Dergiler / İnfeksiyon Dergisi / 2006 / Cilt: 20 - Sayı: 1

Klinik örneklerden kültür ile saptanan Mycobacterium tuberculosis kompleks kökenlerinin otomatize PCR yöntemiyle araştırılması

Automatized PCR evaluation of Mycobacterium tuberculosis complex isolates recovered from clinical specimens with culture

Sayfa
1–6
Yayın Tarihi
2022-10-17
DOI
—
🏛️Bu makalenin bibliyografik verileri ve tam metin bağlantısı DergiPark üzerinden sağlanmıştır.
DergiPark Kaydı ↗
✨

Yapay Zeka Hızlı Bakış & Çıkarımlar

AI Insight
⚡ TL;DR(1 Cümlede Hızlı Çıkarım)

Sonuç olarak, klinik örneklerden M. tuberculosis kompleks kökenlerinin saptanmasında kısa sürede tanıya gidilebilmesine rağmen, COBAS AMPLICOR MTB PCR yönteminin kültür yöntemlerine oranla daha az duyarlı olduğu, bu nedenle klinik tanıda sonuçların kültür yöntemleriyle birlikte değerlendirilmesi gerektiği kanısına varılmıştır.

📌 3 Maddede Bu Makale

🎯
Amaç & Hipotez:Bu çalışmada çeşitli klinik örneklerinden kültür yöntemleri ile tanınan Mycobacterium tuberculosis kompleks kökenlerinin, otomatize bir polimeraz zincir reaksiyonu (PCR) yöntemiyle araştırılması amaçlanmıştır.
📊
Temel Bulgular & Veri:Laboratuvara tüberküloz öntanısı ile gönderilen örneklerinin standart NaOH-NALC yöntemiyle dekontaminasyon ve homojenizasyonları yapıldıktan sonra, gliserinli Löwenstein-Jensen besiyerine ve Middlebrook 7H12 sıvı besiyeri içeren BACTEC B12 şişelerine ekimleri yapılmıştır.
💡
Sonuç & Katkı:Sonuç olarak, klinik örneklerden M. tuberculosis kompleks kökenlerinin saptanmasında kısa sürede tanıya gidilebilmesine rağmen, COBAS AMPLICOR MTB PCR yönteminin kültür yöntemlerine oranla daha az duyarlı olduğu, bu nedenle klinik tanıda sonuçların kültür yöntemleriyle birlikte değerlendirilmesi gerektiği kanısına varılmıştır.
🔬Tür:Deneysel Tarla Denemesi
📍Kapsam:41 örnek
⚙️Değişkenler:Alan Parametreleri

Özet

Bu çalışmada çeşitli klinik örneklerinden kültür yöntemleri ile tanınan Mycobacterium tuberculosis kompleks kökenlerinin, otomatize bir polimeraz zincir reaksiyonu (PCR) yöntemiyle araştırılması amaçlanmıştır. Laboratuvara tüberküloz öntanısı ile gönderilen örneklerinin standart NaOH-NALC yöntemiyle dekontaminasyon ve homojenizasyonları yapıldıktan sonra, gliserinli Löwenstein-Jensen besiyerine ve Middlebrook 7H12 sıvı besiyeri içeren BACTEC B12 şişelerine ekimleri yapılmıştır. Löwenstein-Jensen besiyerinde tipik kolonilerin ürediği gözlenen 41 örnek ile radyometrik BACTEC sisteminde (Becton Dickinson Diagnostic Instruments Systems, Cockeysville, MD, ABD) M. tuberculosis kompleks olarak tanımlanan 127 örnek çalışma grubunu oluşturmuştur. Aynı süreçte gelen ve kültürde üreme saptanmayan 46 örnek ise kontrol grubu olarak çalışmaya alınmıştır. COBAS AMPLICOR MTB PCR (Roche Diagnostic Systems, Inc., Branchburg, NJ, ABD) yöntemiyle, Löwenstein-Jensen besiyerinde üreme saptanan örneklerin 32'sinde (%78.1), BACTEC sisteminde üreme sergileyen örneklerin ise 86'sında (%67.8) pozitiflik saptanmıştır. Kültürde üreme saptanmayan 46 örneğin tümünde (%100) moleküler yöntemle sonuçlar negatif olarak bulunmuştur. Sonuç olarak, klinik örneklerden M. tuberculosis kompleks kökenlerinin saptanmasında kısa sürede tanıya gidilebilmesine rağmen, COBAS AMPLICOR MTB PCR yönteminin kültür yöntemlerine oranla daha az duyarlı olduğu, bu nedenle klinik tanıda sonuçların kültür yöntemleriyle birlikte değerlendirilmesi gerektiği kanısına varılmıştır.

