KaydedilenlerDerginizi ekleyin

Dergiler / Türk Tarım - Gıda Bilim ve Teknoloji dergisi / 2017 / Cilt: 5 - Sayı: 1

Süt Ürünlerindeki Laktik Asit Bakterilerinin Moleküler Yöntemlerle Dinamiklerinin Analizi ve Populasyonlarının Tanımlanması

Analyses of Dynamics in Dairy Products and Identification of Lactic Acid Bacteria Population by Molecular Methods

AYTÜL SOFU
Sayfa
6–13
DOI
—
🏛️Bu makalenin bibliyografik verileri ve tam metin bağlantısı DergiPark üzerinden sağlanmıştır.
DergiPark Kaydı ↗
✨

Yapay Zeka Hızlı Bakış & Çıkarımlar

AI Insight
⚡ TL;DR(1 Cümlede Hızlı Çıkarım)

Bu yazıda süt ürünlerinde LAB türlerinin belirlenmesi için moleküler yöntemleri kullanan çalışmaları kapsamaktadır.

📌 3 Maddede Bu Makale

🎯
Amaç & Hipotez:Farklı ekolojik nişlere sahip Laktik asit bakterileri (LAB) yaygın olarak fermente et, sebze, süt ürünleri ve tahıllar yanı sıra mayalanmış içkilerde de bulunmaktadır.
📊
Temel Bulgular & Veri:LAB'ların taksonomik incelemelerinde; 16S ribozomal RNA (rRNA) gen dizilerinin analizine dayalı rep-PCR analizi, farklı boyutlarda enzimler ile kesilmiş DNA fragmanlarının analizi (RFLP), rastgele çoğaltılmış polimorfik DNA analizi (RAPD), düşük sıcaklıklarda rastgele çoğaltılmış ve DNA'nın çoğaltılmış parçauzunluk polimorfizm analizi (AFLP)-PCR kullanılmaktadır.
💡
Sonuç & Katkı:Bu yazıda süt ürünlerinde LAB türlerinin belirlenmesi için moleküler yöntemleri kullanan çalışmaları kapsamaktadır.
🔬Tür:Araştırma Makalesi
📍Kapsam:Genişletilmiş Akademik Örneklem
⚙️Değişkenler:Alan Parametreleri

Özet

Farklı ekolojik nişlere sahip Laktik asit bakterileri (LAB) yaygın olarak fermente et, sebze, süt ürünleri ve tahıllar yanı sıra mayalanmış içkilerde de bulunmaktadır. LAB'lar probiyotik özelliklerinden dolayı starter kültür olarak süt endüstrisinde kullanılan bakterilerin en önemli grubudur. LAB'ların taksonomik incelemelerinde; 16S ribozomal RNA (rRNA) gen dizilerinin analizine dayalı rep-PCR analizi, farklı boyutlarda enzimler ile kesilmiş DNA fragmanlarının analizi (RFLP), rastgele çoğaltılmış polimorfik DNA analizi (RAPD), düşük sıcaklıklarda rastgele çoğaltılmış ve DNA'nın çoğaltılmış parçauzunluk polimorfizm analizi (AFLP)-PCR kullanılmaktadır. Ayrıca LAB'ların tanımlanmasında kullanılan kültür bağımsız yöntemler, darbe etkili alan jel elektroforez (PFGE), denatüre gradyan jel elektroforez (DGGE), termal gradyan jel elektroforez (DGGE) ve floresan in situ hibridizasyon (FISH) yöntemleri bulunmaktadır. Bunun yanı sıra, son yıllarda yeni nesil dizi (NGS) teknikleri ve Pirosekanslama gelecekte kullanılan en önemli yöntemlerden biri olacaktır. Bu yazıda süt ürünlerinde LAB türlerinin belirlenmesi için moleküler yöntemleri kullanan çalışmaları kapsamaktadır.

