Dergiler / Mikrobiyoloji Bülteni / 2004 / Cilt: 38 - Sayı: 3

Klinik örneklerden Mycobacterium tuberculosis saptanmasında Cobas Amplicor sistemi ve mikroskopik inceleme yöntemlerinin Bactec radyometrik yöntemi ile karşılaştırılması

Comparison of Cobas Amplicor system and microscopic examination with Bactec radiometric method for the detection of Mycobacterium tuberculosis in clinical samples

Sayfa
193–201
DOI
—
🏛️Bu makalenin bibliyografik verileri ve tam metin bağlantısı DergiPark üzerinden sağlanmıştır.
DergiPark Kaydı ↗
✨

Yapay Zeka Hızlı Bakış & Çıkarımlar

AI Insight
⚡ TL;DR(1 Cümlede Hızlı Çıkarım)

Bu çalışma sonucunda, tüberkülozun laboratuvar tanısında mikroskopik inceleme ve nükleik asit çoğaltma yöntemlerinin mutlaka kültür yöntemleriyle birlikte çalışılması ve değerlendirmelerin buna göre yapılması gerektiği sonucuna varılmıştır.

📌 3 Maddede Bu Makale

🎯
Amaç & Hipotez:Tüberküloz tüm dünya çapında çok önemli bir sağlık sorunu olmaya devam etmektedir.
📊
Temel Bulgular & Veri:Bu araştırmada Hacettepe Üniversitesi Erişkin Hastanesi Klinik Mikrobiyoloji Laboratuvarı'nda Temmuz 2002 ile Şubat 2004 tarihleri arasında tüberküloz tanısında Bactec radyometrik kültür sistemi referans alınarak, Ehrlich-Ziehl-Neelsen (EZN) boyama yöntemi ve Cobas Amplicor sistemi değerlendirilmiştir.
💡
Sonuç & Katkı:Bu çalışma sonucunda, tüberkülozun laboratuvar tanısında mikroskopik inceleme ve nükleik asit çoğaltma yöntemlerinin mutlaka kültür yöntemleriyle birlikte çalışılması ve değerlendirmelerin buna göre yapılması gerektiği sonucuna varılmıştır.
🔬Tür:Laboratuvar & Saha Deneyi
📍Kapsam:2002 Verileri
⚙️Değişkenler:Mikroskopi · Mycobacterium tuberculosis · Tüberküloz

Özet

Tüberküloz tüm dünya çapında çok önemli bir sağlık sorunu olmaya devam etmektedir. Tüberkülozun bulaş kaynağı özellikle basil çıkaran hastalar olduğu için toplum sağlığı açısından, hastaların başkalarına hastalığı bulaştırmadan önce saptanması ve hızla tedavisi esastır. Bu nedenle duyarlılık ve özgüllüğü yüksek, güvenilir tanı yöntemlerinin kullanılması gerekmektedir. Bu araştırmada Hacettepe Üniversitesi Erişkin Hastanesi Klinik Mikrobiyoloji Laboratuvarı'nda Temmuz 2002 ile Şubat 2004 tarihleri arasında tüberküloz tanısında Bactec radyometrik kültür sistemi referans alınarak, Ehrlich-Ziehl-Neelsen (EZN) boyama yöntemi ve Cobas Amplicor sistemi değerlendirilmiştir. Araştırma kapsamında Bactec radyometrik kültür sistemiyle toplam 2098 klinik örnek çalışılmış ve bu örneklerden 107 tanesinde (%5.1) M.tuberculosis saptanmıştır. EZN boyama yöntemi için özgüllük %98.5, duyarlılık %42.9, pozitif prediktif değer %62.1, negatif prediktif değer %96.9 bulunmuştur. Cobas Amplicor sistemi için ise özgüllük %99.3, duyarlılık %67.3, pozitif prediktif değer %83.5, negatif prediktif değer %98.4 olarak belirlenmiştir. Bu değerler, literatürde bildirilmiş olan değerlerle uyumludur. Bu çalışma sonucunda, tüberkülozun laboratuvar tanısında mikroskopik inceleme ve nükleik asit çoğaltma yöntemlerinin mutlaka kültür yöntemleriyle birlikte çalışılması ve değerlendirmelerin buna göre yapılması gerektiği sonucuna varılmıştır.

