KaydedilenlerDerginizi ekleyin

Dergiler / Erciyes Üniversitesi Veteriner Fakültesi Dergisi / 2022 / Cilt: 19 - Sayı: 1

Türkiye’de Bir Yaban Domuzunda Akciğer Kıl Kurdu Metastrongylus pudentodectus’un (Metastrongylidae: Nematoda) DNA Barkodlaması ve Filogenetik Karakterizasyonu

DNA Barcoding and Phylogenetic Characterization of the Lungworm Metastrongylus pudendotectus (Metastrongylidae: Nematoda) Detected in a Wild Boar in Turkey

Mübeccel ATELGE
Sayfa
49–54
Yayın Tarihi
2022-10-18
DOI
—
🏛️Bu makalenin bibliyografik verileri ve tam metin bağlantısı DergiPark üzerinden sağlanmıştır.
DergiPark Kaydı ↗
✨

Yapay Zeka Hızlı Bakış & Çıkarımlar

AI Insight
⚡ TL;DR(1 Cümlede Hızlı Çıkarım)

Metastrongylus pudendotectus izolatlarının ayrıca aynı soydaki M. apri ve M. salmi ile ortalama %10.8 ve %12.5, Dictyocaulus türleriyle ortalama %15.0 ve Syngamus trachea ile de %15.8 genetik farklılık gösterdiği tespit edilmiştir.

📌 3 Maddede Bu Makale

🎯
Amaç & Hipotez:Bu çalışmada Kastamonu’nun merkez ilçesinde bir yaban domuzunun nekropsi analizi sonucunda akciğerlerinde belirlenen ve morfolojik identifikasyonla Metastrongylus pudentodectus olarak teşhis edilen akciğer kıl kurtlarının mitokondrial DNA cytochrome oxidase subunit 1 (COX1) gen bölgesi moleküler olarak karakterize edilmiş ve filogenetik ilişkileri araştırılmıştır.
📊
Temel Bulgular & Veri:DNA barkodlama analizlerine 10 adet M. pudontedectus izolatı dahil edilmiş olup genomik DNA izolasyonu sonrası COX1 gen bölgesi tasarlanan primerlerle çoğaltılmış ve sekans analizlerine tabii tutulmuştur.
💡
Sonuç & Katkı:Metastrongylus pudendotectus izolatlarının ayrıca aynı soydaki M. apri ve M. salmi ile ortalama %10.8 ve %12.5, Dictyocaulus türleriyle ortalama %15.0 ve Syngamus trachea ile de %15.8 genetik farklılık gösterdiği tespit edilmiştir.
🔬Tür:Araştırma Makalesi
📍Kapsam:10 adet
⚙️Değişkenler:Akciğer kıl kurdu · filogenetik karakterizasyon · Metastrongylus pudendotectus

Özet

Bu çalışmada Kastamonu’nun merkez ilçesinde bir yaban domuzunun nekropsi analizi sonucunda akciğerlerinde belirlenen ve morfolojik identifikasyonla Metastrongylus pudentodectus olarak teşhis edilen akciğer kıl kurtlarının mitokondrial DNA cytochrome oxidase subunit 1 (COX1) gen bölgesi moleküler olarak karakterize edilmiş ve filogenetik ilişkileri araştırılmıştır. DNA barkodlama analizlerine 10 adet M. pudontedectus izolatı dahil edilmiş olup genomik DNA izolasyonu sonrası COX1 gen bölgesi tasarlanan primerlerle çoğaltılmış ve sekans analizlerine tabii tutulmuştur. Sekans analizleri sonucu morfolojik tür konfirmasyonları sağlanmıştır. COX1 gen bölgesi sekans analizleri sonucunda aralarında %0.4 genetik farklılık belirlenen 2 haplotip belirlenmiştir. Filogenetik analizlerde her iki haplotipe ait izolatların GenBank veri tabanındaki referans ve çeşitli ülkelerden bildirilmiş M. pudendotectus izolatlarıyla birlikte monofiletik küme oluşturduğu belirlenmiştir. Metastrongylus pudendotectus izolatlarının ayrıca aynı soydaki M. apri ve M. salmi ile ortalama %10.8 ve %12.5, Dictyocaulus türleriyle ortalama %15.0 ve Syngamus trachea ile de %15.8 genetik farklılık gösterdiği tespit edilmiştir. Bu çalışma ile Türkiye’de yaban domuzlarında enfeksiyona yol açan akciğer kıl kurdu M. pudendotectus için ilk filogenetik karakterizasyon verileri sağlanmıştır. Elde edilen sonuçlar domuzlarda akciğer kıl kurtlarının moleküler epidemiyolojisine katkı sağlamıştır.

