Dergiler / Tekirdağ Ziraat Fakültesi Dergisi / 2019 / Cilt: 16 - Sayı: 1

Bazı Korunga (Onobrychis viciifolia) Çeşit ve Popülasyonlarının Mikrosatellit Belirteçleri Kullanılarak Genetik Karakterizasyonu

Genetic Characterization of Sainfoin (Onobrychis viciifolia) Varieties and Populations Using Microsatellite Markers

Sayfa
51–60
DOI
—
🏛️Bu makalenin bibliyografik verileri ve tam metin bağlantısı DergiPark üzerinden sağlanmıştır.
DergiPark Kaydı ↗
✨

Yapay Zeka Hızlı Bakış & Çıkarımlar

AI Insight
⚡ TL;DR(1 Cümlede Hızlı Çıkarım)

Analiz edilen91 örnekte toplam 68 allel tespit edilmiştir.

📌 3 Maddede Bu Makale

🎯
Amaç & Hipotez:Ülkemizin özellikle İç ve Doğu Anadolu bölgelerinde yaygın bir şekilde yetiştiriciliği yapılan korunga (Onobrychis viciifoliaScop.) hayvan beslenmesinde, toprak yapısını iyileştirmede ve arılar için nektar kaynağı olarak önemli bir baklagildir.
📊
Temel Bulgular & Veri:Buçalışmada ülkemizin tescilli çeşitleri Özerbey ve Lütfübey’de, Kırşehir bölgesinden elde edilmiş iki yerel populasyonda(Kırşehir-1, Kırşehir-2) ve Bulgaristan’a ait Pleven populasyonunda 10 SSR lokusu kullanılarak çeşit ve populasyonlarıngenetik yapısı incelenmiştir.
💡
Sonuç & Katkı:Analiz edilen91 örnekte toplam 68 allel tespit edilmiştir.
🔬Tür:Araştırma Makalesi
📍Kapsam:91 örnek
⚙️Değişkenler:Baklagiller · Genetik çeşitlilik · Moleküler belirteçler

Özet

Ülkemizin özellikle İç ve Doğu Anadolu bölgelerinde yaygın bir şekilde yetiştiriciliği yapılan korunga (Onobrychis viciifoliaScop.) hayvan beslenmesinde, toprak yapısını iyileştirmede ve arılar için nektar kaynağı olarak önemli bir baklagildir. Buçalışmada ülkemizin tescilli çeşitleri Özerbey ve Lütfübey’de, Kırşehir bölgesinden elde edilmiş iki yerel populasyonda(Kırşehir-1, Kırşehir-2) ve Bulgaristan’a ait Pleven populasyonunda 10 SSR lokusu kullanılarak çeşit ve populasyonlarıngenetik yapısı incelenmiştir. Çalışmada kullanılan 10 SSR lokusunun tamamı polimorfik olarak saptanmıştır. Analiz edilen91 örnekte toplam 68 allel tespit edilmiştir. Genetik çeşitlilik parametrelerinden, lokus başına düşen ortalama allel sayısı(Na=1.365), etkili allel sayısı (Ne=1.348), Shannon Sabiti (I=0.322), Nei’nin genetik çeşitlilik değeri (h=0.210) ve Nei’nintarafsız çeşitlilik değeri (uh=0.222) hesaplanmıştır. Populasyonların genetik çeşitliliğinin büyük oranda (%92) populasyoniçerisinde olduğu, populasyonlar arası çeşitliliğin ise çok düşük olduğu (%8) gözlenmiştir. Çalışma sonucunda elde edilenUPGMA dendrogramına göre birbirine yakın bulunan Özerbey ve Lütfübey bir grup, Pleven ve Kırşehir-2 ayrı bir grup olarakbelirlenmiştir. Elde edilen sonuçlar türün genetik yapısı hakkında önemli bilgiler vermiştir.

