Dergiler / Turkish Journal of Hematology / 2016 / Cilt: 33 - Sayı: 3

Genomik Varyasyonların Klinik Yorumlanması

Clinical Interpretation of Genomic Variations

Sayfa
172–179
DOI
—
🏛️Bu makalenin bibliyografik verileri ve tam metin bağlantısı DergiPark üzerinden sağlanmıştır.
DergiPark Kaydı ↗
✨

Yapay Zeka Hızlı Bakış & Çıkarımlar

AI Insight
⚡ TL;DR(1 Cümlede Hızlı Çıkarım)

Yeni haritalama ve hizalama araçlarına duyulan ihtiyaç, terminolojinin harmonizasyonu, genetik isimlendirmenin doğru kullanımı, farklı populasyonlar için referans genom datasının bulunmaması, nadir hastalıklar için genomik veri bankalarının eksikliği ve klinik raporlama, halen aşılması gereken sorunlar arasında bulunmaktadır

📌 3 Maddede Bu Makale

🎯
Amaç & Hipotez:Yeni dizileme teknolojileri, tek genli ve/veya kompleks kalıtılan hastalıklarla ilgili genlerinin haritalanması, kişiye özel tedavi ve farmakogenomik alanları için yüksek verimde ve büyük ölçekte genomik data üreten teknolojilerdir.
📊
Temel Bulgular & Veri:Yeni nesil dizileme, hastaların tanı ve tedavi yanıtlarını değerlendirecek moleküler izlem süreçlerinde kullanılmak üzere, hızlı bir şekilde rutin uygulamada yerini bulmaktadır.
💡
Sonuç & Katkı:Yeni haritalama ve hizalama araçlarına duyulan ihtiyaç, terminolojinin harmonizasyonu, genetik isimlendirmenin doğru kullanımı, farklı populasyonlar için referans genom datasının bulunmaması, nadir hastalıklar için genomik veri bankalarının eksikliği ve klinik raporlama, halen aşılması gereken sorunlar arasında bulunmaktadır
🔬Tür:Deneysel Tarla Denemesi
📍Kapsam:Genişletilmiş Akademik Örneklem
⚙️Değişkenler:Alan Parametreleri

Özet

Yeni dizileme teknolojileri, tek genli ve/veya kompleks kalıtılan hastalıklarla ilgili genlerinin haritalanması, kişiye özel tedavi ve farmakogenomik alanları için yüksek verimde ve büyük ölçekte genomik data üreten teknolojilerdir. Yeni nesil dizileme, hastaların tanı ve tedavi yanıtlarını değerlendirecek moleküler izlem süreçlerinde kullanılmak üzere, hızlı bir şekilde rutin uygulamada yerini bulmaktadır. Yeni nesil dizileme platformları çok büyük ölçekte genetik varyasyon datası üretmektedir ve bu varyasyonların klinik olarak anlamlandırılması çok zordur. Klinik yorumlamalar, hekimler ile biyoinformatik ve genetik uzmanlarının yakın işbirliğine ihtiyaç duymaktadır. Yeni haritalama ve hizalama araçlarına duyulan ihtiyaç, terminolojinin harmonizasyonu, genetik isimlendirmenin doğru kullanımı, farklı populasyonlar için referans genom datasının bulunmaması, nadir hastalıklar için genomik veri bankalarının eksikliği ve klinik raporlama, halen aşılması gereken sorunlar arasında bulunmaktadır

Abstract

Novel high-throughput sequencing technologies generate large-scale genomic data and are used extensively for disease mapping of monogenic and/or complex disorders, personalized treatment, and pharmacogenomics. Next-generation sequencing is rapidly becoming routine tool for diagnosis and molecular monitoring of patients to evaluate therapeutic efficiency. The next-generation sequencing platforms generate huge amounts of genetic variation data and it remains a challenge to interpret the variations that are identified. Such data interpretation needs close collaboration among bioinformaticians, clinicians, and geneticists. There are several problems that must be addressed, such as the generation of new algorithms for mapping and annotation, harmonization of the terminology, correct use of nomenclature, reference genomes for different populations, rare disease variant databases, and clinical reports