Abstract

In this study, lungworms detected in the necropsy analyses of a wild boar in central district of Kastamonu and diagnosed as Metastrongylus pudendotectus by morphological identification were molecularly characterized using mitochondrial cytochrome oxidase subunit 1 (COX1) gene sequences and their phylogenetic relationships were investigated. Totally 10 M. pudendotectus isolates were included in DNA barcoding analyses. COX1 gene region was amplified with newly designed primers and subjected to the sequence analyses after genomic DNA isolations. Morphological species identifications were confirmed by sequence analyses results. Two haplotypes with 0.4% genetic difference were determined by sequence analyses of the COX1 gene region. In paleogenetic analyses, both haplotypes were placed into a monophyletic cluster with the reference and published isolates of M. pudendotectus from several countries in GenBank. Furthermore M. pudendotectus isolates showed genetic differences of 10.8% and 12.5% with M. apri and M. salmi in the same genus, 15.0% with Dictyocaulus species and 15.8% with Syngamus trachea. The first phylogenetic characterization data on the lungworm M. pudendotectus infecting wild boars in Turkey is provided with this study. The obtained results also contribute to molecular epidemiology of lungworms in boars.

🔖

Bu Makaleye Atıf Yap

ATELGE, M. (2022). Türkiye’de Bir Yaban Domuzunda Akciğer Kıl Kurdu Metastrongylus pudentodectus’un (Metastrongylidae: Nematoda) DNA Barkodlaması ve Filogenetik Karakterizasyonu. Erciyes Üniversitesi Veteriner Fakültesi Dergisi, Cilt: 19 - Sayı: 1, 49–54. https://ajindex.com/articles/503650

📄 Tam Metin PDF Okuyucu

📄

PDF görüntüleyici hazırlanıyor...

Kaynakça (11)

  1. Aypak S, Aysul N, Bakırcı S, Karagenç T. Aydın ilinde avlanan yaban domuzlarında Trichinella sp. varlığının araştırılması. Animal Health Prod and Hyg 2013; 2(2): 203-5.
  2. Barutzki D, Schoierer R, Gothe R. Helminth infections in wild boars in enclosures in southern Germany: species spectrum and infection frequency. Tierarztl Prax 1990; 18(5): 529-34.
  3. Chabaud AG, Gretillat S. Metastrongylus madagascariensis, a 4th species of pulmonary strongyle infesting the domestic swine. Ann Parasitol Hum Comp 1956; 31(5-6): 572-7.
  4. Conole JC, Chilton NB, Järvis T, Gasser RB. Intraspecific and interspecific variation in the second internal transcribed spacer sequence for Metastrongylus (Nematoda:Metastrongyloidea) detected by high resolution PCR-linked restriction fragment length polymorphism. Int J Parasitol 1999; 29(12): 1935-40. da Silva D, Müller G. Parasites of the respiratory tract of Sus scrofa scrofa (wild boar) from commercial breeder in southern Brazil and its relationship with Ascaris suum. Parasitol Res 2013; 112(3): 1353-6.
  5. Darabus G, Hora FS, Mederle N, Morariu S, Ilie M, Suici T, Imre M. Prevalence and intensity of digestive and pulmonary parasites in wild boars in Romania. J Zoo Wildl Med 2019; 50(1): 270-3. de Sousa B, de Carvalho M, Fazendeiro I, Castro RF, Afonso-Roque M. Contribution for the knowledge of wild boar (Sus scrofa L.) helmintic fauna in Tapana Nacional de Mafra, an enclosure hountig area. Res Rev Parasitol 2004; 64: 3-7.
  6. Dodangeh S, Azami D, Daryani A, Gholami S, Sharif M, Mobedi I, Sarvi S, Soleymani E, Rahimi MT, Pirestani M, Gohardehi S, Bastani R. Parasitic helminths in wild boars (Sus scrofa) in Mazandaran Province, Northern Iran. Iran J Parasitol 2018; 13(3): 416-22.
  7. Fernandez-de-Mera IG, Gortazar C, Vicente J, Hofle U, Fierro Y. Wild boar helminths: risks in animal translocations. Vet Parasitol 2003; 115(4): 335-41.
  8. Gasso D, Rossi L, Mentaberre G, Casas E, Velarde R, Nosal P, Serrano E, Segales J, Fernandez-Llario P, Feliu C. An identification key for the five most common species of Metastrongylus. Parasitol Res 2014; 113(9): 3495-500.
  9. Guindon S, Gascuel O. A simple, fast, and accurate algorithm to estimate large phylogenies by maximum likelihood. Syst Biol 2003; 52(5): 696-704.
  10. Humbert JF, Henry C. Studies on the prevalence and the transmission of lung and stomach nematodes of the wild boar (Sus scrofa) in France. J Wildl Dis 1989; 25(3): 335-41.
  11. Kesik HK, Kilinc SG, Celik F, Simsek S, Ahmed H. A case-study of the molecular diagnosis o