Dergiler / Tarım Bilimleri Dergisi / 2015 / Cilt: 21 - Sayı: 4

Characterization of Autochthonous Grapevine Cultivars (Vitis vinifera L.) from the Aegean Region of Turkey Using Simple Sequence Repeats (SSRs)

Ege Bölgesi Yerel Asma Çeşitlerinin (Vitis vinifera L.) Basit Tekrar Dizileri (SSRs) ile Karakterizasyonu

Sayfa
538–545
Yayın Tarihi
2022-10-17
DOI
—
🏛️Bu makalenin bibliyografik verileri ve tam metin bağlantısı DergiPark üzerinden sağlanmıştır.
DergiPark Kaydı ↗
✨

Yapay Zeka Hızlı Bakış & Çıkarımlar

AI Insight
⚡ TL;DR(1 Cümlede Hızlı Çıkarım)

İnek Memesi ve Ufak Dimrit çeşitlerinin birbirinin sinonimi olduğu tespit edilmiştir.

📌 3 Maddede Bu Makale

🎯
Amaç & Hipotez:Türkiye ̓nin Ege bölgesinde yetiştirilen otuz altı yerel asma çeşidi ile standart çeşitlerden Cabernet Sauvignon ve Merlot arasındaki genetik ilişkiler SSR markörleri kullanılarak belirlenmiştir.
📊
Temel Bulgular & Veri:Kullanılan 11 SSR primeri başarılı amplifikasyonlar vermiş ve toplam 37 polimorfik bant üretmiştir.
💡
Sonuç & Katkı:İnek Memesi ve Ufak Dimrit çeşitlerinin birbirinin sinonimi olduğu tespit edilmiştir.
🔬Tür:Araştırma Makalesi
📍Kapsam:Genişletilmiş Akademik Örneklem
⚙️Değişkenler:Alan Parametreleri

Özet

Türkiye ̓nin Ege bölgesinde yetiştirilen otuz altı yerel asma çeşidi ile standart çeşitlerden Cabernet Sauvignon ve Merlot arasındaki genetik ilişkiler SSR markörleri kullanılarak belirlenmiştir. Kullanılan 11 SSR primeri başarılı amplifikasyonlar vermiş ve toplam 37 polimorfik bant üretmiştir. Bant sayısı primer başına 2 ile 6 arasında ve polimorfik bant sayısı 2 ile 3.6 arasında değişmiştir. Genotipler arasındaki Dice genetik benzerlik katsayıları 0.296 ile 0.882 arasında değişim göstermiştir. UPGMA dendrogramında iki ana grup ortaya çıkmıştır. Birinci grup Sultan Dimriti, Veyis ve Güvercin Gözü çeşitlerinden oluşmuştur. Yerel çeşitlerin büyük kısmının yer aldığı ikinci grup çok sayıda alt gruptan oluşmuştur. Yerel asma çeşitleri ve referans çeşitler arasındaki genetik farklılıklar açıkça gözlenmiştir. En yüksek (0.96) genetik benzerliğin Siyah Razakı ve Parmak çeşitleri arasında olduğu belirlenmiştir. İnek Memesi ve Ufak Dimrit çeşitlerinin birbirinin sinonimi olduğu tespit edilmiştir. Ayrıca homonim çeşitlerin varlığı da ortaya çıkarılmıştır. Sonuçlar, SSR markörlerinin asma çeşitlerinin parmak izi ve genetik çeşitlilik çalışmalarında etkin bir araç olduğunu göstermektedir.

