KaydedilenlerDerginizi ekleyin

Dergiler / Adıyaman Üniversitesi Fen Bilimleri Dergisi / 2019 / Cilt: 9 - Sayı: 1

Glioksim Molekülünün 1H ve 13C NMR Kimyasal Kayma Değerlerinin Deneysel ve Teorik Metotlar ile Belirlenmesi

Determination of 1H and 13C Nuclear Magnetic Resonance Chemical Shift Values of Glyoxime Molecule with Experimental and Theoretical Methods

Halil Uğur TAŞDEMİR
Fatih SEVGİ
Ercan TÜRKKAN
Sayfa
99–112
Yayın Tarihi
2019-06-28
DOI
—
🏛️Bu makalenin bibliyografik verileri ve tam metin bağlantısı DergiPark üzerinden sağlanmıştır.
DergiPark Kaydı ↗
✨

Yapay Zeka Hızlı Bakış & Çıkarımlar

AI Insight
⚡ TL;DR(1 Cümlede Hızlı Çıkarım)

Aynı zamanda glioksim molekülünün 1H ve 13C kimyasal kayma değerleri deneysel olarak da tespit edilmiştir.

📌 3 Maddede Bu Makale

🎯
Amaç & Hipotez:Bu çalışmada glioksim molekülünün moleküler yapısını belirlemek için konformasyon analizi yarı deneysel PM3 metodu ile yapılmıştır.
📊
Temel Bulgular & Veri:Elde edilen konformasyonlar Yoğunluk Fonksiyonelleri Metodu (DFT) kullanılarak DFT/B3LYP/6-311G++(d,p) metot baz seti kombinasyonu ile optimize edilmiştir.
💡
Sonuç & Katkı:Aynı zamanda glioksim molekülünün 1H ve 13C kimyasal kayma değerleri deneysel olarak da tespit edilmiştir.
🔬Tür:Modelleme & Sayısal Simülasyon
📍Kapsam:Genişletilmiş Akademik Örneklem
⚙️Değişkenler:Glioksim · Nükleer manyetik rezonans · Yoğunluk fonksiyonelleri teorisi

Özet

Bu çalışmada glioksim molekülünün moleküler yapısını belirlemek için konformasyon analizi yarı deneysel PM3 metodu ile yapılmıştır. Elde edilen konformasyonlar Yoğunluk Fonksiyonelleri Metodu (DFT) kullanılarak DFT/B3LYP/6-311G++(d,p) metot baz seti kombinasyonu ile optimize edilmiştir. Optimizasyon sonucunda enerji durumuna göre en kararlı yapı bulunmuştur. Bu kararlı yapıya ait Nükleer Manyetik Rezonans (NMR) parametreleri olan 1H ve 13C kimyasal kayma değerleri, DFT metodu ve 6 farklı baz seti kullanılarak sıvı fazda ve gaz fazında hesaplanmıştır. Ayrıca moleküller arası hidrojen bağının, 1H kimyasal kayma değerlerine etkisi DFT metodunda B3LYP/ 6-31G++(d,p) seviyesinde dimer moleküler modellemesi yapılarak incelenmiştir. Aynı zamanda glioksim molekülünün 1H ve 13C kimyasal kayma değerleri deneysel olarak da tespit edilmiştir. Hesaplanan NMR parametreleri ile deneysel NMR parametreleri karşılaştırılarak glioksim molekülünün yapı analizleri yapılmıştır.

Abstract

In this study, the conformational analysis was performed by the semi-empirical PM3 method to determine the molecular structure of the glyoxime molecule. Each of conformer is optimized using the Density Functionals Theory (DFT) with DFT / B3LYP / 6-311G ++ (d, p) method basis set combination. As a result of the optimization, the most stable structure was determined according to the energy order. The chemical shift values ​​of 1H and 13C, which are Nuclear Magnetic Resonance (NMR) parameters of this stable structure, were calculated in liquid phase and gas phase using DFT method and six different basis sets. Furthermore, the effect of intermolecular hydrogen bonding on 1H chemical shift values ​​was investigated by dimer molecular modeling at the level of B3LYP / 6-31G ++ (d, p) in the DFT method. The 1H and 13C chemical shift values ​​of the glyoxime molecule were determined experimentally. Structural analyzes of the glyoxime molecule were made by comparing the calculated NMR parameters with the experimental NMR parameters.

