Dergiler / Mikrobiyoloji Bülteni / 2012 / Cilt: 46 - Sayı: 2

Koagülaz-negatif stafilokoklarda makrolid-linkozamid-streptogramin B grubu antibiyotiklere karşı nadir direnç genlerinin araştırılması

Investigation of the rare genes related to resistance to macrolide-lincosamide and streptogramin B group antibiotics among coagulase-negative Staphylococci

Sayfa
170–179
DOI
—
🏛️Bu makalenin bibliyografik verileri ve tam metin bağlantısı DergiPark üzerinden sağlanmıştır.
DergiPark Kaydı ↗
✨

Yapay Zeka Hızlı Bakış & Çıkarımlar

AI Insight
⚡ TL;DR(1 Cümlede Hızlı Çıkarım)

Stafilokok enfeksiyonlarının tedavisinde makrolid, linkozamid ve streptogramin B (MLS B) grubu anti-biyotikler ilk seçenek olarak önerilmektedir.

📌 3 Maddede Bu Makale

🎯
Amaç & Hipotez:Stafilokok enfeksiyonlarının tedavisinde makrolid, linkozamid ve streptogramin B (MLS B) grubu anti-biyotikler ilk seçenek olarak önerilmektedir.
📊
Temel Bulgular & Veri:Bu gruptaki antibiyotiklerin hepsi bakteri ribozomunun 50S alt ünitesine bağlandıkları için çapraz direnç gelişimi önemli bir sorundur.
💡
Sonuç & Katkı:Sonuç olarak, linA ve vga genlerinin yüksek sıklıkta görülmesi epidemiyolojik gen çalışmalarında bu genlerin de araştırılmaları gerektiğini göstermektedir.
🔬Tür:Araştırma Makalesi
📍Kapsam:Genişletilmiş Akademik Örneklem
⚙️Değişkenler:Linkozamit · Mikrobiyal duyarlılık testleri · Staphylococcus

Özet

Stafilokok enfeksiyonlarının tedavisinde makrolid, linkozamid ve streptogramin B (MLS B) grubu anti-biyotikler ilk seçenek olarak önerilmektedir. Bu gruptaki antibiyotiklerin hepsi bakteri ribozomunun 50S alt ünitesine bağlandıkları için çapraz direnç gelişimi önemli bir sorundur. Dirençten sorumlu mekaniz-malar arasında; (a)erm genlerinin kodladığı metilazlar yoluyla ribozomal hedefin modifikasyonu, (b) msrA, msrB, vga, vgb genlerinin sorumlu olduğu ilacın hücre dışına atılması ve (c) linA,vat,vatB genleri-nin sorumlu olduğu ilacın enzimatik inaktivasyonu yer almaktadır. En sık görülen direnç genleri erm ve msr iken, çeşitli çalışmalarda linA,vga,vgb,vat ve vatB genlerinin varlığından da söz edilmektedir. Bu çalışmada çeşitli klinik örneklerden izole edilen 454 koagülaz-negatif stafilokok (KNS) suşunda nadir bildirilen MLS B direnç genleri incelenmiş ve erm,msr genleriyle birlikte bulunma sıklıkları araştırılmıştır. KNS izolatlarının %46.5 (n= 211)’i Staphylococcus hominis , %30.8 (n= 140)’i Staphylococcus epidermidis, %12.1 (n= 55)’i Staphylococcus haemolyticus, %3.5 (n= 16)’i Staphylococcus warnerii ve %7 (n= 32)’si diğer türlerden oluşmaktadır. Suşların direnç fenotipleri, “Clinical and Laboratory Standards Institute (CLSI)” önerilerine göre D-test yöntemi uygulanarak belirlenmiştir. D-test ile suşların 107 (%23.6)’si M (eritromisine dirençli ve D-test ile indüklenebilir klindamisin direnci tespit edilmeyen fenotip), 92 (%20.3)’si iMLS B (D-test ile indüklenebilir klindamisin direnci tespit edilen fenotip) ve 110 (%24.2)’u cMLS B (yapısal olarak eritromisin ve klindamisin direncinin görüldüğü fenotip) fenotipi olarak saptanmıştır. iMLS B (n= 92) ve cMLS B (n= 110) fenotipi gösteren suşların tamamı ile M fenotipi gösteren 107 suş arasından rastgele seçilen 46 suş,linA, vga,vgb, vat,vatB,ermA,ermB,ermC, msrA ve msrB genlerinin varlığı açısından polimeraz zincir reaksiyonu yöntemiyle incelenmiştir. Tek başına veya erm ve/veya msr genleriyle kombine olarak 91 (%20) suşta linA, 19 (%4.2) suşta vga gen varlığı saptanmıştır. linA geni; iMLS B,cMLS B ve M fenotipi gösteren suşların sırasıyla %52, %26 ve %13’ünde tespit edilirken, vga geni sırasıyla %5.4, %12 ve %0.9 suşta gösterilmiştir. iMLS B ve cMLS B fenotipi gösteren suşlarda en sık görülen direnç geni ermC iken (sırasıyla; %32.6 ve %42.7), bunu ermC +linA gen kombinasyonu (sırasıyla; %31.5 ve %14.5) izlemiştir. M fenotipi gösteren suşlarda en sık görülen direnç msrA ve msrB gen kombinasyonu (%34.8) olmuş, ikinci sırayı msrA+msr B+linA (%19.1) kombinasyonu almıştır. Çalışmaya alınan hiçbir izolattavgb,vat ve vatB genleri belirlenmemiştir. Ülkemizde daha önce yapılmış MLS B grubu antibiyotiklere karşı nadir görülen direnç genleriyle ilgili çalışmaya rastlanmamıştır. Bu çalışma linA,vga,vgb,vat ve vatB genlerinin sıklığına ait ilk rapordur. Sonuç olarak, linA ve vga genlerinin yüksek sıklıkta görülmesi epidemiyolojik gen çalışmalarında bu genlerin de araştırılmaları gerektiğini göstermektedir.