🔖

Bu Makaleye Atıf Yap

SAYİTOĞLU, M. (2016). Genomik Varyasyonların Klinik Yorumlanması. Turkish Journal of Hematology, Cilt: 33 - Sayı: 3, 172–179. https://ajindex.com/articles/413112

📄 Tam Metin PDF Okuyucu

📄

PDF görüntüleyici hazırlanıyor...

Kaynakça (5)

  1. Kelsen JR, Dawany N, Moran CJ, Petersen BS, Sarmady M, Sasson A, Pauly- Hubbard H, Martinez A, Maurer K, Soong J, Rappaport E, Franke A, Keller A, Winter HS, Mamula P, Piccoli D, Artis D, Sonnenberg GF, Daly M, Sullivan KE, Baldassano RN, Devoto M. Exome sequencing analysis reveals variants in primary immunodeficiency genes in patients with very early onset inflammatory bowel disease. Gastroenterology 2015;149:1415-1424.
  2. Tuncer FN, Gormez Z, Calik M, Altiokka Uzun G, Sagiroglu MS, Yuceturk B, Yuksel B, Baykan B, Bebek N, Iscan A, Ugur Iseri SA, Ozbek U. A clinical variant in scn1a inherited from a mosaic father cosegregates with a novel variant to cause Dravet syndrome in a consanguineous family. Epilepsy Res 2015;113:5-10.
  3. Jeroncic A, Memari Y, Ritchie GR, Hendricks AE, Kolb-Kokocinski A, Matchan A, Vitart V, Hayward C, Kolcic I, Glodzik D, Wright AF, Rudan I, Campbell H, Durbin R, Polasek O, Zeggini E, Boraska Perica V. Whole-exome sequencing in an isolated population from the Dalmatian island of Vis. Eur J Hum Genet 2016 [Epub ahead of print]. Kornilov SA, Rakhlin N, Koposov R, Lee M, Yrigollen C, Caglayan AO, Magnuson JS, Mane S, Chang JT, Grigorenko EL. Genome-wide association and exome sequencing study of language disorder in an isolated population. Pediatrics 2016;137. Verdura E, Herve D, Scharrer E, Amador Mdel M, Guyant-Marechal L, Philippi A, Corlobe A, Bergametti F, Gazal S, Prieto-Morin C, Beaufort N, Le Bail B, Viakhireva I, Dichgans M, Chabriat H, Haffner C, Tournier-Lasserve E. Heterozygous htra1 mutations are associated with autosomal dominant cerebral small vessel disease. Brain 2015;138:2347-2358.
  4. Ward DG, Baxter L, Gordon NS, Ott S, Savage RS, Beggs AD, James JD, Lickiss J, Green S, Wallis Y, Wei W, James ND, Zeegers MP, Cheng KK, Mathews GM, Patel P, Griffiths M, Bryan RT. Multiplex PCR and next generation sequencing for the non-invasive detection of bladder cancer. PLoS One 2016;11:e0149756. Dewey FE, Grove ME, Pan C, Goldstein BA, Bernstein JA, Chaib H, Merker JD, Goldfeder RL, Enns GM, David SP, Pakdaman N, Ormond KE, Caleshu C, Kingham K, Klein TE, Whirl-Carrillo M, Sakamoto K, Wheeler MT, Butte AJ, Ford JM, Boxer L, Ioannidis JP, Yeung AC, Altman RB, Assimes TL, Snyder M, Ashley EA, Quertermous T. Clinical interpretation and implications of whole-genome sequencing. JAMA 2014;311:1035-1045.
  5. Frese KS, Katus HA, Meder B. Next-generation sequencing: From understanding biology to personalized medicine. Biology (Basel) 2013;2:378-398. Do