Abstract

The purpose of this study was to evaluate Mycobacterium tuberculosis complex isolates recovered from clinical specimens with culture methods with an automatized polymerase chain reaction (PCR) method. Specimens sent to the mycobacteriology laboratory were decontaminated and concentrated with the standard NaOH-NALC method and then cultured on Löwenstein-Jensen solid medium and BACTEC B12 vials containing Middlebrook 7H12 broth. Fourty-one specimens with typical colonies on Löwenstein-Jensen medium and 127 specimens identified as M. tuberculosis complex in radiometric BACTEC system (Becton Dickinson Diagnostic Instruments Systems, Cockeysville, MD, USA) were marked as the study group. As control group 46 specimens without growth on either culture media were selected. The results of 32 (78.1%) specimens grown on Löwenstein-Jensen media were positive with COBAS AMPLICOR MTB PCR (Roche Diagnostic Systems, Inc., Branchburg, NJ, USA) method whereas 86 (67.8%) of specimens identified in BACTEC system were positive with COBAS AMPLICOR MTB PCR method. All (100%) culture negative specimens within the control group were also negative with COBAS AMPLICOR MTB PCR method. It is concluded that although it is a rapid method in the identification of M. tuberculosis complex isolates from clinical specimens, COBAS AMPLICOR MTB PCR method is less sensitive than culture and that it can only be used together with the culture technique.

🔖

Bu Makaleye Atıf Yap

BAYRAM, A., KARSLIGİL, T., BALCI, İ., ÇELİKSÖZ, C. (2022). Klinik örneklerden kültür ile saptanan Mycobacterium tuberculosis kompleks kökenlerinin otomatize PCR yöntemiyle araştırılması. İnfeksiyon Dergisi, Cilt: 20 - Sayı: 1, 1–6. https://ajindex.com/articles/546433

📄 Tam Metin PDF Okuyucu

📄

PDF görüntüleyici hazırlanıyor...

Kaynakça (13)

  1. Comstock GW. Epidemiology of tuberculosis. In: Reichman LB, Hershfield ES, eds. Tuberculosis, A Comprehensive International Approach. ed. New York: Marcel Dekker, 2000: 129-56
  2. Ninet B, Rohner P, Metral C, Auckenthaler R. Assessment of use of the COBAS AMPLICOR system with BACTEC 12B cultures for rapid detection of frequently identified mycobacteria. J Clin Microbiol 1999; 37: 782-84
  3. D'amato RF, Wallman AA, Hochstein LH, et al. Rapid diagnosis of pulmonary tuberculosis by using Roche AMPLICOR Mycobactehum tuberculosis PCR test. J Clin Microbiol 1995; 33:1832-4
  4. Esen N. Mikobakterilerin tanısında, tanımlanmasında ve ilaç direncinin belirlenmesinde kullanılan moleküller yöntemler. Infek Derg 2003; 17: 507-11
  5. Nolte FS, Metchock B. Mycobactehum. In: Murray PR, Baron EJ, Pfaller MA, Tenover FC, Yolken RH, eds. Manual of Clinical Microbiology. 6th ed. Washington, DC: American Society for Microbiology, 1995: 400-37
  6. Siddiqi SH. Procedure for primary isolation of mycobacteria from clinical specimens. In: BACTEC TB System Product and Procedure Manual. Maryland: Becton Dickinson, 1989: II.1-11.13
  7. Anonymous. COBAS AMPLICOR forMTB. Method Manual. Branchbug, NJ: Roche Diagnostic Systems, 1995
  8. Scarparo C, Piccoli P, Rigon A, Ruggiero G, Scagnelli M, Piersimoni C. Comparison of enhanced Mycobacterium tuberculosis amplified direct test with COBAS AMPLICOR Mycobacterium tuberculosis assay for direct detection of Mycobacterium tuberculosis complex in respiratory and extrapulmonary specimens. J Clin Microbiol 2000; 38:1559-62
  9. Özdamar K. Paket Programlar ile İstatistiksel Veri Analizi. 4. baskı. Eskişehir: Kaan Kitabevi, 2002: 510
  10. Dalovisio JR, Montenegro-James S, Kemmerly SA, et al. Comparison of the amplified Mycobacterium tuberculosis (MTB) direct test, Amplicor MTB PCR, and IS6110-PCR for detection of MTB in respiratory specimens. Clin Infect Dis 1996; 23: 1099-106
  11. Ichiyama S, linuma Y, Tawada Y, et al. Evaluation of Gen-Probe amplified Mycobacterium tuberculosis direct test and Roche PCR-microwell plate hybridization method (AMPLICOR MYCOBACTERIUM) for direct detection of mycobacteria. J Clin Microbiol 1996; 34: 130-3
  12. Vuorinen P, Miettinen A, Vuento R, Hâllström O. Direct detection of Mycobacterium tuberculosis complex in respiratory specimens by Gen- Probe amplified Mycobacterium tuberculosis direct test and Roche Amplicor Mycobacterium tuberculosis test. J Clin Microbiol 1995; 33: 1856-9
  13. Noordhoek GT, van Embden J, Ko