KaydedilenlerDerginizi ekleyin

Dergiler / Kafkas Üniversitesi Veteriner Fakültesi Dergisi / 2018 / Cilt: 24 - Sayı: 6

Çin’de Yaban Domuzunda (Sus scrofa) Astrovirusların Tanımlanması ve Genetik Karakterizasyonu

Identification and Genetic Characterization of Astrovirus in Wild Boar (Sus scrofa) in China

Min ZHANG
Yu YE
Qiong WU
Fan-fan ZHANG
Yu-xin TANG
Nannan GUO
Dan LEI
Dong-yan HUANG
De-ping SONG
Hao LI
Sayfa
899–903
Yayın Tarihi
2022-10-18
DOI
—
🏛️Bu makalenin bibliyografik verileri ve tam metin bağlantısı DergiPark üzerinden sağlanmıştır.
DergiPark Kaydı ↗
✨

Yapay Zeka Hızlı Bakış & Çıkarımlar

AI Insight
⚡ TL;DR(1 Cümlede Hızlı Çıkarım)

Filogenetik analiz WBAstV/CH/2015’in WBAstV-1/2011/HUN ile yakın akraba olduğunu ve PAstV 4 topluluğuna yakın olarak yer aldığını göstermiştir..

📌 3 Maddede Bu Makale

🎯
Amaç & Hipotez:Domuz astrovirusu (PAstV) dünya çapında ishalli domuzlarda en sıklıkla belirlenen bir virustur.
📊
Temel Bulgular & Veri:Astrovirus WBAstV/CH/2015’un tüm genom sekansı amplifiye edildi ve belirlendi.
💡
Sonuç & Katkı:Filogenetik analiz WBAstV/CH/2015’in WBAstV-1/2011/HUN ile yakın akraba olduğunu ve PAstV 4 topluluğuna yakın olarak yer aldığını göstermiştir..
🔬Tür:Araştırma Makalesi
📍Kapsam:2015 Verileri
⚙️Değişkenler:Alan Parametreleri

Özet

Domuz astrovirusu (PAstV) dünya çapında ishalli domuzlarda en sıklıkla belirlenen bir virustur. Bu çalışmada, Çin’in Jiangxi eyaletinde yaban domuzunda (Sus scrofa) astrovirusun ilk tespiti ve tüm genom sekans analizi gerçekleştirilmiştir. Astrovirus WBAstV/CH/2015’un tüm genom sekansı amplifiye edildi ve belirlendi. Sekans homoloji analizi, WBAstV/CH/2015’in dünye çapında PAstVları ile %40.8 ile %79.7 arasında benzerliğe sahip olduğunu ve Macaristan’da tespit edilen diğer bir yaban domuzu astrovirus (WBAstV) suşu olan WBAstV-1/2011/HUN ile en yüksek benzerliğe (%79.7) sahip olduğunu gösterdi. Filogenetik analiz WBAstV/CH/2015’in WBAstV-1/2011/HUN ile yakın akraba olduğunu ve PAstV 4 topluluğuna yakın olarak yer aldığını göstermiştir..

Abstract

Porcine astrovirus (PAstV) is a frequently detected virus in pigs suffering from diarrhea worldwide. Here, we report the first identificationand complete genome sequence of astrovirus in wild boar (Sus scrofa) in Jiangxi, China. The complete genome sequence of a representativeastrovirus, WBAstV/CH/2015, was amplified and determined. Sequence homology analysis showed that WBAstV/CH/2015 had 40.8%to 79.7% homology with PAstVs worlwide, and shared the highest homology (79.7%) with another wild boar astrovirus (WBAstV) strainWBAstV-1/2011/HUN from Hungary. Phylogenetic analysis showed that WBAstV/CH/2015 was closely related to WBAstV-1/2011/HUN andlocated in the cluster of PAstV 4.

