Dergiler / Mikrobiyoloji Bülteni / 2004 / Cilt: 38 - Sayı: 1

Çocuk hastalardan izole edilen Stenotrophomonas maltophilia suşlarının moleküler epidemiyolojisi

Molecular epidemiology of Stenotrophomonas maltophilia strains isolated from paediatric patients

Sayfa
9–19
DOI
—
🏛️Bu makalenin bibliyografik verileri ve tam metin bağlantısı DergiPark üzerinden sağlanmıştır.
DergiPark Kaydı ↗
✨

Yapay Zeka Hızlı Bakış & Çıkarımlar

AI Insight
⚡ TL;DR(1 Cümlede Hızlı Çıkarım)

Sonuç olarak bu çalışmada, genomik farklılığın yüksek ve klonal suşların düşük sayıda olması, S,maltophilia suşlarının hastanemizde hastadan hastaya klonal yayılımından çok, hastane ortamında bulunan çeşitli suşların hastalarda kolonize olarak antibiyotik baskısı ile enfeksiyon etkeni haline gelebileceği fikrini güçlendirmektedir.

📌 3 Maddede Bu Makale

🎯
Amaç & Hipotez:Stenotrophomonas maltophilia enfeksiyonlarında tedavi seçeneklerinin sınırlı olması nedeniyle enfeksiyondan korunmada yeni önlemlerin geliştirilebilmesi bakımından bu mikroorganizmanın epidemiyolojik açıdan araştırılması gerekmektedir. "Enterobacterial repetetive intergenic consensus-polimeraz zincir reaksiyonu (ERIC-PZR)", S. maltophilia'ya bağlı nozokomiyal salgınlarda suşlar arasında genetik ilişkinin belirlenmesinde kullanılabilecek kolay ve hızlı bir yöntemdir.
📊
Temel Bulgular & Veri:Bu çalışmada, Hacettepe Üniversitesi Hastanesinde 1998-2001 yılları arasında çocuk hastalardan izole edilen S.maltophilia suşlarının moleküler epidemiyolojisi araştırılmıştır.
💡
Sonuç & Katkı:Sonuç olarak bu çalışmada, genomik farklılığın yüksek ve klonal suşların düşük sayıda olması, S,maltophilia suşlarının hastanemizde hastadan hastaya klonal yayılımından çok, hastane ortamında bulunan çeşitli suşların hastalarda kolonize olarak antibiyotik baskısı ile enfeksiyon etkeni haline gelebileceği fikrini güçlendirmektedir.
🔬Tür:Araştırma Makalesi
📍Kapsam:2001 Verileri
⚙️Değişkenler:Çapraz enfeksiyon · Gram-negatif bakteriyel enfeksiyonlar · Stenotrophomonas maltophilia

Özet

Stenotrophomonas maltophilia enfeksiyonlarında tedavi seçeneklerinin sınırlı olması nedeniyle enfeksiyondan korunmada yeni önlemlerin geliştirilebilmesi bakımından bu mikroorganizmanın epidemiyolojik açıdan araştırılması gerekmektedir. "Enterobacterial repetetive intergenic consensus-polimeraz zincir reaksiyonu (ERIC-PZR)", S. maltophilia'ya bağlı nozokomiyal salgınlarda suşlar arasında genetik ilişkinin belirlenmesinde kullanılabilecek kolay ve hızlı bir yöntemdir. Bu çalışmada, Hacettepe Üniversitesi Hastanesinde 1998-2001 yılları arasında çocuk hastalardan izole edilen S.maltophilia suşlarının moleküler epidemiyolojisi araştırılmıştır. Otuzbeş hastadan birer, iki hastadan ikişer ve hastane çevre örneğinden bir izolat olmak üzere toplam 40 suş çalışmaya alınmıştır. İzolatların onbir antimikrobik ilaca karşı duyarlılığı NCCLS kriterlerine göre ağar dilüsyon yöntemi ile belirlenmiştir. Çalışılan suşların %57.5'u piperasiline, %25'i piperasilin-tazobaktama, %85'i seftriaksona, %37.5'u seftazidime, %47.5'u sefepime, %20'si siprofloksasine, %100'ü imipeneme, %95'i meropeneme, %62.5'u amikasine, %62.5'u gentamisine ve %5'i trimetoprim-sulfametoksazole (TMP/SMX) dirençli bulunmuştur. TMP/SMX, test edilen izolatlara karşı en etkili antibiyotik olarak saptanmıştır. İzolatlar ERIC-I ve ERIC-II primerlerinin herbiri kullanılarak ERIC-PZR yöntemiyle moleküler epidemiyoloji yönünden incelenmiş, genotipik analiz sonucu 24 majör ve 4 minör profil belirlenmiştir. Birbirinden farklı olan 4 grupta bulunan üçer izolat, başka 4 grupta bulunan ikişer izolat kendi aralarında birebir eş bulunmuştur. Sonuç olarak bu çalışmada, genomik farklılığın yüksek ve klonal suşların düşük sayıda olması, S,maltophilia suşlarının hastanemizde hastadan hastaya klonal yayılımından çok, hastane ortamında bulunan çeşitli suşların hastalarda kolonize olarak antibiyotik baskısı ile enfeksiyon etkeni haline gelebileceği fikrini güçlendirmektedir.