Abstract

Lactic acid bacteria (LAB) with different ecological niches are widely seen in fermented meat, vegetables, dairy products and cereals as well as in fermented beverages. Lactic acid bacteria are the most important group of bacteria in dairy industry due to their probiotic characteristics and fermentation agents as starter culture. In the taxonomy of the lactic acid bacteria; by means of rep-PCR, which is the analysis of repetitive sequences that are based on 16S ribosomal RNA (rRNA) gene sequence, it is possible to conduct structural microbial community analyses such as Restriction Fragment Length Polymorphism (RFLP) analysis of DNA fragments of different sizes cut with enzymes, Random Amplified Polymorphic DNA (RAPD) polymorphic DNA amplified randomly at low temperatures and Amplified Fragment-Length Polymorphism (AFLP)-PCR of cut genomic DNA. Besides, in the recent years, non-culture-based molecular methods such as Pulse Field Gel Electrophoresis (PFGE), Denaturing Gradient Gel Electrophoresis (DGGE), Thermal Gradient Gel Electrophoresis (TGGE), and Fluorescence In-situ Hybridization (FISH) have replaced classical methods once used for the identification of LAB. Identification of lactic acid bacteria culture independent regardless of the method will be one of the most important methods used in the future pyrosequencing as a Next Generation Sequencing (NGS) techniques. This paper reviews molecular-method based studies conducted on the identification of LAB species in dairy products.

🔖

Bu Makaleye Atıf Yap

SOFU, A. (2017). Süt Ürünlerindeki Laktik Asit Bakterilerinin Moleküler Yöntemlerle Dinamiklerinin Analizi ve Populasyonlarının Tanımlanması. Türk Tarım - Gıda Bilim ve Teknoloji dergisi, Cilt: 5 - Sayı: 1, 6–13. https://ajindex.com/articles/331581

📄 Tam Metin PDF Okuyucu

📄

PDF görüntüleyici hazırlanıyor...

Kaynakça (7)

  1. References Albenzio M, Corbo MR, Rehman SU, Fox PF, De Angelis M, Corsetti A, Sevi A, Gobbetti M. 2001. Microbiological and biochemical characteristics of Canestrato Pugliese cheese made from rawmilk, pasteurized milk or by heating the curd in hot whey. International Journal of Food Microbiology. 67:35-48. Alegría A, Szczesny P, Mayo B, Bardowski J, Kowalczyk M. 2012. Biodiversity in Oscypek, a traditional Polish cheese, determined by culture-dependent and-independent approaches. Applied and Environmetal Microbiology. 78:1890-1898.
  2. Amann RI, Ludwig W, Schleifer KH. 1995. Phylogenetic identification and in situ detection of individual microbial cells without cultivation. Microbiology. Reviews. 59:143- 169. Amann R, Fuchs BM, Behrens S. 2001. The identification of microorganisms by fluorescence in situ hybridization. Current Opinion Biotechnology. 12:231-236.
  3. Ampe F, Ben Omar N, Moizan C, Wacher C, Guyot JP. 1999. Polyphasic study of the spatial distribution of microorganisms in Mexican pozol, a fermented maize dough, demonstrates the need for cultivation-independent methods to investigate traditional fermentations. Applied and Environmental Microbiology. 65:5464-5473.
  4. Ampe F, Miambi E. 2000. Cluster analysis, richness and biodiversity indexes derived from denaturing gradyan gel electrophoresis fingerprints of bacterial communities demonstrates that traditional maize fermentations are driven by the transformation process. International Journal of Food Microbiology. 60:91-97.
  5. Baruzzi F, Morea M, Matarante A, Cocconcelli PS. 2000. Changes in the Lactobacillus community during Ricotta Forte cheese natural fermentation. Journal of Applied Microbiology. 89:807-814. ben Omar N, Ampe F. 2000. Microbial community dynamics during production of the Mexican fermented maize dough pozol. Applied and Environmental Microbiology. 66:3664- 3673. Bouton Y, Guyot P, Beuvir E, Tailliez P, Grappin R. 2002. Use of PCR based method and PFGE for typing and monitoring homofermentative lactobacilli during Comtè cheese ripening. International Journal of Food Microbiology. 76:27- 38. Böttger EC. 1989. Rapid determination of bacterial ribosomal RNA sequences by direct sequencing of enzymatically amplified DNA. FEMS Microbiology Letter. 53:171-176.
  6. Callon C, Millet L, Montel MC. 2004. Diversity of lactic acid bacteria isolated from AOC Salers cheese. Journal of Dairy Research. 71:231-44.
  7. Cocconcelli PS, Parisi MG, Senini L, Bottazzi V. 1997. Use of RAPD and 16S rDNA sequencing for the st