Dergiler / İnfeksiyon Dergisi / 2005 / Cilt: 19 - Sayı: 1

Hepatit C virüs -RNA (HCV-RNA) kantitasyonunda Cobas amplicor HCV monitör test v2.0 ile realart HCV RG RT PCR testinin karşılaştırılması

Comparison of Cobas amplicor hepatitis C virus-RNA (HCV-RNA) v2.0 with realart HCV RG RT PCR in quantitation of HCV RNA

Sayfa
1–4
Yayın Tarihi
2022-10-17
DOI
—
🏛️Bu makalenin bibliyografik verileri ve tam metin bağlantısı DergiPark üzerinden sağlanmıştır.
DergiPark Kaydı ↗
✨

Yapay Zeka Hızlı Bakış & Çıkarımlar

AI Insight
⚡ TL;DR(1 Cümlede Hızlı Çıkarım)

Ancak iki test arasında kantitasyonda bir korelasyon olmadığı gözlenmiş bu da hasta izleminde farklı testlerden elde edilen sonuçların birbirine çevrilmesinin uygun olmadığını göstermiştir.

📌 3 Maddede Bu Makale

🎯
Amaç & Hipotez:Bu çalışmada Cobas Ampiicor HCV Monitor (Roche Diagnostics, ABD) ile Real Art HCV RG PCR testinin (Artus GmbH, Almanya) HCV kantitasyonundaki performanslarının karşılaştırılması amaçlandı.
📊
Temel Bulgular & Veri:Çalışmaya HCV RNA kantitasyonu amacı ile laboratuara gönderilen kronik HCV infeksiyonlu 70 hastaya ait kan örneği alındı.
💡
Sonuç & Katkı:Ancak iki test arasında kantitasyonda bir korelasyon olmadığı gözlenmiş bu da hasta izleminde farklı testlerden elde edilen sonuçların birbirine çevrilmesinin uygun olmadığını göstermiştir.
🔬Tür:Araştırma Makalesi
📍Kapsam:70 hasta
⚙️Değişkenler:Alan Parametreleri

Özet

Bu çalışmada Cobas Ampiicor HCV Monitor (Roche Diagnostics, ABD) ile Real Art HCV RG PCR testinin (Artus GmbH, Almanya) HCV kantitasyonundaki performanslarının karşılaştırılması amaçlandı. Çalışmaya HCV RNA kantitasyonu amacı ile laboratuara gönderilen kronik HCV infeksiyonlu 70 hastaya ait kan örneği alındı. Örnekler iki farklı yöntem ile incelendi ve sonuçlar karşılaştırıldı. Real Art HCV testinin tekrarlanabilirliğinin değerlendirilmesi amacı ile altı örnek farklı testlerde, altı örnek aynı test içerisinde çift çalışıldı, iki örneğin 1/10, 1/100, 1/1000 ve 1/10000 sulandırımları hazırlanarak kantitasyonu yapıldı. Cobas Ampiicor ile 21 örnek, RealArt HCV RG PCR ile 35 örnek 500.000 lU/ml altında bulundu. Negatif değerler çıkartılarak yapılan Spearman korelasyon testinde iki sistem sonuçları arasında korelasyon olmadığı gözlendi (korelasyon katsayısı:0.309). Cobas Ampiicor ile 500.000 lU/ml altında bulunan değerler ile RealArt HCV RG RT PCR testindeki değerler karşılaştırıldığında logaritmik farkın 0.1 ile 1.3 (median 0.7, ortalama 0.7) arasında değiştiği gözlendi. RealArt HCV RG RT PCR yönteminde aynı test içindeki logaritmik fark 0.01 ile 0.07 arasında ve farklı testlerde çalışılan aynı örneklerde ise logaritmik fark 0.04 ile 0.3 arasında saptandı. Wilcoxon testi ile bu örneklerin sonuçları arasında anlamlı bir fark olmadığı saptandı (z=0.178, p=0.859). Yapılan sulandırım çalışmalarında, viral yükteki azalmanın doğrusallık gösterdiği gözlendi. Sonuçlar, RealArt HCV testinin tekrarlanılabilirliği yüksek ve kantitasyona uygun bir yöntem olduğunu göstermiştir. Ancak iki test arasında kantitasyonda bir korelasyon olmadığı gözlenmiş bu da hasta izleminde farklı testlerden elde edilen sonuçların birbirine çevrilmesinin uygun olmadığını göstermiştir.

