Dergiler / Erciyes Tıp Dergisi / 2007 / Cilt: 29 - Sayı: 5

Characterization of an Egyptian Spodoptera littoralis nucleopolyhedrovirus with cloning and sequencing of a highly conserved region from polyhedrin gene

Polihedrin gende iyi korunmuş bölgenin klonlanması ve zincirlenmesi ile bir mısır Spodoptera littoralis nükleopolihedrovirüs'ün karakteristiği

Sayfa
353–362
Yayın Tarihi
2022-10-17
DOI
—
🏛️Bu makalenin bibliyografik verileri ve tam metin bağlantısı DergiPark üzerinden sağlanmıştır.
DergiPark Kaydı ↗
✨

Yapay Zeka Hızlı Bakış & Çıkarımlar

AI Insight
⚡ TL;DR(1 Cümlede Hızlı Çıkarım)

Bulgular: Polh-cr den üretilen önemli dizilim sonuçları 91 Baculovirus izolatlar ile ilişkilendirildi.

📌 3 Maddede Bu Makale

🎯
Amaç & Hipotez:Amaç: Bir Mısır Spodoptera littoralis Nucleopolyhedrovirus (SpliNPV) potansiyel biokontrol ajani olabilmesi için Autographa californica (AcMNPV) ile karşılaştırılarak test edildi.
📊
Temel Bulgular & Veri:Material and Methods: Spodoptera littoralis ikinci dönem lavrasına karşı SpliNPV ve AcMNPV virusünün LC50 değerine dayanan karşılaştırmalı değerlendirmede AcMNPV nın SpliNPV göre dört kat daha büyük duyarlılık gösterdiği ortaya çıkarılmıştır.
💡
Sonuç & Katkı:Bulgular: Polh-cr den üretilen önemli dizilim sonuçları 91 Baculovirus izolatlar ile ilişkilendirildi.
🔬Tür:Araştırma Makalesi
📍Kapsam:Genişletilmiş Akademik Örneklem
⚙️Değişkenler:Alan Parametreleri

Özet

Amaç: Bir Mısır Spodoptera littoralis Nucleopolyhedrovirus (SpliNPV) potansiyel biokontrol ajani olabilmesi için Autographa californica (AcMNPV) ile karşılaştırılarak test edildi. Material and Methods: Spodoptera littoralis ikinci dönem lavrasına karşı SpliNPV ve AcMNPV virusünün LC50 değerine dayanan karşılaştırmalı değerlendirmede AcMNPV nın SpliNPV göre dört kat daha büyük duyarlılık gösterdiği ortaya çıkarılmıştır. Spodoptera littoralis ikinci dönem lavrasına karşı SpliNPV ve AcMNPV virusünün yaklaşık LC50 değeri kullanılarak belirlenen LT50 sırasıyla 4.2 ve 5.8 gündür. PCR, SpliNPV nm polyhedrin genin iyi korunmuş bölgesini başarıyla amlifiye etti. 405 bp hk bir DNA geni (Polh-cr) elde edildi. Bundan sonra bu DNA segmenti klonlandi ve zincirlendi. Nükleotid dizilimi ve amino asit dizilimi GenBank ta bütün olabilen dizilimlerle karşılaştırıldı. Bulgular: Polh-cr den üretilen önemli dizilim sonuçları 91 Baculovirus izolatlar ile ilişkilendirildi. Homoloji oranlan Plusia orichalcea NPV için % 78 ve SpliNPV için %99 olarak bulundu. Sonuç:Biyolojik kontrol stratejilerinde virus belirlemek için bu yüksek olarak korunmuş bölgenin kullamlmasi muhtemel kolay, hizh ve ekonomik olarak görülüyor.