Abstract

As alternative regimens in therapy of Stenotrophomonas maltophilia infections are limited, epidemiological investigation of S. maltophilia is necessary for developing new strategies in prophylaxis of these infections. "Enterobacterial repetetive intergenic consensus-polymerase chain reaction (ERIC-PCR)", is a simple and rapid method to detect the genomic polymorphism at the strain level in nosocomial outbreaks due to S. maltophilia. The aim of this study was to investigate the molecular epidemiology of S. maltophilia strains isolated from paediatric patients in a university hospital. A total of 40 clinical isolates one from each of 35 patients, two pairs from two patients and one from an environmental source, were collected between 1998-2001 period. Susceptibility to eleven antimicrobials was studied by agar dilution test according to NCCLS criteria. Resistance rates of the tested isolates against piperacillin, piperacillin-tazobactam, ceftriaxone, ceftazidime, cefepime, ciprofloxacin, imipenem, meropenem, amikacin, gentamicin and trimethoprim-sulfamethoxazole were 57.5%, 25%, 85%, 37.5%, 47.5%, 20%, 100%, 95%, 62.5%, 62.5% and 5%, respectively. Trimethoprim-sulfamethoxazole was the most active agent against the tested isolates. The isolates were analyzed by ERIC-PCR by using each of ERIC-I and ERIC-II primers. Genotypic analysis by ERIC-PCR identified 24 different major and 4 minor profiles. Three isolates from each of four different groups, two isolates from each of other four different groups were unique. The results of this study, revealing a great genomic diversity and low clonality within the strains of S. maltophilia strains suggest that patients may be colonized with the naturally occuring isolates in the hospital environment and then get infected with these strains under the selective antibiotic pressure, thus supporting the view that clonal spread of S. maltophilia strains between patients is of rather low possibility

🔖

Bu Makaleye Atıf Yap

KÖSEOĞLU, Ö., ŞENER, B., GÜR, D. (2004). Çocuk hastalardan izole edilen Stenotrophomonas maltophilia suşlarının moleküler epidemiyolojisi. Mikrobiyoloji Bülteni, Cilt: 38 - Sayı: 1, 9–19. https://ajindex.com/articles/299666

📄 Tam Metin PDF Okuyucu

📄

PDF görüntüleyici hazırlanıyor...

Kaynakça (1)

  1. Palleroni NJ. Bradbury JF: Stenotrophomonas, a new bacterial genus for Xanthomonas maltophilia (Hugh 1980). Int J Syst Bacteriol 1993, 43: 606-609 2 Khardori N, Elting L, Wong E, Schable B, Bodey GP Nosocomial infections due to Xanthomonas maltophilia (Pseudomonas maltophilia) in patients with cancer. Rev Infect Dis 1990,12: 997-1003 3. Yao J DC, Conly JM, Krajden M: Molecular typing of Stenotrophomonas (Xanthomonas) maltophilia by DNA macrorestriction analysis and random amplified polymorphic DNA analysis. J Clin Microbiol 1995, 33: 2195-2198. 4 Denton M, Kerr KG Microbiological and clinical aspects of infection associated with Stenotrophomonas maltophilia. Clin Microb Rev 1998, 11: 57-80. 5. Denton M, Todd NJ, Kerr KG, Hawkey PM, Littlewood JM: Molecular epidemiology of Stenotrophomonas maltophilia isolated from clinical specimens from patients with cystic fibrosis and associated environmental samples. J Clin Microbiol 1998, 36: 1953-1958. 6 Laıng FPY, Ramotar K, Read RR, et al, Molecular epidemiology of Xanthomonas maltophilia colonization and infection in the hospital environment. J Clin Microbiol 1995, 33: 513-518. 7 Chatelut M, Dournes JL, Chabanon G, Marty N. Epidemiological typing of Stenotrophomonas (Xanthomonas) maltophilia by PCR J Clin Microbiol 1995, 33: 912-914. 8. Olive DM. Bean P Principles and applications of methods for DNA based typing of microbial organisms. J Clin Microbiol 1999, 37:1661-1669. 9. Belkum A, Leeuwen W. Kluytmans J, Verbrugh H: Molecular nosocomial epidemiology: High speed typing of microbial pathogens by arbitrary primed polymerase chain reaction assays. Infect Cont Hosp Epidemiol 1995, 16: 658-666 10 National Committee for Clinical Laboratory Standards. Methods for dilution antimicrobial susceptibility tests for bacteria that grow aerobically. Approved Standard M7-A5, 2000, 5th ed. National Committee for Clinical Laboratory Standards. Wayne, Pa 11. Tenover FC, Arbeit RD, Goering RV, and the Molecular Typing Working Group of the Society for Healthcare Epidemiology of America: How to select and interpret molecular strain typing methods for epidemiological studies of bacterial infections: A review for healthcare epidemiologists. Infect Cont Hosp Epidemiol 1997, 18: 426-439. 12. Versalovic J, Koeuth T and Lupski J: Distribution of repetetive DNA sequences in eubacteria and application to fingerprinting of bacterial genomes Nucleic Acids Res 1991, 19: 6823-6831. 13. Van Belkum A. DNA fingerprinting of medically important