Abstract

The aim of the study is to compare the performance of Cobas Ampiicor HCV RNA v2.0 (Roche Diagnostics, ABD) with Real Art HCV RG RT PCR (Artus GmbH, Germany) in quantitation of HCV RNA. 70 serum samples of patients with chronic hepatitis C that were admitted to the laboratory for HCV RNA quantitation were included in the study. Samples were tested by two different methods and the results were compared. To assess the reproducibiiity of the test, 6 serum samples were tested in different runs and another six samples in the same run in duplicate. 1/10,1/100,1/1000 and 1/10000 dilutions of serum samples were also quantitated. Twenty-one samples with Cobas Ampiicor and 35 samples with rotorgene were below the level of 500.000 lU/ml. Spearmen correlation'test showed no correlation between the two assays when negative samples were excluded (correlation coefficient= 0.309). The logarithmic difference between the Cobas Ampiicor System and HBV Monitor Realart HCV PCR test ranged between 0.1 and 1.3 (median 0.7, mean 0.7). For the same samples tested in different runs and in the same run logarithmic differences were 0.04,0.3 and 0.01,0.07 respectively. Difference between these results was not significant by Wilcoxon test (z=0.178, p=0.859). In diluted samples regresion in viral load was linear. RealArt HCV RG RT PCR is a reproducible assay with a wide dynamic range of HCV RNA quantitation. Because of the lack of correlation between two assays it is not appropriate to convert the test results of different methods for follow up a patient.

🔖

Bu Makaleye Atıf Yap

ŞAHİN, H., SERTÖZ, Y. R., ERENSOY, S., ZEYTİNOĞLU, A., ALTUĞLU, İ. (2022). Hepatit C virüs -RNA (HCV-RNA) kantitasyonunda Cobas amplicor HCV monitör test v2.0 ile realart HCV RG RT PCR testinin karşılaştırılması. İnfeksiyon Dergisi, Cilt: 19 - Sayı: 1, 1–4. https://ajindex.com/articles/546497

📄 Tam Metin PDF Okuyucu

📄

PDF görüntüleyici hazırlanıyor...

Kaynakça (13)

  1. Choo QL, Kuo G, Weiner AJ, Overby LR, Bradley DW, Houghton M. Isolation of CDNA clone derived from a blood borne non-A, non-B viral hepatitis genome. Science 1989; 244: 359-62
  2. Freeman AJ, Dore GJ, Law MG, et al. Estimating progression to cirrhosis in chronic hepatitis C virus infection. Hepatology 2001; 34: 809-16
  3. NIH Consensus Statement on Management of Hepatitis C. NIH Consensus State Science Statements. 2002 June; 19: 1-46
  4. Pawlowsky JM. Use and interpretation of Virological tests for hepatitis C. Hepatology 2002; 36: S65-73
  5. Beld M, Sentjens R, Rebers S, et al. Performance of the New Bayer VERSANT HCV RNA 3.0 assay for quantitation of hepatitis C virus RNA in plasma and serum:conversion to international units and comparison with the Roche COBAS Amplicor HCV Monitor version 2.0 assay. J Clin Microbiol 2002; 40: 788-93
  6. Kleiber J, Walter T, Haberhausen G, Tsang S, Babiel R, Rosenstraus M. Performance characteristics of a quantitative, homogenous TaqMan RT-PCR test forHCV RNA. J Mol Diag 2002; 2: 158-66
  7. White PA, Pan Y, Freeman AJ, et al. Quantification of hepatitis C virus in human liver and serum samples by using Lightcycler reverse transcriptase PCR. J Clin Microbiol 2002; 40: 4346-8
  8. Kawai S, Yokosuko O, Kanda TJ, Mazeki F, Maru Y, Saisho H. Quantification of hepatitis C virus by Taqman PCR: Comparison with HCV Amplicor Monitor Assay. J Med Virol 1999; 58: 121-6
  9. Arens M. Quantitation of HCV RNA with the microwell plate and COBAS Amplicor HCV Monitor assays. J Clin Virol 2003; 27: 235-41
  10. Pawlotsky JM. Use and interpretation of hepatitis C virus diagnostic assays. Clin Liver Dis 2003; 7: 127-35
  11. Puig M, Mihail K, Yu MY, Feinstone SM, Major ME. Sensitivity and reproducibility of HCV quantitation in chimpanzee sera using Taqman realtime PCR Assay. J Virol Methods 2002; 105: 253-63
  12. Sandrine C, Descamps V, Thibault V, et al. J Clin Virol 2004 (basım aşamasında)
  13. Lee SC, Antony A, Lee N, et al. Improved version 2.0 qualitative and quantitative AMPLICOR reverse transcription-PCR tests for hepatitis C virus RNA: Calibration to international units, enhanced genotype reactivity, performance characteristics. J Clin Microbiol 2000; 38: 4171-9.