Dergiler / Cukurova Medical Journal / 2021 / Cilt: 46 - Sayı: 4

Altın standart test yokluğunda tanısal doğruluk ölçütlerinin Bayesci yaklaşım ile tahmini: Helicobacter Pylori verisi uygulaması

Bayesian estimation of diagnostic accuracy measures when there is no gold standard: a Helicobacter Pylori data application

Sayfa
1548–1557
Yayın Tarihi
2021-12-30
DOI
—
🏛️Bu makalenin bibliyografik verileri ve tam metin bağlantısı DergiPark üzerinden sağlanmıştır.
DergiPark Kaydı ↗
✨

Yapay Zeka Hızlı Bakış & Çıkarımlar

AI Insight
⚡ TL;DR(1 Cümlede Hızlı Çıkarım)

Bulgular: Bayesci çıkarsama yapıldığında hastalık ile ilgili prevalans bilgisi ve önsel bilgi dikkate alındığından tanı testine ait pozitif ve negatif kestirim değerlerine ait sonuçların daha güvenilir olduğu saptanmıştır.

📌 3 Maddede Bu Makale

🎯
Amaç & Hipotez:Amaç: Tanı testleri, hasta ve sağlıklı bireylerin oluşturduğu heterojen bir kitlede bireyin gerçek durumunu ortaya çıkarmak amacıyla kullanılır.
📊
Temel Bulgular & Veri:Gereç ve Yöntem: Helicobacter Pylori tanısında; HpSA, Kültür, CLO, Histoloji ve PCR gibi farklı testler kullanılmaktadır.
💡
Sonuç & Katkı:Bulgular: Bayesci çıkarsama yapıldığında hastalık ile ilgili prevalans bilgisi ve önsel bilgi dikkate alındığından tanı testine ait pozitif ve negatif kestirim değerlerine ait sonuçların daha güvenilir olduğu saptanmıştır.
🔬Tür:Modelleme & Sayısal Simülasyon
📍Kapsam:Genişletilmiş Akademik Örneklem
⚙️Değişkenler:Bayes yaklaşımı · altın standart test · tanı testleri

Özet

Amaç: Tanı testleri, hasta ve sağlıklı bireylerin oluşturduğu heterojen bir kitlede bireyin gerçek durumunu ortaya çıkarmak amacıyla kullanılır. Bu çalışmada, altın standart test yokluğunda, Bayesci yaklaşım ile ilgilenilen tanı testine ait doğruluk ölçütlerini elde etmek ve diğer yöntemlerle karşılaştırması amaçlanmıştır. Gereç ve Yöntem: Helicobacter Pylori tanısında; HpSA, Kültür, CLO, Histoloji ve PCR gibi farklı testler kullanılmaktadır. Bu çalışmada, Bayesci yaklaşımla parametre tahminlerinin elde edilmesinde önsel bilgileri (prevalans, duyarlılık vs.) içeren modeller oluşturulmuştur. Çalışmada bu tanı testlerinin doğruluklarının saptanmasında ortaya çıkabilen kesin olmayan altın standart yanlılığının düzeltilmesi amacıyla Bayesci yöntemler kullanılmıştır. Bu amaçla H. Pylori ile ilgili bir uzmanlık tezine ait veriler WinBUGS ve R paket programları yardımıyla analiz edilmiştir. Bulgular: Bayesci çıkarsama yapıldığında hastalık ile ilgili prevalans bilgisi ve önsel bilgi dikkate alındığından tanı testine ait pozitif ve negatif kestirim değerlerine ait sonuçların daha güvenilir olduğu saptanmıştır. Kestirim değerlerine benzer şekilde duyarlılık ve seçicilik değerleri içinde güvenilir sonuçlar elde edilmiştir. Bayesci yaklaşım ile elde edilen güvenilir aralık önsel bilgi kullanıldığında daralmıştır. Sonuç: Altın standardın olmadığı durumlarda prevalans gibi önsel bilgileri kullanan Bayesci yaklaşımlar klinisyenler için tanıda kolaylık sağlayacaktır.