Abstract

The sainfoin (Onobrychis viciifolia Scop.), which is widely grown in our country especially in the Central and Eastern Anatolianregions, is used for animal feed, improving the structure of soil and nectar source for bees. In this study, genetic structure of twocultivars (Özerbey and Lütfübey) and three populations (Pleven, Kırşehir-1 and Kırşehir-2) were investigated using 10 SSR loci.All of the SSR loci used in the study were polymorphic. A total of 68 alleles were identified in 91 samples analyzed. Geneticdiversity parameters such as; mean number of alleles per locus (Na=1.365), effective allele number (Ne=1.348), Shannoninformation index (I=0.322), Nei’s genetic diversity level (h=0.210), and Nei’s unbiased genetic diversity level (uh=0.222)were calculated. It was observed that the genetic diversity of the populations was mainly due to within population variation(92%) and the remaining portion was due to variation between populations (8%). According to the UPGMA dendrogramobtained from the study, Özerbey and Lütfübey occurred in one cluster, Pleven and Kırşehir-2 populations occurred in thesecond cluster. The results obtained from this study provided important information on the genetic structure of the studiedsainfoin populations.

🔖

Bu Makaleye Atıf Yap

ÖZKAN, S., BİLGEN, B. B. (2019). Bazı Korunga (Onobrychis viciifolia) Çeşit ve Popülasyonlarının Mikrosatellit Belirteçleri Kullanılarak Genetik Karakterizasyonu. Tekirdağ Ziraat Fakültesi Dergisi, Cilt: 16 - Sayı: 1, 51–60. https://ajindex.com/articles/366428

📄 Tam Metin PDF Okuyucu

📄

PDF görüntüleyici hazırlanıyor...

Kaynakça (12)

  1. Zarrabian, M., Majidi, M.M. 2015. Genetic diversity and relationships within and among Onobrychis species using molecular markers. Turkish Journal of Botany. 39: 681-692.
  2. Healey, A., Furtado, A., Cooper, T., Henry, R.J. 2014. Protocol: a simple method for extracting next-generation sequencing quality genomic DNA from recalcitrant plant species. Plant Methods. 10: 21. Zarrabian, M., Majidi, M.M., Ehtemam, M.H. 2013. Genetic diversity in a worldwide collection of sainfoin using morphological,anatomical, and molecular markers. Crop Science. 53: 2483-2496.
  3. Aktoklu, M. 1995. Türkiye’de Yetişen Onobrychis Miller (Fabaceae) Türlerinin Revizyonu. Doktora Tezi, İnönü Üniversitesi Fen Bilimleri Ens., Biyoloji Anabilim Dalı, 134 s. Avcı, S., İlhan, E., Erayman, M., Sancak, C. 2014. Analysis of Onobrychis genetic diversity using ssr markers from related legume species. The Journal of Animal & Plant Sciences. 24(2): 556-566.
  4. Bhattarai, S. 2017. Characterization of diverse germplasm of sainfoin (Onobrychis viciifolia Scop.) using agro-morphological traits and aflp molecular markers. Thesis Degree of Master of Science, Department of Plant Science, University of Saskatchewan, Saskatoon, Canada. Botstein, D., White, R.L., Skolnick, K., Davis, R.W. 1980. Construction of a Genetic Linkage Map in Man Using Restriction Fragment Length Polymorphism. American Journal of Human Genetics. 32: 314-331.
  5. Carbonero, C.H. 2011. Sainfoin (Onobrychis viciifolia), a forage legume with great potential for sustainable agriculture, an insight on its morphological, agronomical, cytological and genetic characterisation. Doctor of Philosophy Thesis, Faculty of Life Sciences, Manchaster, United Kindom. Demdoum, S., Munoz, F., Delgado, I., Valderrabano, J., Wunsch, A. 2012. EST-SSR cross amplification and genetic similarity in Onobrychis genus. Genetic Resources and Crop Evolution. 59: 253-260.
  6. Doyle, J.J., Doyle, J.I. 1990. Isolation of plant DNA from fresh tissue. Focus. 12: 13-15.
  7. Peakall, R., Smouse, P.E. 2006. GENALEX 6: Genetic analysis in excel. population genetic software for teaching and research. Molecular Ecology Notes. 6: 288-295.
  8. Elçi, Ş. 2005.
  9. Baklagil ve Buğdaygil Yem Bitkileri, T.C. Tarım ve Köyişleri Bakanlığı, s. 223-257,
  10. Ankara.
  11. Hejrankesh, N., Haghighi, A.R., Mousavizadeh, S.A., Rashidi, V. 2014. Evaluation of genetic diversity of sainfoin (Onobrychis viciifolia Scop.) landraces using RAPD markers. Journal of Current Research in Science. 2: 739-748.
  12. Kempf, K., Mora-Ortiz, M., S