Dergiler / European Journal of Biology / 2012 / Cilt: 71 - Sayı: 2

Türkiye’de baharatlarda Escherichia coli O157:H7’nin belirlenmesinde real-time PCR ve konvansiyonel kültürel yöntemin karşılaştırılması

Comparison of real-time PCR and conventional cultural methods to detect Escherichia coli O157:H7 in spices in Turkey

Sayfa
113–120
Yayın Tarihi
2012-12-25
DOI
—
🏛️Bu makalenin bibliyografik verileri ve tam metin bağlantısı DergiPark üzerinden sağlanmıştır.
DergiPark Kaydı ↗
✨

Yapay Zeka Hızlı Bakış & Çıkarımlar

AI Insight
⚡ TL;DR(1 Cümlede Hızlı Çıkarım)

Bunun yanında kültürel yöntemle sonuç 4 günde alınırken Real-Time PCR yöntemiyle sadece 20 saatte sonuç alınmıştır

📌 3 Maddede Bu Makale

🎯
Amaç & Hipotez:Bu çalışmada, baharatlarda E. coli O157:H7’nin belirlenmesinde Real-Time PCR ve kültürel yöntemlerinin karşılaştırılması için 66 farklı baharat örneği analiz edilmiştir.
📊
Temel Bulgular & Veri:Bunun için 66 farklı baharat örneği (ham madde) İzmir’in çeşitli yerlerinden temin edilmiştir.
💡
Sonuç & Katkı:Bunun yanında kültürel yöntemle sonuç 4 günde alınırken Real-Time PCR yöntemiyle sadece 20 saatte sonuç alınmıştır
🔬Tür:Araştırma Makalesi
📍Kapsam:Genişletilmiş Akademik Örneklem
⚙️Değişkenler:Kültürel yöntem · E. coli O157:H7 · real-time PCR

Özet

Bu çalışmada, baharatlarda E. coli O157:H7’nin belirlenmesinde Real-Time PCR ve kültürel yöntemlerinin karşılaştırılması için 66 farklı baharat örneği analiz edilmiştir. Bunun için 66 farklı baharat örneği (ham madde) İzmir’in çeşitli yerlerinden temin edilmiştir. Örneklerdeki toplam mikrobiyal yükün belirlenmesi için E. coli O157:H7 yanında toplam aerobik mezofilik bakteri, koliform, fekal koliform sayımları yapılmıştır ve Salmonella sp. varlığına bakılmıştır. Bütün örneklerde ortalama değerler aerobik mezofilik bakteri sayımı 5.1x103 -2.0x108 CFU/g ve koliform sayımı 8.0 x 102 CFU/g olarak bulunmuştur. Hiçbir örnekte Salmonella sp. bulunmamıştır. Kültürel yöntemle bütün örnekler E. coli O157:H7 bakımından negatif bulunurken Real-Time PCR yöntemiyle 4 tane örnek pozitif bulunmuştur. Bu çalışmada RealTime PCR yönteminin kültürel yönteme göre daha güvenilir olduğu gözlenmiştir. Bunun yanında kültürel yöntemle sonuç 4 günde alınırken Real-Time PCR yöntemiyle sadece 20 saatte sonuç alınmıştır

Abstract

In this study, 66 different spice samples were analyzed in order to compare Real-Time PCR and conventional cultural methods for the detection of E. coli O157:H7 in spices. Thus, 66 different spice samples (raw materials) were collected from various places in Izmir, Turkey. Conventional cultural methods included pre-enrichment step, selection step and confirmation step. The molecular method included two steps: pre-enrichment and Real-Time PCR step. Beside these methods, total aerobic mesophilic bacteria, coliform, fecal coliform in samples, were also counted and the presence of Salmonella sp. was investigated in order to determine total microbial load in samples. The results showed that aerobic mesophilic bacteria counts were 5.1x103 -2.0x108 CFU/g, coliform counts were 8.0 x 102 CFU/g for the average values of all samples. Salmonella sp. was not found in any of the samples.In four samples E. coli O157:H7 positive by Real-Time PCR were found while all of the samples were negative by cultural methods. We observed that the results of Real-Time PCR were more reliable than conventional methods. Furthermore, the results were obtained in only 20 hours by Real-Time PCR method whereas conventional cultural method was completed in 4 days. Keywords: Cultural method, E. coli O157:H7, real-time PCR, spice

