Dergiler / İstanbul Tıp Fakültesi Dergisi / 2021 / Cilt: 84 - Sayı: 3

OKÜLT HEPATİT B VİRÜSÜNÜN GENOTİP, SUBGENOTİP VE SUBTİP ANALİZİ

ANALYSIS OF GENOTYPE, SUBGENOTYPE AND SEROTYPE OF OCCULT HEPATITIS B VIRUS

Sayfa
402–410
Yayın Tarihi
2021-07-31
DOI
—
🏛️Bu makalenin bibliyografik verileri ve tam metin bağlantısı DergiPark üzerinden sağlanmıştır.
DergiPark Kaydı ↗
✨

Yapay Zeka Hızlı Bakış & Çıkarımlar

AI Insight
⚡ TL;DR(1 Cümlede Hızlı Çıkarım)

Bulgular: Bu çalışmada OBI ve kronik hepatit B hastalarından izole edilen HBV’lerin tümününün genotipi D, subgenotipler sırasıyla HBV/D1 (%75,5), HBV/D2 (%6,1) ve HBV/D3 (%18,4) serotipler sırasıyla ayw2 (%73,5) ve ayw3 (%26,5) olarak belirlenmiştir.

📌 3 Maddede Bu Makale

🎯
Amaç & Hipotez:Amaç: Okült Hepatit B Virus (HBV) enfeksiyonu (Occult HBV infection; OBI) mevcut serolojik testler ile HBV yüzey antijeni (Surface antigen; HBsAg) negatif tespit edilen bireylerin karaciğerinde HBV genomunun uzun süreli persistan varlığı ile karakterizedir.
📊
Temel Bulgular & Veri:Gereç ve Yöntem: Çalışmaya HBsAg negatif farklı klinik endikasyonlar nedeniyle karaciğer parankim biyopsisi gerçekleştirilen hastaların karaciğer biyopsi örneklerinde Nested PCR yöntemiyle HBV DNA varlığı tanımlanan 32 OBI tanılı hasta ile 17 kronik hepatit B hastası dahil edildi.
💡
Sonuç & Katkı:Bulgular: Bu çalışmada OBI ve kronik hepatit B hastalarından izole edilen HBV’lerin tümününün genotipi D, subgenotipler sırasıyla HBV/D1 (%75,5), HBV/D2 (%6,1) ve HBV/D3 (%18,4) serotipler sırasıyla ayw2 (%73,5) ve ayw3 (%26,5) olarak belirlenmiştir.
🔬Tür:Araştırma Makalesi
📍Kapsam:Genişletilmiş Akademik Örneklem
⚙️Değişkenler:OBI · Genetik varyasyon · Genotip

Özet

Amaç: Okült Hepatit B Virus (HBV) enfeksiyonu (Occult HBV infection; OBI) mevcut serolojik testler ile HBV yüzey antijeni (Surface antigen; HBsAg) negatif tespit edilen bireylerin karaciğerinde HBV genomunun uzun süreli persistan varlığı ile karakterizedir. Bu çalışmada OBI tanılı hastalardan elde edilen HBV’lerin genotip, subgenotip ve subtip profillerinin karakteristiğinin irdelenmesi amaçlanmıştır. Gereç ve Yöntem: Çalışmaya HBsAg negatif farklı klinik endikasyonlar nedeniyle karaciğer parankim biyopsisi gerçekleştirilen hastaların karaciğer biyopsi örneklerinde Nested PCR yöntemiyle HBV DNA varlığı tanımlanan 32 OBI tanılı hasta ile 17 kronik hepatit B hastası dahil edildi. HBV S gen MHR bölgesini hedefleyen DNA fragmanları nested PCR kullanılarak amplifiye edildi. HBV’nin genotip, subgenotip ve subtip/serotiplerinin belirlemek için Sanger sekans metodu kullanıldı. Bulgular: Bu çalışmada OBI ve kronik hepatit B hastalarından izole edilen HBV’lerin tümününün genotipi D, subgenotipler sırasıyla HBV/D1 (%75,5), HBV/D2 (%6,1) ve HBV/D3 (%18,4) serotipler sırasıyla ayw2 (%73,5) ve ayw3 (%26,5) olarak belirlenmiştir. OBI’li hastaların %28,1’nin subgenotipi HBV/D3 olarak belirlenmesine karşın kronik hepatit B hastalarının hiç birinde HBV/D3 subgenotipi saptanmamıştır. Sonuç: Subgenotip HBV/D3’ün viral biyogenezin dinamiği üzerindeki potansiyel etkileri HBsAg negatifliği ve düşük replikasyon yetkinliği ile karakterize OBI ile ilişkili olabilir.