Abstract

Purpose: An Egyptian isolate of Spodoptera littoralis nucleopolyhedrovirus (SpliNPV) was tested for its potential as biocontrol agent in comparison to Autographa californica multiple nucleopolyhedrovirus (AcMNPV). Material and Methods: Comparative assays of SpliNPV and AcMNPV against 2nd instar larvae of Spodoptera littoralis revealed 4-fold greater susceptibility of S. littoralis to AcMNPV than to SpliNPV based on LC50 values for the two viruses. The LT50s determined for SpliNPV and AcMNPV using LC50 of the virus against 2nd instar larvae were 4.2 and 5.8 days, respectively. A DNA segment of 405 bp containing highly conserved region from polyhedrin gene of SpliNPV (Polh-cr) was successfully amplified by PCR. Subsequently, this DNA segment was cloned and sequenced. Nucleotide sequence and its deduced amino acid sequence were compared to all available sequences in GenBank. Results: Sequence alignment results revealed that Polh-cr showed significant similarities with 91 different baculovirus isolates. The percentage of homology ranged from 78% for Plusia orichalcea NPV to 99 % for SpliNPV. Conclusion: This highly conserved region provides a candidate that could be used in easy, fast and economic prospective systems for virus detection as well as in biological control strategies.

🔖

Bu Makaleye Atıf Yap

SEUFİ, A. (2022). Characterization of an Egyptian Spodoptera littoralis nucleopolyhedrovirus with cloning and sequencing of a highly conserved region from polyhedrin gene. Erciyes Tıp Dergisi, Cilt: 29 - Sayı: 5, 353–362. https://ajindex.com/articles/503189

📄 Tam Metin PDF Okuyucu

📄

PDF görüntüleyici hazırlanıyor...

Kaynakça (13)

  1. Martignoni ME, Iwai PJ. A catalog of viral diseases of Insects, Mites and Ticks, 4th edn. Portland, Oregon: USDA Forest Service PNW 1986; 195
  2. Huber J. Use of baculoviruses in pest management programs. In:"The biology of baculoviruses", (R. R. Granados and B. Federici, Editors), CRC Press, Boca Raton, FL. 1986; 2: 181-202
  3. Wood HA, Granados RR. Genetically engineered baculoviruses as agent for pest control. Annu Rev Microbiol. 1991; 45:69-87 4. El-Salamouny S, Lange M, Jutzi M, Huber J, Jehle JA. Comparative study on the susceptibility of cutworms (Lepidoptera: Noctuidae) to Agrotis segetum nucleopolyhedrovirus and Agrotis ipsilon nucleopolyhedrovirus. J Invertebr Pathol. 2003; 84: 75-82
  4. Wood HA. (1996): Genetically enhanced baculovirus insecticides. In "Molecular biology of the biological control of pest and diseases of plants" (M. Gunasekaran, DJ Weber Eds.), CRC Press, Boca Raton, 91-104
  5. Couch JA. Free and occluded virus, similar to baculovirus, in hepatopancreas of pink Shrimp. Nature (London) 1974;247: 229-231
  6. Hsu YL, Wang KH, Yang YH, Tung MC, Hu CH, Lo CF, Wang CH, Hsu T. Diagnosis of penaeus monodon- type baculovirus by PCR and by ELISA of occlusion bodies. Dis Aquat Organ. 2000; 40: 93-99
  7. Halder M, Ahne W, Thomsen I. Detection of a baculovirus in the tiger prawn Penaeus monodon. Zentralbl Veterinarmed B. 1989; 36: 257-260
  8. Chang PS, Lo CF, Kou GH, Lu CC, Chen SN. Purification and amplification of DNA from Penaeus monodon-type baculovirus (MBV). J Invertebr Pathol. 1993; 62: 116-120
  9. Poulos BT, Mary J, Bonami JR, Redman R, Lightner DV. Use of non-radioactively labeled DNA probes for the detection of a baculovirus from Penaeus monodon by in situ hybridization of fixed tissue. J Virol Methods. 1994;49: 187-193
  10. Faktor O, Raviv D. A polymerase chain reaction for the detection of nucleopolyhedroviruses in infected insects: the fate of the Spodoptera littoralis virus in Locusta migratoria. J Virol Methods. 1996; 61: 95-101
  11. Belcher CR, Young PR. Colourimetric PCR-based detection of monodon baculovirus in whole Penaeus monodon postlarvae. J Virol Methods. 1998; 74: 21-29
  12. Wang CH, Yang HN, Liu HC, Kou GH, Lo CF. Nested polymerase chain reaction and in situ hybridization for detection of nucleopolyhedrosis. J Virol Methods. 2000;84: 65-75
  13. Christian PD, Gibb N, Kasprzak AB, Richards A. A rapid method for the identification and differentiation of Helicoverpa nucleopolyhedroviruses (NPV Baculoviridae) isolated