Abstract

Tuberculosis is still a major health problem all around the world. Since the patients with tuberculosis spread the infection by means of aerosols containing tuberculosis bacilli, it is critically important to detect these patients and start the treatment as soon as possible. Therefore there is a need for highly sensitive and specific reliable diagnostic methods. In this study, Ehrlich-Ziehl-Neelsen (EZN)staining method and Cobas Amplicor system were evaluated for the diagnosis of tuberculosis in comparison with the standard reference Bactec radiometric method. A total of 2098 clinical samples collected between July 2002 and February 2004 in Clinical Microbiology Laboratory of Hacettepe University Adult Hospital, were studied by Bactec radiometric system for diagnosis of tuberculosis and M.tuberculosis was detected in 107 (5.1%) samples. The specificity, sensitivity, positive and negative predictive values of EZN staining method were found to be 98.5%, 42.9%, 62.1% and 96.9%, respectively. The specificity, sensitivity, positive and negative predictive values of Cobas Amplicor system were detected as 99.3%, 67.3%, 83.5% and 98.4%, respectively. These results were in concordance with the results of previous studies. In conclusion, microscopic examination and nucleic acid amplification methods should always be used together with culture methods for the laboratory diagnosis of tuberculosis.

🔖

Bu Makaleye Atıf Yap

ALP, A., PINAR, A., HASÇELİK, G. (2004). Klinik örneklerden Mycobacterium tuberculosis saptanmasında Cobas Amplicor sistemi ve mikroskopik inceleme yöntemlerinin Bactec radyometrik yöntemi ile karşılaştırılması. Mikrobiyoloji Bülteni, Cilt: 38 - Sayı: 3, 193–201. https://ajindex.com/articles/299862

📄 Tam Metin PDF Okuyucu

📄

PDF görüntüleyici hazırlanıyor...

Kaynakça (15)

  1. Türkiye'de Tüberkülozun Kontrolü İçin Başvuru Kitabı, s: 7-10. TC Sağlık Bakanlığı Verem Savaş Daire Başkanlığı Yayını 2003, Rekmay Ltd Şt, Ankara
  2. Kocagöz T: Tüberküloz tanısında kullanılan moleküler yöntemler, s:189-195 Ağaçfidan A, Badur S, Türkoğlu S (eds), infeksiyon Hastalıklarının Laboratuar Tanısında Moleküler Yöntemler. 2002, MGG As Matbaacılık, istanbul
  3. Soini H, Musser JM: Molecular diagnosis of mycobacteria. Clin Chem 2001, 47: 809-814
  4. Huggett JF, McHugh TD, Zumla A: Tuberculosis: Amplification-based clinical diagnostic techniques. Int J Biochem Cell Biol 2003, 35: 1407-1412
  5. Kaul KL: Molecular detection of Mycobacterium tuberculosis: Impact on patient care Clin Chem 2001, 47: 1553-1558
  6. Fujiki A: Direct smear examination, p. 26-33. In: TB Microscopy. 1998, The Research Institute of Tuberculosis, Japan Anti-Tuberculosis Association, Tokyo
  7. Isenberg HD (ed): Digcstion-decontamination procedures, p 3.4.2. In. Clinical Microbiology Procedures Handbook, Vol 1. 1992, ASM Press, Washington DC
  8. Siddiqi SH: Procedure for primary isolation of mycobacteria from clinical specimens, p: II. 1-11.13. In BACTEC TB System Product and Procedure Mannual. 1989, Becton Dickinson, Maryland
  9. Jonsson B, Ridell M: The Cobas Amplicor MTB test for detection of Mycobacterium tuberculosis complex from respiratory and non-respiratory clinical specimens. Scand J Infect Dis 2003, 35: 372-377
  10. DiDomenico N, Link H, Knobel R, et al COBAS AMPLICOR: Fully automated RNA and DNA amplification and detection system for routine diagnostic PCR. Clin Chem 1996, 42: 1915-1923
  11. Kessler H, Mühlbauer G, Stelzl E, et al: Fully automated nucleic acid extraction: MagNA Pure LC. Clin Chem 2001, 47: 1124-1126
  12. Hale YM, Pfyffer GE, Salfinger M. Laboratory diagnosis of mycobacterial infections: New tools and lessons learned. Clin Infect Dis 2001, 33: 834-846
  13. Salfinger M, Pfyffer GE: The new diagnostic mycobacteriology laboratory. Eur J Clin Microbiol Infect Dis 1994, 13: 961-979
  14. Jungkind D: Automation of laboratory testing for infectious diseases using polymerase chain reaction-Our past, our present, our future. J Clin Virol 2001, 20:1-6
  15. Scarparo C, Piccoli P Rigon A, et al: Comparison of enhanced Mycobacterium tuberculosis amplified direct test with Cobas Amplicor Mycobacterium tuberculosis assay for direct detection of Mycobacterium tuberculosis complex in respiratory and extrapulmonary specimens. J Clin Microbiol 2000, 38: 1559-1562. 16.