KaydedilenlerDerginizi ekleyin

Dergiler / Flora İnfeksiyon Hastalıkları ve Klinik Mikrobiyoloji Dergisi / 2021 / Cilt: 26 - Sayı: 4

Türkiye’de Atık Suda SARS-CoV-2 RNA’nın Basit bir Konsantrasyon Yöntemiyle TespitEdilmesi: Çorum’da Pilot Çalışma

Detection of SARS-CoV-2 RNA with a SimpleConcentration Method in Wastewater in Turkey:A Pilot Study in Çorum

Ayşegül TAYLAN ÖZKAN
Ayşe Semra GÜRESER
Ünsal SAVCI
Djursun KARASARTOVA
Gönül AESLAN AKVERAN
Sabiha AYDOĞDU
Merve AKTI
Büşra GÜREL
Çağdaş KOCAMAN
Aytaç ACAR
Nezahat KOŞAR
Lihua XIAO
Sayfa
620–627
Yayın Tarihi
2022-10-17
DOI
—
🏛️Bu makalenin bibliyografik verileri ve tam metin bağlantısı DergiPark üzerinden sağlanmıştır.
DergiPark Kaydı ↗
✨

Yapay Zeka Hızlı Bakış & Çıkarımlar

AI Insight
⚡ TL;DR(1 Cümlede Hızlı Çıkarım)

Bulgular: Sonuç olarak, alınan 7 numuneden 3’ü N ve ORF1ab hedef gen bölgeleri için pozitifti.

📌 3 Maddede Bu Makale

🎯
Amaç & Hipotez:Giriş: Toplumda dolaşan mikrobiyolojik patojenlerin izlenmesinde atık suyu izlemenin avantajları birçok çalışmayla gösterilmiştir.
📊
Temel Bulgular & Veri:Bizdeçalışmamızda basit bir konsantrasyon metoduyla atık suda SARS-CoV-2 RNA tespit etmeyi amaçladık.
💡
Sonuç & Katkı:Bulgular: Sonuç olarak, alınan 7 numuneden 3’ü N ve ORF1ab hedef gen bölgeleri için pozitifti.
🔬Tür:Deneysel Tarla Denemesi
📍Kapsam:2020 Verileri
⚙️Değişkenler:Alan Parametreleri

Özet

Giriş: Toplumda dolaşan mikrobiyolojik patojenlerin izlenmesinde atık suyu izlemenin avantajları birçok çalışmayla gösterilmiştir. Bizdeçalışmamızda basit bir konsantrasyon metoduyla atık suda SARS-CoV-2 RNA tespit etmeyi amaçladık. Materyal ve Metod: Çalışmamızda Ekim-Kasım 2020 tarihleri arasında Çorum Kentsel Atık Su Arıtma Tesisi’nden toplanan 7 atık sunumunesi incelendi. Sorbent torbalar 24 saat suda bırakıldı. Torbalar virüsü yakalamak ve konsantre etmek için kullanıldı. SARS CoV-2RNA, ters transkripsiyon-kantitatif polimeraz zincir reaksiyonu (RT-qPCR) testleri kullanılarak saptandı. Bulgular: Sonuç olarak, alınan 7 numuneden 3’ü N ve ORF1ab hedef gen bölgeleri için pozitifti. Sonuç: Çalışmamız, farklı konsantrasyon ve yakalama yöntemi ile atık sularda SARS-CoV-2 RNA tespitini bildiren ilk çalışmadır.

Abstract

Introduction: Many studies have shown the advantages of monitoring wastewater in the evaluation of microbiological pathogens cir culating in the community. It was aimed to detect of SARS-CoV-2 RNA with a simple concentration method in wastewater in this study. Materials and Methods: In our study, 7 wastewater samples were investigated, which were collected from the Urban WastewaterTreatment Plant (WWTP) of Çorum, between October to November 2020. Sorbent bags were left in water for 24 hours. Then theywere used to trap and concentrate the virus. Severe Acute Respiratory Syndrome Coronavirus 2 (SARS-CoV-2) RNA detected by usingreverse transcription-quantitative polymerase chain reaction (RT-qPCR) assays.Results: As a result, 3 of the 7 samples taken were positive for N and ORF1ab target gene regions.Conclusion: This is the first study reporting the detection of SARS-CoV-2 RNA in wastewater with different concentration and capturemethod.

