Dergiler / Turkish Journal of Biology / 2012 / Cilt: 36 - Sayı: 3

Determination of genetic relationships among Velezia L. (Caryophyllaceae) species using RAPD markers

RAPD markörleri kullanılarak Velezia L. (Caryophyllaceae) türlerinin genetik akrabalıklarının belirlenmesi

Sayfa
293–302
Yayın Tarihi
2022-10-18
DOI
—
🏛️Bu makalenin bibliyografik verileri ve tam metin bağlantısı DergiPark üzerinden sağlanmıştır.
DergiPark Kaydı ↗
✨

Yapay Zeka Hızlı Bakış & Çıkarımlar

AI Insight
⚡ TL;DR(1 Cümlede Hızlı Çıkarım)

Ayrıca bu teknik gelecekteki çalışmalarda, özellikle tehlike altındaki Velezia türlerinin korunması için ön verileri sağlamada etkin olarak kullanılabilir.

📌 3 Maddede Bu Makale

🎯
Amaç & Hipotez:Bu çalışmada, RAPD (Random Amplified Polymorphic DNA) belirteçleri Türkiye’de yetişen Velezia L. türlerinin genetik akrabalık seviyelerini belirlemede kullanılmıştır. 14 RAPD primerinden, toplam 432 bant elde edilmiştir.
📊
Temel Bulgular & Veri:RAPD belirteçlerindeki polimorfizm oranı yüksek (% 98,6) ve her türü ayırt etmek için yeterlidir.
💡
Sonuç & Katkı:Ayrıca bu teknik gelecekteki çalışmalarda, özellikle tehlike altındaki Velezia türlerinin korunması için ön verileri sağlamada etkin olarak kullanılabilir.
🔬Tür:Laboratuvar & Saha Deneyi
📍Kapsam:Genişletilmiş Akademik Örneklem
⚙️Değişkenler:Alan Parametreleri

Özet

Bu çalışmada, RAPD (Random Amplified Polymorphic DNA) belirteçleri Türkiye’de yetişen Velezia L. türlerinin genetik akrabalık seviyelerini belirlemede kullanılmıştır. 14 RAPD primerinden, toplam 432 bant elde edilmiştir. RAPD belirteçlerindeki polimorfizm oranı yüksek (% 98,6) ve her türü ayırt etmek için yeterlidir. Paylaşılan ortak bant seviyesi türler arasındaki genetik benzerliği değerlendirmek ve UPGMA (unweighted pair group method with arithmetic mean) tabanlı bir dendrogram oluşturmak için kullanılmıştır. Türler arasındaki genetik akrabalıkların, morfolojik karakterlerin kullanımıyla elde edilen verilerle tamamen uyumlu olduğu bulunmuştur. Elde edilen sonuçlar RAPD tekniğinin Velezia türleri arasındaki genetik akrabalıkların belirlenmesinde olduğu kadar türlerin tanımlanmasında da başarıyla kullanılabileceğini göstermiştir. Ayrıca bu teknik gelecekteki çalışmalarda, özellikle tehlike altındaki Velezia türlerinin korunması için ön verileri sağlamada etkin olarak kullanılabilir.

Abstract

Random amplified polymorphic DNA (RAPD) markers were used to determine genetic relationships among Velezia L. species from Turkey. A total of 432 amplified bands were obtained using 14 RAPD primers. The polymorphism in RAPD markers was high (98.61%) and was sufficient to distinguish each species. The degree of band-sharing was used for evaluating the genetic similarity between species and for constructing a dendrogram by the unweighted pair group method with arithmetic mean (UPGMA). Genetic relationships among the species were found to be fully consistent with those obtained by the use of morphological characters. Data obtained from our study demonstrated that the RAPD technique could be successfully used for the determination of genetic relationships among Velezia species and for species identification. Furthermore, it can be efficiently employed in future studies to provide preliminary data for conservation of endangered Velezia species.

🔖

Bu Makaleye Atıf Yap

ERÖZ, İ. P., SÖZEN, E., ATAŞLAR, E., POYRAZ, İ. (2022). Determination of genetic relationships among Velezia L. (Caryophyllaceae) species using RAPD markers. Turkish Journal of Biology, Cilt: 36 - Sayı: 3, 293–302. https://ajindex.com/articles/600480

📄 Tam Metin PDF Okuyucu

📄

PDF görüntüleyici hazırlanıyor...

Kaynakça (17)

  1. Davis PH. Flora of Turkey and the East Aegean Islands. Edinburgh University Press. Edinburgh; 1967
  2. Poyraz İE. Revision of Genus Velezia L. (Caryophyllaceae) in Turkey, PhD, Eskişehir Osmangazi University Institute of Science, 2008
  3. Viccini LF, Souza da Costa DC, Machado MA et al. Genetic diversity among nine species of Lippia (Verbenaceae) based on RAPD markers. Plant Syst Evol 246: 1-8, 2004
  4. Ray T, Roy SC. Phylogenetic relationships between members of Amaranthaceae and Chenopodiaceae of Lower Gangetic Plains using RAPD and ISSR markers. Bangladesh J Bot 36: 21-28, 2007
  5. Bardakçı F. Random amplified polymorphic DNA (RAPD) markers. Turk J Biol 25: 185-196, 2001
  6. Williams JGK, Kubelik AR, Livak KJ et al. DNA polymorphisms amplifi ed by arbitrary primers are useful as genetic markers. Nucleic Acids Res 18: 6531-6535, 1990
  7. Hadrys H, Balick M, Schierwater B. Applications of random amplified polymorphic DNA (RAPD) in molecular ecology. Mol Ecol 1: 55-63, 1992
  8. Rieseberg LH. Homology among RAPD fragments in interspecifi c comparisons. Mol Ecol 5: 99-105, 1996
  9. Bachmann K. Nuclear DNA markers in plant biosystematic research. Opera Bot 132: 137-148, 1997
  10. Açık L, Ekici M, Çelebi A. Taxonomic relationships in Astragalus sections Hololeuce and Synochreati (Fabaceae): evidence from RAPD-PCR and SDS-PAGE of seed proteins. Ann Bot Fenn 41: 305-317, 2004
  11. Goh MWK, Kumar PP, Lim SH et al. Random amplified polymorphic DNA analysis of the moth orchids, Phalaenopsis (Epidendroideae: Orchidaceae). Euphytica 141: 11-22, 2005
  12. Mattagajasingh I, Mukherjeea AK, Dasa P. Genomic relations among 31 species of Mammillaria Haworth (Cactaceae) using random amplified polymorphic DNA. Z Naturforsch 61c: 583- 591, 2006
  13. Chaudhary LB, Rana TS, Narzary D et al. A new species of Astragalus L. (Leguminosae) from India based on morphological and molecular markers. Bot J Linn Soc 154: 27- 34, 2007
  14. Pendleton RL, Kitchen SG, Mudge J et al. Origin of the flax cultivar ‘Appar’ and its position within the Linum perene complex. Int J Plant Sci 169: 445-453, 2008
  15. Çelebi A, Açık L, Aytaç Z. Biosystematics studies among Ebenus L. species based on morphological, RAPD-PCR, and seed protein analyses in Turkey. Pak J Bot 41: 2477-2486, 2009
  16. Mahmood T, Muhammad S, Shinwari ZK. Molecular and morphological characterization of Caralluma species. Pak J Bot 42: 1163-1171, 2010
  17. Aliyev RT, Abbasov MA, Mammadow AC. Genetic identifi cation of diploid a