KaydedilenlerDerginizi ekleyin

Dergiler / Çukurova Üniversitesi Ziraat Fakültesi Dergisi / 2005 / Cilt: 20 - Sayı: 1

Gen tanımı (Gen ekspresyon) analizlerinde mikrodizi tekniği

Microarray technique for gene expression analysis

Yalçın TAHTALI
Zeynel CEBECİ
Sayfa
97–102
Yayın Tarihi
2022-10-11
DOI
—
🏛️Bu makalenin bibliyografik verileri ve tam metin bağlantısı DergiPark üzerinden sağlanmıştır.
DergiPark Kaydı ↗
✨

Yapay Zeka Hızlı Bakış & Çıkarımlar

AI Insight
⚡ TL;DR(1 Cümlede Hızlı Çıkarım)

Mikrodizi teknolojisinin, DNA baz dizisi analizi, mutasyon ve polimorfizm saptama, ilaç hedefleri tanımlama, gen tanımı profillerinin oluşturulması, normal ve patolojik durumlarda gen ekspresyon farklılıklarının incelenmesi gibi çok geniş uygulama alanı bulunmaktadır.

📌 3 Maddede Bu Makale

🎯
Amaç & Hipotez:DNA mikrodizi, binlerce genin ekspresyonunu eş zamanlı olarak ölçebilen bir teknolojidir.
📊
Temel Bulgular & Veri:Gen tanımı farklılıkları kontrolle karşılaştırılarak gen analiz yazılımlarıyla analiz edilmektedir.
💡
Sonuç & Katkı:Mikrodizi teknolojisinin, DNA baz dizisi analizi, mutasyon ve polimorfizm saptama, ilaç hedefleri tanımlama, gen tanımı profillerinin oluşturulması, normal ve patolojik durumlarda gen ekspresyon farklılıklarının incelenmesi gibi çok geniş uygulama alanı bulunmaktadır.
🔬Tür:Araştırma Makalesi
📍Kapsam:Genişletilmiş Akademik Örneklem
⚙️Değişkenler:Alan Parametreleri

Özet

DNA mikrodizi, binlerce genin ekspresyonunu eş zamanlı olarak ölçebilen bir teknolojidir. Mikrodiziler hücreden veya dokudan RNA izolasyonu, tümleyici nükleotidler (cDNA) kullanılarak hedef üretimi, işaretlenen hedefin cam/naylon matrikse (dizi) sabitlenen gene özel problarla hibridizasyonuyla oluşturulmaktadırlar. Gen tanımı farklılıkları kontrolle karşılaştırılarak gen analiz yazılımlarıyla analiz edilmektedir. Mikrodizi teknolojisinin, DNA baz dizisi analizi, mutasyon ve polimorfizm saptama, ilaç hedefleri tanımlama, gen tanımı profillerinin oluşturulması, normal ve patolojik durumlarda gen ekspresyon farklılıklarının incelenmesi gibi çok geniş uygulama alanı bulunmaktadır.

Abstract

DNA microarray is a technology that can measure the expressions of thousands of genes simultaneously. Microarray is applied with isolation mRNA from the cell or tissue, creation of complementary nucleotide (cDNA) target and hybridization of the labeled target to gene spesific probe affixed to glass or nylon matrix (array). In order to analyze the existing variations, special gene analysis software is used to determine changes in expression relative to a control. Microarray technology is used for a wide scope of applications, including sequencing, detection of mutations or polimorphisms, identification of drug targets, gene expression profiling, gene expression patterns normal versus pathological conditions.

🔖

Bu Makaleye Atıf Yap

TAHTALI, Y., CEBECİ, Z. (2022). Gen tanımı (Gen ekspresyon) analizlerinde mikrodizi tekniği. Çukurova Üniversitesi Ziraat Fakültesi Dergisi, Cilt: 20 - Sayı: 1, 97–102. https://ajindex.com/articles/486352

Kaynakça (12)

  1. Bartosiewicz M, Trounstine M, Barker D. Development of a toxicological gene array and quantitative assesment of this technology. Arch Biochem Biophys 2000;376:66-73.
  2. Beier M, Hoheizel JD. Versalite derivatisation of solid support media for covalent binding on DNA-microchips. Nucleic Acides Res 1999;27: 1970-1977.
  3. Brown PO, Botstein D. Exploring the new world of the genome with DNA Microarray. Nature Genetics 1999;21:33-37.
  4. Der SD, Zhou A, Williams BR. Identification of genes differentially regulated by interferon alpa, beta or gamma using oligonucleotide arrays. Proc Natl Acad Sci USA 1998;95:15623-15628.
  5. Golub TR, Slonim DK, Tamayo P.Molecular classification of cancer: class prediction by gene expression monitoring. Science. 1999;286:531-537.
  6. Lockhart DJ, Dong H, Bryne MC. Expression monitoring by hybridization to high-density oligonucleotide arrays. Nat Biotechnol. 1996; 14: 1675-1680.
  7. Perou CM, Jeffrey SS, Van De RM. Distinctive gene expression paterns in human mammary epithelial cells and breast cancers. Proc Natl Acad Sci USA 1999;96:9212-9217.
  8. Ross DT, Scherf U, Eizen MB. Systematic varition in gene expression patterns in human cancer cell lines. Nat. Genet. 2000;24:227-235.
  9. Shoemaker DD, Schadt EE, Armour CD. Experimental annotation of the human genome using microarray technology. Nature. 2001;409:922-927.
  10. Sgroi DC, Teng Ş, Robinson G. In vivo gene expression profile analysis of human breast cancer progression. Cancer Res. 1999; 59:5656-5661.
  11. Southern E, Mir K, Shchepinov M. Molecular interactions on microarrays. Nature genetics 1999;21:5-9. URL1: www.genome.gov, 04/11/2004 URL2: www.gene-chips.com, 12/07/2004 URL3: www.cs.wustl.edu, 18/09/2004 URL4: www.aat.array.com, 19/07/2004
  12. Zhu H, Cong JP, Mamtora G. Cellular gene expression altered by human cytomegalo virus: global monitoring with oligonucleotide arrays. Proc. Natl.Acad. Sci. USA 2001;95: 14470-14475.