Dergiler / Trakya Üniversitesi Tıp Fakültesi Dergisi / 2010 / Cilt: 27 - Sayı: 2

Identification of candida species from blood cultures with fluorescent in situ hybridization (FISH), polymerase chain reaction-restriction fragment length polymorphism (PCR-RFLP) and conventional methods

Kan kültürü örneklerinden candida türlerinin floresan ın situ hibridizasyon (FISH), polimeraz zincir reaksiyonu-restriksiyon fragment uzunluk polimorfizmi (PCR-RFLP) ve konvansiyonel yöntemlerle identifikasyonu

Sayfa
183–191
DOI
—
🏛️Bu makalenin bibliyografik verileri ve tam metin bağlantısı DergiPark üzerinden sağlanmıştır.
DergiPark Kaydı ↗
✨

Yapay Zeka Hızlı Bakış & Çıkarımlar

AI Insight
⚡ TL;DR(1 Cümlede Hızlı Çıkarım)

Gereçler ve Yöntemler: Candida türlerininin identifikasyonu için 325 kan kültürü pozitif örnekten maya pozitif olan 50 örnek ile kan kültürü negatif 50 örnek FISH, PCR-RFLP ve konvansiyonel yöntemlerle incelendi Bulgular: Her üç yöntemde tek tür Candida identifikasyonunda uyumlu idi (p<0.001).

📌 3 Maddede Bu Makale

🎯
Amaç & Hipotez:Amaç: Kan kültürlerinden Candida türlerinin doğru ve hızlı identifikasyonu fungal kan dolaşımı infeksiyonlarla ilgili mortalite ve morbiditeyi azaltmak ve etkili antifungal tedavi sağlamak için önemlidir.
📊
Temel Bulgular & Veri:Gereçler ve Yöntemler: Candida türlerininin identifikasyonu için 325 kan kültürü pozitif örnekten maya pozitif olan 50 örnek ile kan kültürü negatif 50 örnek FISH, PCR-RFLP ve konvansiyonel yöntemlerle incelendi Bulgular: Her üç yöntemde tek tür Candida identifikasyonunda uyumlu idi (p<0.001).
💡
Sonuç & Katkı:Ancak FISH birden fazla türle oluşan kandidemilerin belirlenmesinde daha uygun bir yöntemdir.
🔬Tür:Araştırma Makalesi
📍Kapsam:50 örnek
⚙️Değişkenler:Alan Parametreleri

Özet

Amaç: Kan kültürlerinden Candida türlerinin doğru ve hızlı identifikasyonu fungal kan dolaşımı infeksiyonlarla ilgili mortalite ve morbiditeyi azaltmak ve etkili antifungal tedavi sağlamak için önemlidir. Bu çalışmada, kan kültürü örneklerinden Candida türlerinin floresan in situ hibridizasyon (FISH), polimeraz zincir reaksiyonu-restriksiyon fragment uzunluk polimorfizmi (PCR-RFLP) ve konvansiyonel yöntemlerle identifikasyonu amaçlandı. Gereçler ve Yöntemler: Candida türlerininin identifikasyonu için 325 kan kültürü pozitif örnekten maya pozitif olan 50 örnek ile kan kültürü negatif 50 örnek FISH, PCR-RFLP ve konvansiyonel yöntemlerle incelendi Bulgular: Her üç yöntemde tek tür Candida identifikasyonunda uyumlu idi (p<0.001). Ancak birden fazla Candida türlerinin identifikasyonunda FISH ve PCR-RFLP, konvansiyonel yöntemlere göre daha duyarlı bulundu (p<0.001). Ayrıca, FISH kan kültürü pozitif örneklerden Candida türlerinin identifikasyonunda diğer iki yönteme göre daha hızlı ve ucuzdu. Birden fazla türle oluşan kandidemi oranı FISH, PCR-RFLP ve konvansiyonal yöntemle sırasıyla %20, %6 ve %4 olarak bulundu. Sonuç: Kan kültürü pozitif örneklerden Candida türlerinin hızlı identifikasyonunda PCR-RFLP ve FISH yöntemi tercih edilebilir. Ancak FISH birden fazla türle oluşan kandidemilerin belirlenmesinde daha uygun bir yöntemdir.