Abstract

Purpose: Diagnostic tests are used for defining the disease status of person in a heterogeneous population which consists of healthy and diseased people. In this study, it was aimed to obtain the accuracy measures of the diagnostic test with the Bayesian approach when there was no gold standard test, and to compare it with other methods. Materials and Methods: In the diagnosis of Helicobacter Pylori, different tests are used such as HpSA, Culture, CLO, Histology and PCR. In this study, models containing a priori information (prevalence, sensitivity, etc.) were created to obtain parameter estimations with the Bayesian approach. Bayesian methods were used to correct the imperfect gold standard bias that may occur in determining the accuracy of these diagnostic tests. For this purpose, the data of a medical thesis on H. Pylori were analyzed with the help of WinBUGS and R package programs. Results: When Bayesian inference is made, the results of the positive and negative predictive values of the diagnostic test were found to be more reliable, since the prevalence and a priori information about the disease were taken into account. Similar to the predictive values, reliable results were obtained for sensitivity and specificity values. The credible interval obtained by using Bayesian approach is narrowed when a prior information is used. Conclusion: In the absence of a gold standard, Bayesian approaches using a prior information such as prevalence and diagnostic test information could facilitate diagnosis for clinicians.

🔖

Bu Makaleye Atıf Yap

ARSLAN, Y. K. (2021). Altın standart test yokluğunda tanısal doğruluk ölçütlerinin Bayesci yaklaşım ile tahmini: Helicobacter Pylori verisi uygulaması. Cukurova Medical Journal, Cilt: 46 - Sayı: 4, 1548–1557. https://ajindex.com/articles/407117

📄 Tam Metin PDF Okuyucu

📄

PDF görüntüleyici hazırlanıyor...

Kaynakça (18)

  1. Reid MC, Lachs MS, Feinstein AR. Use of methodological standards in diagnostic test research: getting better but still not good. JAMA. 1995;274:645- 51
  2. Genç Y. Tanı testi çalışmalarında metodolojik standartların kullanılması. Ankara Üniversitesi Tıp Fakültesi Mecmuası. 2003;56:259-64
  3. Hadgu A. The discrepancy in discrepant analysis. Lancet. 1996;348:592-3
  4. Zhou XH, Obuchowski NA, McClish DK. Statistical Methods in Diagnostic Medicine. New York, Wiley, 2002
  5. Joseph L, Gyorkos T W, Coupal L. Bayesian estimation of disease prevalence and the parameters of diagnostic tests in the absence of a gold standard. Am J Epidemiol. 1995;141:263-72
  6. Dendukuri N, Rahme E, Bélisle P, Joseph L. Bayesian sample size determination for prevalence and diagnostic test studies in the absence of a gold standard test. Biometrics. 2004;60:388-97
  7. Dendukuri N, Joseph L. Bayesian approaches to modeling the conditional dependence between multiple diagnostic tests. Biometrics. 2001;158-67
  8. Dendukuri N, Rahme E, Bélisle P, Joseph L. Bayesian sample size determination for prevalence and diagnostic test studies in the absence of a gold standard test. Biometrics. 2004;60:388-97
  9. Joseph L, Gyorkos, TW. inferences for likelihood ratios in the absence of a" gold standard". Med Decis Making. 1996;16:412-17
  10. Lesaffre E, Lawson AB. Bayesian Biostatistics. New York, Wiley, 2012 11. Broemeling LD. Bayesian biostatistics and diagnostic medicine. CRC Press. 2007
  11. Bayes T. An essay towards solving a problem in the doctrine of chances. By the late Rev. Mr. Bayes, FRS communicated by Mr. Price, in a letter to John Canton, AMFR S. Philos Trans R Soc Lond. 1763;53:370-418
  12. Ashby D. Bayesian statistics in medicine: a 25 year review. Stat Med. 2006;25:3589-631
  13. Clayton D, Kaldor J. Empirical Bayes estimates of age-standardized relative risks for use in disease mapping. Biometrics. 1987;43:671-81
  14. Broemeling LD. Bayesian Methods for Measures of Agreement. CRC Press. 2009
  15. Koçak F. Helicobacter pylori infeksiyonunda yeni bir tanı yöntemi olan stool antijen testinin değerlendirilmesi (Tıpta Uzmanlık Tezi). Adana, Çukurova Üniversitesi, 2002
  16. WinBUGS, MRC Biostatistics Unit Cambridge Biomedical Campus. Cambridge Institute of Public Health
  17. IBM SPSS Statistics for Windows, Version 20.0. Armonk, NY:IBM Corp. IBM Corp. Released. 2011
  18. R Core Team (2020). R: A language and environment for statistical computing. R Foundation for Statistical Computing,