KaydedilenlerDerginizi ekleyin

Dergiler / Erciyes Tıp Dergisi / 2014 / Cilt: 36 - Sayı: 3

Next-generation DNA sequencing technologies

Yeni nesil DNA sekanslama teknolojileri

Pervin DİNÇER
Gülsüm KÜREKÇİ KAYMAN
Sayfa
99–103
Yayın Tarihi
2022-10-17
DOI
—
🏛️Bu makalenin bibliyografik verileri ve tam metin bağlantısı DergiPark üzerinden sağlanmıştır.
DergiPark Kaydı ↗
✨

Yapay Zeka Hızlı Bakış & Çıkarımlar

AI Insight
⚡ TL;DR(1 Cümlede Hızlı Çıkarım)

Bu yazıda, yaygın olarak kullanılan yeni nesil sekanslama platformları, elde edilen verilerin analizleri ve bu teknolojilerin uygulamaları tartışılmaktadır.

📌 3 Maddede Bu Makale

🎯
Amaç & Hipotez:Son zamanlarda, hızlı, düşük maliyetli ve son derece güvenilir metotlara gereksinim yeni nesil DNA sekanslama teknolojilerinin gelişimini tetiklemiştir.
📊
Temel Bulgular & Veri:Sanger sekanslama metodundaki kısıtlamaları aşmanın yanı sıra, büyük ölçekli genetik veriler farklı analiz metotlarının geliştirilmesini sağlamıştır.
💡
Sonuç & Katkı:Bu yazıda, yaygın olarak kullanılan yeni nesil sekanslama platformları, elde edilen verilerin analizleri ve bu teknolojilerin uygulamaları tartışılmaktadır.
🔬Tür:Uygulamalı Anket & Alan Araştırması
📍Kapsam:Genişletilmiş Akademik Örneklem
⚙️Değişkenler:Alan Parametreleri

Özet

Son zamanlarda, hızlı, düşük maliyetli ve son derece güvenilir metotlara gereksinim yeni nesil DNA sekanslama teknolojilerinin gelişimini tetiklemiştir. Sanger sekanslama metodundaki kısıtlamaları aşmanın yanı sıra, büyük ölçekli genetik veriler farklı analiz metotlarının geliştirilmesini sağlamıştır. Bu yazıda, yaygın olarak kullanılan yeni nesil sekanslama platformları, elde edilen verilerin analizleri ve bu teknolojilerin uygulamaları tartışılmaktadır.

Abstract

Recently, the requirement for fast, low-cost, and highly reliable methods has triggered the development of next-generation DNA sequencing technologies. In addition to overcoming the restrictions in Sanger sequencing methods, large-scale genetic data have provided the development of different analysis methods. In this paper, widely used next-generation sequencing platforms, the analyses of the data obtained, and the applications of these technologies are discussed.

🔖

Bu Makaleye Atıf Yap

DİNÇER, P., KAYMAN, G. K. (2022). Next-generation DNA sequencing technologies. Erciyes Tıp Dergisi, Cilt: 36 - Sayı: 3, 99–103. https://ajindex.com/articles/502369

📄 Tam Metin PDF Okuyucu

📄

PDF görüntüleyici hazırlanıyor...

Kaynakça (17)

  1. Sanger F, Nicklen S, Coulson AR. DNA sequencing with chainterminating inhibitors. Proc Natl Acad Sci U S A 1977
  2. 74(12): 5463-7. [CrossRef] 2. International Human Genome Consortium. Finishing the euchromatic sequence of the human genome. Nature 2004
  3. 431(7011): 931-45. [CrossRef] 3. Metzker ML. Sequencing technologies – the next generation. Nature Rev Genet 2010
  4. 11(1): 31-46. [CrossRef] 4. Shendure J, Lieberman Aiden E. The expanding scope of DNA sequencing. Nat Biotechnol 2012
  5. 30(11): 1084-94. [CrossRef] 5. Mardis ER. Next-Generation DNA sequencing methods. Annu Rev Genomics Hum Genet 2008
  6. [CrossRef] 6. Ronaghi M, Uhlen M, Nyren P. A sequencing method based on realtime pyrophosphate. Science 1998
  7. 281(5375): 363-5. [CrossRef] 7. Tawfik DS, Griffiths AD. Man-made cell-like compartments for molecular evolution. Nat Biotechnol 1998
  8. 16(7): 652-6. [CrossRef] 8. Margulies M, Egholm M, Altman WE, Attiya S, Bader JS, Bemben LA, et al. Genome sequencing in microfabricated high-density picolitre reactors. Nature 2005
  9. 437(7057): 376-80. 9. Huse SM, Huber JA, Morrison HG, Sogin ML, Welch DM. Accuracy and quality of massively parallel DNA pyrosequencing. Genome Biol 2007
  10. 8(7): R143. [CrossRef] 10. Bentley DR. Whole-genome re-sequencing. Curr Opin Genet Dev 2006
  11. 16(6): 545-52. [CrossRef] 11. Bentley DR, Balasubramanian S, Swerdlow HP, Smith GP, Milton J, Brown CG, et al. Accurate whole human genome sequencing using reversible terminator chemistry. Nature 2008
  12. 456(7218): 53-9. [CrossRef] 12. Shendure J, Porreca GJ, Reppas NB, Lin X, McCutcheon JP, Rosenbaum AM, et al. Accurate multiplex polony sequencing of an evolved bacterial genome. Science 2005
  13. 309(5741): 1728-32. [CrossRef] 13. McKernan K, Blanchard A, Kotler L, Costa G. Reagents, methods and libraries for bead-based sequencing. US20080003571
  14. Rothberg JM, Wolfgang H, Rearick TD, Schultz J, Mileski W, Davey M, et al. An integrated semiconductor device enabling non-optical genome sequencing. Nature 2011
  15. 475(7356):348-52. [CrossRef] 15. Braslavsky I, Hebert B, Kartalov E, Quake R. Sequence information can be obtained from single DNA molecules. Proc Natl Acad Sci U S A 2003
  16. 100(7): 3960-4. [CrossRef] 16. Eid J, Fehr A, Gray J, Luong K, Lyle J, Otto G, et al. Real-time DNA sequencing from single polymerase molecules. Science 2009. 323(5910)
  17. [CrossRef] 17. Oxford Nanopore Technologies, Available from: URL: http://www. nanoporetech.com. 18. Pop M, Salzberg SL. Bioinformatics