Abstract

Objectives: Rapid and accurate identification of Candida species from blood cultures is crucial to ensure effective antifungal therapy and to reduce the morbidity and mortality associated with bloodstream fungal infections. In this study, we aimed to identify Candida spp. from blood culture samples with fluorescent in situ hybridization (FISH), polymerase chain reaction-restriction fragment length polymorphism (PCR-RFLP) and conventional methods. Materials and Methods: A total of 50 yeast positive samples out of 325 blood culture positive samples and 50 blood culture negative samples were examined by FISH, PCRRFLP and conventional methods to identify Candida spp. Results: All three methods generally were compatible for identification of single-species Candida spp. (p<0.001). But, FISH and PCR-RFLP for the identification of multi-species Candida spp. were found more compatible than conventional methods (p<0.001). Besides, FISH is cheaper and quicker than the other two methods in the identification of Candida spp. from blood culture positive samples. The rates of multi-species candidemia with FISH, PCR-RFLP and conventional methods were 20%, 6% and 4%, respectively. Conclusion: Both PCR-RFLP and FISH methods might be preferred for the rapid identification of Candida spp. from blood culture positive samples. However, FISH is a more suitable method for the detection of multi-species candidemia.

🔖

Bu Makaleye Atıf Yap

BÖREKÇİ, G., ERSÖZ, G., OTAĞ, F., ÖZTURHAN, H., ŞEN, S., SÖYLEMEZ, F., AKALIN, H., ÖZKUL, Y., EMEKDAŞ, G. (2010). Identification of candida species from blood cultures with fluorescent in situ hybridization (FISH), polymerase chain reaction-restriction fragment length polymorphism (PCR-RFLP) and conventional methods. Trakya Üniversitesi Tıp Fakültesi Dergisi, Cilt: 27 - Sayı: 2, 183–191. https://ajindex.com/articles/369784

📄 Tam Metin PDF Okuyucu

📄

PDF görüntüleyici hazırlanıyor...

Kaynakça (12)

  1. Bedini A, Venturelli C, Mussini C, Guaraldi G, Codeluppi M, Borghi V, et al. Epidemiology of candidaemia and antifungal susceptibility patterns in an Italian tertiary-care hospital. Clin Microbiol Infect 2006;12:75-80
  2. Pfaller MA, Diekema DJ. Epidemiology of invasive candidiasis: a persistent public health problem. Clin Microbiol Rev 2007;20:133-63
  3. Yamamura DL, Rotstein C, Nicolle LE, Ioannou S. Candidemia at selected Canadian sites: results from the Fungal Disease Registry, 1992-1994. Fungal Disease Registry of the Canadian Infectious Disease Society. CMAJ 1999;160:493-9
  4. Edmond MB, Wallace SE, McClish DK, Pfaller MA, Jones RN, Wenzel RP. Nosocomial bloodstream infections in United States hospitals: a three-year analysis. Clin Infect Dis 1999;29:239-44
  5. Wisplinghoff H, Bischoff T, Tallent SM, Seifert H, Wenzel RP, Edmond MB. Nosocomial bloodstream infections in US hospitals: analysis of 24,179 cases from a prospective nationwide surveillance study. Clin Infect Dis 2004;39:309-17
  6. Pfaller MA, Diekema DJ, Jones RN, Sader HS, Fluit AC, Hollis RJ, et al. International surveillance of bloodstream infections due to Candida species: frequency of occurrence and in vitro susceptibilities to fluconazole, ravuconazole, and voriconazole of isolates collected from 1997 through 1999 in the SENTRY antimicrobial surveillance program. J Clin Microbiol 2001;39:3254-9
  7. Bassetti M, Righi E, Costa A, Fasce R, Molinari MP, Rosso R, et al. Epidemiological trends in nosocomial candidemia in intensive care. BMC Infect Dis 2006;6:21
  8. Hope W, Morton A, Eisen DP. Increase in prevalence of nosocomial non-Candida albicans candidaemia and the association of Candida krusei with fluconazole use. J Hosp Infect 2002;50:56-65
  9. Clancy CJ, Staley B, Nguyen MH. In vitro susceptibility of breakthrough Candida bloodstream isolates correlates with daily and cumulative doses of fluconazole. Antimicrob Agents Chemother 2006;50:3496-8
  10. Kempf VA, Mändle T, Schumacher U, Schäfer A, Autenrieth IB. Rapid detection and identification of pathogens in blood cultures by fluorescence in situ hybridization and flow cytometry. Int J Med Microbiol 2005;295:47-55
  11. Rigby S, Procop GW, Haase G, Wilson D, Hall G, Kurtzman C, et al. Fluorescence in situ hybridization with peptide nucleic acid probes for rapid identification of Candida albicans directly from blood culture bottles. J Clin Microbiol 2002;40:2182-6
  12. Mycology. In: Forbes BA, Sahm DF, Weissfeld AS, editors. Bailey a