🔖

Bu Makaleye Atıf Yap

ZHANG, M., YE, Y., WU, Q., ZHANG, F., TANG, Y., GUO, N., LEI, D., HUANG, D., SONG, D., LI, H. (2022). Çin’de Yaban Domuzunda (Sus scrofa) Astrovirusların Tanımlanması ve Genetik Karakterizasyonu. Kafkas Üniversitesi Veteriner Fakültesi Dergisi, Cilt: 24 - Sayı: 6, 899–903. https://ajindex.com/articles/569924

📄 Tam Metin PDF Okuyucu

📄

PDF görüntüleyici hazırlanıyor...

Kaynakça (8)

  1. Dennehy PH, Nelson SM, Spangenberger S, Noel JS, Monroe SS, Glass RI: A prospective case-control study of the role of astrovirus in acute diarrhea among hospitalized young children. J Infect Dis, 184 (1): 10-15, 2001. DOI: 10.1086/321007 Padmanabhan A, Hause BM: Detection and characterization of a novel genotype of porcine astrovirus 4 from nasal swabs from pigs with acute respiratory disease. Arch Virol, 161 (9): 2575-2579, 2016. DOI: 10.1007/s00705-016-2937-1
  2. Shan T, Li L, Simmonds P, Wang C, Moeser A, Delwart E: The fecal virome of pigs on a high-density farm. J Virol, 85 (22): 11697-11708, 2011. DOI: 10.1128/JVI.05217-11
  3. Luo Z, Roi S, Dastor M, Gallice E, Laurin MA, L’Homme Y: Multiple novel and prevalent astroviruses in pigs. Vet Microbiol, 149, 316-323, 2011. DOI: 10.1016/j.vetmic.2010.11.026 Cai Y, Yin W, Zhou Y, Li B, Ai L, Pan M, Guo W: Molecular detection of Porcine astrovirus in Sichuan Province, China. Virol J, 13:6, 2016. DOI: 10.1186/S12985-015-0462-6
  4. Shan T, Li L, Simmonds P, Wang C, Moeser A, Delwart E: The fecal virome of pigs on a high-density farm. J Virol, 85 (22): 11697-11708, 2011. DOI: 10.1128/JVI.05217-11
  5. Xiao CT, Luo Z, Lv SL, Opriessnig T, Li RC, Yu XL: Identification and characterization of multiple porcine astrovirus genotypes in Hunan province, China. Arch Virol, 162 (4): 943-952, 2016. DOI: 10.1007/s00705- 016-3185-0
  6. Song D, Huang D, Peng Q, Huang T, Chen Y, Zhang T, Nie X, He H, Wang P, Liu Q, Tang Y: Molecular characterization and phylogenetic analysis of porcine epidemic diarrhea viruses associated with outbreaks of severe diarrhea in piglets in Jiangxi, China 2013. PLoS One, 10 (3):e0120310, 2015. DOI: 10.1371/journal.pone.0120310 Zhang F, Ye Y, Song D, Guo N, Peng Q, Li A, Zhou X, Chen Y, Zhang M, Huang D, Tang Y: A simple and rapid identification method for newly emerged porcine Deltacoronavirus with loop-mediated isothermal amplification. Biol Res, 50:30, 2015. DOI: 10.1186/s40659-017-0135-6
  7. Li JS, Li MZ, Zheng LS, Liu N, Li DD, Duan ZJ: Identification and genetic characterization of two porcine astroviruses from domestic piglets in China. Arch Virol, 160 (12): 3079-3084, 2015. DOI: 10.1007/ s00705-015-2569-x Cai Y, Yin W, Zhou Y, Li B, Ai L, Pan M, Guo W: Molecular detection of Porcine astrovirus in Sichuan Province, China. Virol J, 13:6, 2016. DOI: 10.1186/s12985-015-0462-6
  8. Machnowska P, Ellerbroek L, Johne R: Detection and characterization of potentially zoonotic viruses in faeces of pigs at slaughter in Germany. Vet