🔖

Bu Makaleye Atıf Yap

OZKİZİLCİK, A., ATES, M., CERCİ, B. (2012). Türkiye’de baharatlarda Escherichia coli O157:H7’nin belirlenmesinde real-time PCR ve konvansiyonel kültürel yöntemin karşılaştırılması. European Journal of Biology, Cilt: 71 - Sayı: 2, 113–120. https://ajindex.com/articles/33281

📄 Tam Metin PDF Okuyucu

📄

PDF görüntüleyici hazırlanıyor...

Kaynakça (12)

  1. Akkaya L. and Alişarlı M. (2006) Afyonkarahisar’da tüketime sunulan peynirlerde Listeria mono- cytogenes ve Salmonella spp. varlığının be- lirlenmesi. Yüzüncü Yıl Üniversitesi Veteriner Fakültesi Dergisi, 17: 87-91.
  2. Alişarlı M. and Akman HN. (2004) Perakende satılan kıymaların Escherichia coli O157:H7 yönünden incelenmesi. Yüzüncü Yıl Üniversitesi Veteriner Fakültesi Dergisi, 15: 65-69.
  3. Ateş M., Özkızılcık A. and Tabakoğlu C. (2011) Microbiological Analysis of Stuffed Mussels Sold in The Streets. Indian Journal of Micro- biology, 51: 350-354.
  4. Bhagwat A.A. (2002) Simultaneous detection of Escherichia coli O157:H7, Listeria monocyto- genes and Salmonella strains by real-time PCR. International Journal of Food Microbiology, 84: 217-224.
  5. Catarame T.M.G., O’hanlon K.A., McDowell D.A., Blair I.S. and Duffy G. (2006) Comparison of a Real-Time Polymerase Reaction Assay with a cultural method for the detection of Salmonella in retail meat samples. Journal of Food Safety, 26: 1-15.
  6. Chigbu P., Gordon S. and Strange R.T. (2005) Fe- cal coliform bacteria disapperance rates in a North-central Gulf of Mexico estuary. Estuarine, Coastal and Shelf Science, 65: 309-318.
  7. Chui S. (2004) Detection and characterization of Esherichia coli O157:H7 and Salmonella in food, PhD, University of Maryland pp. 3. Ellingson E.L.J., Koziczkowski J.J., Anderson L.J., Carlson A.S. and Sharma K.V. (2005) Rapid PCR detection of enterohemorrhagic Esch- erichia coli (EHEC) in bovine food products and feces. Molecular Cell Probes, 19: 213-217.
  8. Espy M.J., Uhl J.R., Sloan L.M., Buckwalter S.P., Jones M.F., Vetter E.A., Yao J.D.C., Wengenack N.L. and Rosenblatt J.E. (2006) Real-Time PCR in clinical microbiology: Applications for rou- tine laboratory testing. Clinical Microbiology Reviews, 19: 165-256.
  9. Feng P., Weagant S.D., Grant M.A. and Burkhardt W. (2002) BAM: Enumeration of Escherichia coli and the Coliform Bacteria. Bacteriologi- cal Analytical Manual 8th Edition,
  10. Revision A, Chapter 4. Fitzmaurice J. (2008) Detection of verotoxin genes VT 1 and VT 2 in Escherichia coli O157:H7 in minced beef using Immunocapture and Real- Time PCR. In: Louise O’Connor (Ed.) Diag- nostic Bacteriology Protocols, New Zealand 345: 91-96.
  11. Geissler K., Manafi M., Amoros I. and Alonso J.L. (2000) Quantitative determination of total co- liforms and Escherichia coli in marine waters with chromogenic and fluorogenic media. Jour- nal of Applied Microbiology 88: 280-285.
  12. Islam A.M., Heuvelink A.E., Talıkder A.K. and Boer E