🔖

Bu Makaleye Atıf Yap

ÖZKAN, A. T., GÜRESER, A. S., SAVCI, Ü., KARASARTOVA, D., AKVERAN, G. A., AYDOĞDU, S., AKTI, M., GÜREL, B., KOCAMAN, Ç., ACAR, A., KOŞAR, N., XIAO, L. (2022). Türkiye’de Atık Suda SARS-CoV-2 RNA’nın Basit bir Konsantrasyon Yöntemiyle TespitEdilmesi: Çorum’da Pilot Çalışma. Flora İnfeksiyon Hastalıkları ve Klinik Mikrobiyoloji Dergisi, Cilt: 26 - Sayı: 4, 620–627. https://ajindex.com/articles/517068

📄 Tam Metin PDF Okuyucu

📄

PDF görüntüleyici hazırlanıyor...

Kaynakça (14)

  1. World Health Organization (WHO). Coronavirus disease (COVID-19) pandemic. Available from: https://www.euro. who.int/en/health-topics/health-emergencies/coronavirus-covid-19/novel-coronavirus-2019-ncov (Accessed date: 10 December 2020)
  2. World Health Organization (WHO). Coronavirus disease (COVID-19) pandemic. Available from: https://www.who. int/emergencies/diseases/novel-coronavirus-2019 (Accessed date: 9 March 2021)
  3. Coronaviridae Study Group of the International Committee on Taxonomy of Viruses. The species Severe acute respiratory syndrome-related coronavirus: classifying 2019-nCoV and naming it SARS-CoV-2. Nat Microbiol 2020;5:536-44
  4. Xu Z, Shi L, Wang Y, Zhang J, Huang L, Zhang C, et al. Pathological findings of COVID-19 associated with acute respiratory distress syndrome. Lancet Respir Med 2020;8:420- 22
  5. Lima CMAO. Information about the new coronavirus disease (COVID-19). Radiol Bras 2020;53:V-VI
  6. Kim JM, Kim HM, Lee EJ, Jo HJ, Yoon Y, Lee NJ, et al. Detection and Isolation of SARS-CoV-2 in Serum, Urine, and Stool Specimens of COVID-19 Patients from the Republic of Korea. Osong Public Health Res Perspect 2020;11:112-17
  7. Peng L, Liu J, Xu W, Luo Q, Chen D, Lei Z, et al. SARS-CoV-2 can be detected in urine, blood, anal swabs, and oropharyngeal swabs specimens. J Med Virol 2020;92:1676-80
  8. Chen C, Gao G, Xu Y, Pu L, Wang Q, Wang L, et al. SARS-CoV-2-positive sputum and feces after conversion of pharyngeal samples in patients with COVID-19. Ann Intern Med 2020;172:832-34
  9. Xiao F, Tang M, Zheng X, Liu Y, Li X, Shan H. Evidence for gastrointestinal infection of SARS-CoV-2. Gastroenterology 2020:158;1831-3.e3
  10. La Rosa G., Muscillo M. Molecular detection of viruses in water and sewage. In: Cook N., (ed). Viruses in Food and Water: Risks, Surveillance and Control. Woodhead Publishing Limited; Cambridge, UK: 2013:97-125
  11. Kitajima M, Ahmed W, Bibby K, Carducci A, Gerba CP, Hamilton KA, et al. SARS-CoV-2 in wastewater: State of the knowledge and research needs. Sci Total Environ 2020;739:139076
  12. Farkas K, Marshall M, Cooper D, McDonald JE, Malham SK, Peters DE, et al. Seasonal and diurnal surveillance of treated and untreated wastewater for human enteric viruses. Environ Sci Pollut Res Int 2018;25:33391-401
  13. Markosian C, Mirzoyan N. Wastewater-based epidemiology as a novel assessment approach for population-level metal exposure. Sci Total Environ 2019;689:1125-32
  14. Ahmed W, Angel N, Edson J, Bibby K, Bivi