🔖

Bu Makaleye Atıf Yap

TAŞDEMİR, H. U., SEVGİ, F., TÜRKKAN, E. (2019). Glioksim Molekülünün 1H ve 13C NMR Kimyasal Kayma Değerlerinin Deneysel ve Teorik Metotlar ile Belirlenmesi. Adıyaman Üniversitesi Fen Bilimleri Dergisi, Cilt: 9 - Sayı: 1, 99–112. https://ajindex.com/articles/451066

📄 Tam Metin PDF Okuyucu

📄

PDF görüntüleyici hazırlanıyor...

Kaynakça (13)

  1. Kaupp, M., Bühl, M., Malkin, V. G., Calculation of NMR and EPR parameters, Wiley-Vch, Weinheim, 2004.
  2. Wu, A., Zhang, Y., Xu X., Yan, Y., Systematic Studies on the Computation of Nuclear Magnetic Resonance Shielding Constants and Chemical Shifts: The Density Functional Models, Journal of Computational Chemistry, 28(15), 2431-2442, 2007.
  3. Hehre, W. J., Radom, L., Schleyer, Pvon R., Pople, J. A., Ab Initio Molecular Orbital Theory, John Wiley & Sons, New York, 1986.
  4. Foresman, J. B., Frisch, A., Exploring Chemistry with Electronic Structure Methods, Gaussian, Pittsburgh, 1996.
  5. Frisch, M. J., Frisch, A., Foresman, J. B., Gaussian 94 Users Reference, Gaussian, Pittsburgh, 1995.
  6. Ruud, K., Helgaker, T., Kobayashi, R., Jorgensen, P., Bak, K. L., Jensen, H. J. A., Multiconfigurational self-consistent field calculations of nuclear shieldings using London atomic orbitals, Journal of Chemical Physics, 100(11), 8178-8185, 1994.
  7. Chesnut, D. B., Ab Initio Calculations of NMR Chemical Shielding, Annual, Reports on NMR Spectroscopy, 29, 71-122, 1994. de Dios, A. C., Ab initio calculations of the NMR chemical shift, Progress in Nuclear Magnetic Resonance Spectroscopy, 29(3-4), 229-278, 1996
  8. Barszczewicz, A., Jaszu´nski, M., Jackowski, K., Ab initio calculations of the oxygen atom NMR shielding in the carbonyl group, Chemical Physical Letters, 203(4), 404-408, 1993.
  9. Cheeseman, J. R., Trucks, G. W., Keith, T. A., Frisch, M. J., A comparison of models for calculating nuclear magnetic resonance shielding tensors, Journal of Chemical Physics, 104(14), 5497-5509, 1996.
  10. Kupka, T., Koaski, M., Pasterna, G., Ruud, K., Towards more reliable prediction of formaldehyde multinuclear NMR parameters and harmonic vibrations in the gas phase and solution, Journal of Molecular Structure (THEOCHEM), 467(1), 63- 78, 1999.
  11. DeHaven-Hudkins, D. L., Komer, K. M., Peterson, J. A., Mavunkel, B. J., Rzeszotarski, W. J., Opioid agonist properties of two oxime derivatives of naltrexone, NPC 831 and NPC 836, Pharmacology Biochemistry and Behavior, 44(1), 45-50, 1993.
  12. DeHaven-Hudkins, D. L., Brostrom, P. A., Allen, J. T., Lesko, L. J., Ferkany, J. W., Kaplita, P. V., Mavunkel, B. J., Rzeszotarski, W. J., Steranka, L. R., Pharmacologic Profile of NPC 168 (naltrexone phenyl oxime), A Novel Compound With Activity At Opioid Receptors, Pharmacology Biochemistry and Behavior, 37(3), 497- 504, 1990.
  13. Schenone, S., Bruno, O., Ranise, A., Bondavalli, F., D'Amico, M., Parrillo, C., Lampa, E., Rossi, F., N-Substituted