Abstract

Thirty-six autochthonous grapevine cultivars from the Aegean region of Turkey in addition to standard cultivars Cabernet Sauvignon and Merlot (Vitis vinifera L.) were fingerprinted using SSR markers to assess their genetic relationships. Eleven SSR primers produced successful amplifications and yielded 37 polymorphic bands. The number of bands per primer changed between 2 and 6 while the number of polymorphic bands was between 2 and 3.6. Dice genetic similarity coefficients ranged between 0.296 and 0.882 among the genotypes. The UPGMA dendrogram showed two main groups. The first group was composed of Sultan Dimriti, Veyis and Güvercin Gözü cultivars. A large number of sub-groups were placed in the second group which included the majority of autochthonous cultivars. The genetic differences among the autochthonous cultivars and reference cultivars were clearly observed. The results showed that cultivars Siyah Razakı and Parmak (0.96) were the most similar ones. Synonyms were identified for İnek Memesi and Ufak Dimrit cultivars. In addition, homonymous cultivars were detected. SSR markers have proved to be an efficient tool for fingerprinting grapevine cultivars and conducting genetic diversity studies.

🔖

Bu Makaleye Atıf Yap

DİLLİ, Y., İŞÇİ, B. (2022). Characterization of Autochthonous Grapevine Cultivars (Vitis vinifera L.) from the Aegean Region of Turkey Using Simple Sequence Repeats (SSRs). Tarım Bilimleri Dergisi, Cilt: 21 - Sayı: 4, 538–545. https://ajindex.com/articles/595014

📄 Tam Metin PDF Okuyucu

📄

PDF görüntüleyici hazırlanıyor...

Kaynakça (7)

  1. Alleweldt G & Possingham J V (1988). Progress in grapevine breeding. Theoretical and Applied Genetics 75: 669−673 Bowers J E, Dangl G S, Vignani R & Meredith C P (1996). Isolation and characterization of new polymorphic simple sequence repeat loci in grape (Vitis vinifera L.). Genome 39: 628-633
  2. Bowers J E, Dangl G S & Meredith C P (1999). Development and characterization of additional microsatellite DNA markers for grape. American Journal of Enology and Viticulture 50(30): 243−246 Brown S M & Kresovich S (1996). Molecular characterization for plant genetic resource conservation. In: Paterson AH, ed. Genome mapping in plants. Austin, Texas: R.G. Landes Company, 85-9
  3. Costantini L, Monaco A, Vouillamoz J F, Forlani M & Grando M S (2005). Genetic relationships among homonymous Vitis vinifera cultivars from Campania (Italy). Vitis 44: 25-34
  4. De Mattia F, Lovicu G, Tardaguila J, Grassi F, Imazio S, Scienza A & Labra M (2009). Genetic relationships between Sardinian and Spanish viticulture: the case of ‘Cannonau’ and ‘Garnacha’. The Journal of Horticultural Science & Biotechnology 84: 65-71
  5. Dilli Y (2008). Characterization of some important grape varieties, types and clones in the Aegean region by using icrosatellite (SSR) markers. PhD Thesis, Ege University, İzmir, 112 p (In Turkish) Ergül A, Kazan K, Aras S, Çevik V, Çelik H & Söylemezoğlu G (2006). AFLP analysis of genetic variation within the two economically important Anatolian grapevine (Vitis vinifera L.) varietal groups. Genome 49: 467−475 GENRES (2014). Information System Genetic Resources. http://www.genres.de/vitis/ (2013) (Erişim tarihi: 1.05.2014)
  6. Hizarci Y, Ercişli S, Yüksel C & Ergül A (2012). Genetic characterization and relatedness among autochthonous grapevine cultivars from Northeast Turkey by Simple Sequence Repeats (SSR). Journal of Applied Botany and Food Quality 85: 224−228 Karataş H, Değirmenci D, Velasco R, Vezzulli S, Bodur Ç & Ağaoğlu Y S (2007). Microsatellite fingerprinting of homonymous grapevine (Vitis vinifera L) varieties in neighboring regions of South-East Turkey. Scientia Horticulturae 114: 164–169
  7. Leao P C S, Riaz S, Graziani R, Dangl G S & Motoike S Y (2009). Characterization of a Brazilian grape germplasm collection using microsatellite markers. American Journal of Enology and Viticulture 60: 517−524 Lodhi M A, Ye G N, Weeden N F & Reisch B I (1994). A simple and efficient method for DNA extraction from grapevine cultrivars and Vitis species. The Journal of Plant Molecular B