Abstract

Objective: Occult hepatitis B infection (OBI) can be characterized by the long-term persistence of HBV DNA in the liver of individuals who test negative for the hepatitis B surface antigen (HBsAg) using the currently available assays. This study aimed to evaluate genotype, subgenotype and subtype profiles of HBVs obtained from patients with OBI. Material and Method: The study included 32 patients with OBI who were diagnosed with HBV DNA by Nested PCR method in liver biopsy samples of patients who underwent liver parenchymal biopsy due to HBsAg negative different clinic indications and 17 chronic hepatitis B patients. The MHR region of the HBV S gene was amplified using nested PCR. Sanger sequencing method was used to determine the genotype, subgenotypes and subtype/serotype of HBV. Results: In this study it was determined that the genotypes of all HBVs isolated from OBI and chronic hepatitis B patients were HBV/D, subgenotypes were respectively HBV/ D1 (75.5%), HBV/ D2 (6.1%) and HBV/D3 (18.4%), serotypes were respectively ayw2 (73.5%) and ayw3 (26.5%). Although the subgenotype of 28.1% of patients with OBI was determined as HBV/D3, none of the chronic hepatitis B patients had the HBV/D3 subgenotype. Conclusion: The potential effects of subgenotype HBV/D3 on the dynamics of viral biogenesis may be associated with OBI, characterized by low replication competence and HBsAg negativity.

🔖

Bu Makaleye Atıf Yap

ÇAKAL, B., ATASOY, A., ÇAVUŞ, B., ÖRMECİ, A., PODA, M., BULAKÇI, M., GÜLLÜOĞLU, M., GÜNVER, M. G., AKYÜZ, F. (2021). OKÜLT HEPATİT B VİRÜSÜNÜN GENOTİP, SUBGENOTİP VE SUBTİP ANALİZİ. İstanbul Tıp Fakültesi Dergisi, Cilt: 84 - Sayı: 3, 402–410. https://ajindex.com/articles/373278

📄 Tam Metin PDF Okuyucu

📄

PDF görüntüleyici hazırlanıyor...

Kaynakça (16)

  1. Revill PA, Chisari FV, Block JM, Dandri M, Gehring AJ, Guo H, et al. Lancet Gastroenterol. Hepatol 2019
  2. Raimondo G, Locarnini S, Pollicino T, Levrero M, Zoulim F, Lok AS, and the Taormina Workshop on Occult HBV Infection Faculty Members. Update of the statements on biology and clinical impact of occult hepatitis B virus infection. J Hepatol 2019
  3. 71(2):397-408. [CrossRef] 3. Raimondo G, Allain JP, Brunetto MR, Buendia MA, Chen DS, Colombo M, et al. Statements from the Taormina expert meeting on occult hepatitis B virus infection. J Hepatol 2008
  4. [CrossRef] 4. Torbenson M, Thomas DL. Occult hepatitis B. Lancet Infect Dis 2002
  5. [CrossRef] 5. Chemin I, Trepo C. Clinical impact of occult HBV infections. J Clin Virol 2005
  6. [CrossRef] 6. Pondé RAA. Molecular mechanisms underlying HBsAg negativity in occult HBV infection. Eur J Clin Microbiol Infect Dis 2015
  7. [CrossRef] 7. Pollicino T, Raimondo G. Occult Hepatitis B Infection. Journal of Hepatology 2014
  8. [CrossRef] 8. Raimondo G, Caccamo G, Filomia R, Pollicino T. Occult HBV infection. Semin Immunopathol 2013
  9. [CrossRef] 9. Lugoboni F, Quaglio G, Civitelli P, Mezzelani P. Bloodborne viral hepatitis infections among drug users: the role of vaccination. Int J Environ Res Public Health 2009
  10. 6(1):400-13. [CrossRef] 10. Chen BF, Chen PJ, Jow GM, Sablon E, Liu CJ, Chen DS, et al. High prevalence of mixed genotype infections in hepatitis B virus infected intravenous drug users. J Med Virol 2004
  11. 74(4):536-42. [CrossRef] 11. Locarnini S, Zoulim F. Molecular genetics of HBV infection Antivir Ther 2010
  12. [CrossRef] 12. Seddigh-Tonekaboni S, Waters JA, Jeffers S, Gehrke R, Ofenloch B, Horsch A, et al. Effect of variation in the common “a” determinant on the antigenicity of hepatitis B surface antigen. J Med Virol 2000
  13. [CrossRef] 13. Waters J, Kennedy M, Voet P, Hauser P, Petre J, Carman W, et al. Loss of the common ‘a’ determinant of hepatitis B surface antigen by a vaccine-induced escape mutant. J Clin Invest 1992
  14. [CrossRef] 14. Osiowy C. Detection of HBsAg mutants. J Med Virol 2006
  15. [CrossRef] 15. Huang CH, Yuan Q, Chen PJ, Zhang YL, Chen CR, Zheng QB, et al. Influence of mutations in hepatitis B virus surface protein on viral antigenicity and phenotype in occult HBV strains from blood donors. Journal of Hepatology 2012
  16. [CrossRef] 16. McMahon, BJ. The influence of hepatitis B virus genotype and subgenotype on