı uygulamaları bu konuda yapılan çalışmalara ve araştırmacılara olumlu katkıda bulunmuştur.
📊
Temel Bulgular & Veri:Bilgisayarlara ve internet kaynaklarına hızlı bir şekilde ulaşabiliyor olmak biyoloji bilmi topluluğuna var olan bilgiyi genişletme ve bağışıklık bilimi ve aşı geliştirme konusundaki olanakları geliştirmiştir.
💡
Sonuç & Katkı:Bu makale, aşı tasarımında yararlı olabilecek çevrimiçi kaynaklar, veri tabanı ve benzeri olanakların derlemesini içermektedir.
🔬Tür:Literatür & Derleme Çalışması
📍Kapsam:Genişletilmiş Akademik Örneklem
⚙️Değişkenler:Alan Parametreleri

Özet

Biyobilişim ve hesaplama teknolojilerinin moleküler biyolojinin farklı alanlarında yeni gelişen ve başarılı uygulamaları bu konuda yapılan çalışmalara ve araştırmacılara olumlu katkıda bulunmuştur. Bilgisayarlara ve internet kaynaklarına hızlı bir şekilde ulaşabiliyor olmak biyoloji bilmi topluluğuna var olan bilgiyi genişletme ve bağışıklık bilimi ve aşı geliştirme konusundaki olanakları geliştirmiştir. Devasa moleküler düzey bilgi ve bir çok veritabanı bilimsel çalışmalara destek sağlayabilecek şekilde herkesin kullanımına sunulmaktadır. Bu makale, aşı tasarımında yararlı olabilecek çevrimiçi kaynaklar, veri tabanı ve benzeri olanakların derlemesini içermektedir.

Abstract

The emergence and successful implementation of bioinformatics and computational technology in the differentarea of molecular biology has a positive impact on the scientists and researchers. Fast accessibility of computer andinternet resources generated new possibilities to help the biological scientific community with the best of the previousknowledge to expand the possibilities in the area of immunology and vaccine designing. Many databases and tools withhuge molecular level information are freely available to utilize in the outgoing research work. Thus, the article providesinformation about online resources, database and tools which could be helpful in vaccine designing.

🔖

Bu Makaleye Atıf Yap

JAMAL, Q. M. S. (2022). Enfeksiyon Hastalıklarına Karşı Geliştirilen Aşıların Geliştirilmesinde Kullanılan Gereç ve Veri Tabanlarının Derlemesi. Turkish Journal of Immunology, Cilt: 7 - Sayı: 3, 137–148. https://ajindex.com/articles/607194

📄 Tam Metin PDF Okuyucu

📄

PDF görüntüleyici hazırlanıyor...

Kaynakça (15)

  1. Shapiro SZ. Clinical development of candidate HIV vaccines: different problems for different vaccines. AIDS Res Hum Retroviruses 2014
  2. 325–9. [CrossRef] 2. Vandegrift KJ, Sokolow SH, Daszak P, Kilpatrick AM. Ecology of avian influenza viruses in a changing world. Ann N Y Acad Sci 2010
  3. 113–28. [CrossRef] 3. Al-Jabri AA. Mechanisms of Host Resistance Against HIV Infection and Progression to AIDS. Sultan Qaboos Univ Med J 2007
  4. 82–96. 4. He Y, Racz R, Sayers S, Lin Y, Todd T, Hur J, et al. Updates on the web-based VIOLIN vaccine database and analysis system. Nucleic Acids Res 2014
  5. 42(Database issue):D1124–32. [CrossRef] 5. Dhanda SK, Vir P, Singla D, Gupta S, Kumar S, Raghava GPS. A Web-Based Platform for Designing Vaccines against Existing and Emerging Strains of Mycobacterium tuberculosis. PLoS ONE 2016
  6. e0153771. [CrossRef] 6. Harish N, Gupta R, Agarwal P, Scaria V, Pillai B. DyNAVacS. an integrative tool for optimized DNA vaccine design. Nucleic Acids Res 2006
  7. 34(Web Server issue):W264–6. [CrossRef] 7. Theiler J, Yoon H, Yusim K, Picker LJ, Fruh K, Korber B. Epigraph: A Vaccine Design Tool Applied to an HIV Therapeutic Vaccine and a Pan-Filovirus Vaccine. Sci Rep 2016
  8. 33987. [CrossRef] 8. Schubert B, Brachvogel HP, Jürges C, Kohlbacher O. EpiToolKit –a web-based workbench for vaccine design. Bioinformatics 2015
  9. 2211–3. [CrossRef] 9. He Y, Xiang Z, Mobley HL. Vaxign: the first web-based vaccine design program for reverse vaccinology and applications for vaccine development. J Biomed Biotechnol 2010
  10. 297505. [CrossRef] 10. Thurmond J, Yoon H, Kuiken C, Yusim K, Perkins S, Theiler J, et al. Web-based design and evaluation of T-cell vaccine candidates. Bioinformatics 2008
  11. 1639–40. [CrossRef] 11. Ye J, Ma N, Madden TL, Ostell JM. IgBLAST. an immunoglobulin variable domain sequence analysis tool. Nucleic Acids Res 2013
  12. 41(Web Server issue):W34–40. [CrossRef] 12. Toseland CP, Clayton DJ, McSparron H, Hemsley SL, Blythe MJ, Paine K, et al. AntiJen: a quantitative immunology database integrating functional, thermodynamic, kinetic, biophysical, and cellular data. Immunome Res 2005
  13. [CrossRef] 13. Ansari HR, Flower DR, Raghava GP. Antigen DB: an immunoinformatics database of pathogen antigens. Nucleic Acids Res 2010
  14. D847–53. [CrossRef] 14. Tickotsky N, Sagiv T, Prilusky J, Shifrut E, Friedman N. McPASTCR. a manually curated catalogue of pathology-associated T cell receptor sequences. Bioinformatics 2017
  15. 2924–9. [CrossRef] 15. Lefranc