Abstract

Macrolide-lincosamide-streptogramin B (MLS B) group antibiotics are recommended as first choice in the treatment of staphylococcal infections. All of those drugs bind to the 50S subunit of bacterial ribo-somes, thus cross-resistance is a major concern in this group of drugs. The mechanisms associated to re- sistance are (a) ribosomal methylation due to the methylases encoded by erm genes, (b) active drug eff-lux due to msrA, msrB, vga, vgb gene activity, (c) enzymatic inactivation of the drug due to the activity of linA, vat,vatB genes. While the most common resistance genes are ermA, ermB, ermC,msrA and msrB genes; linA, vga, vgb,vat and vatB genes have also been found in some studies. In this study it was ai-med to investigate the presence of the rare MLS B resistance genes and their coexistence with erm and msr genes in 454 clinical isolates of coagulase-negative staphylococci (CNS). Of them 46.5% (n= 211) were S.hominis, 30.8% (n= 140) were S.epidermidis, 12.1% (n= 55) were S.haemolyticus, 3.5% (n= 16) were S.warnerii and 7% (n= 32) were the other coagulase-negative staphylococcal species. Resistance phenotypes were determined by using D-test method according to the recommendation of Clinical and Laboratory Standards Institute (CLSI). With the D-test 107 (23.6%) strains were determined as M phe-notype (resistant to erythromycin and inducible clindamycin resistance was not detected), 92 (20.3%) were iMLS B phenotype (inducible clindamycin resistance was detected by the D-test) and 110 (24.2%) were cMLS B phenotype (constitutive erythromycin and clindamycin resistance was detected). linA, vga, vgb, vat, vatB, ermA, ermB,ermC,msrA, msrB genes were investigated by polymerase chain reaction in all strains showing iMLS B (n= 92) and cMLS B (n= 110) phenotypes and 46 randomly selected strains among 107 strains exhibiting the M phenotype. linA gene was found in 91 (20%) strains as single gene or in combination with erm or msr genes, and vga gene was found in 19 (4.2%) strains. linA gene was found in 52% of iMLS B phenotype, in 26% of cMLS B phenotype and 13% of M phenotype while vga gene was found in 5.4% of iMLS B phenotype, in 12% of cMLS B phenotype and in 0.9% of M phenoty-pe. The most common resistance gene among iMLS B and cMLS B phenotypes was ermC (32.6% and 42.7%, respectively), followed by ermC+ linA gene combination (31.5% and 14.5%, respectively). The most frequent gene combination was msrA and msrB in M phenotype (34.8%) and it was followed by a combination of msrA + msrB + linA genes (19.1%). None of the strains revealed presence of vgb, vat and vatB genes. There were no previous reports about the rarely detected resistance genes against MLS B an-tibiotics in our country. This was the first study which reported the frequency of linA, vga,vgb,vat and vatB genes in MLS B resistant CNS. In conclusion, since linA and vga genes were detected in high frequ- ency in MLS B resistant CNS in this study, it was thought that the investigation of these genes should be included in the further related epidemiologic gene research.

🔖

Bu Makaleye Atıf Yap

ŞAKAR, H., MUMCUOĞLU, İ., AKSU, N., KARAHAN, Z. C., KURŞUN, Ş., KUŞTİMUR, S. (2012). Koagülaz-negatif stafilokoklarda makrolid-linkozamid-streptogramin B grubu antibiyotiklere karşı nadir direnç genlerinin araştırılması. Mikrobiyoloji Bülteni, Cilt: 46 - Sayı: 2, 170–179. https://ajindex.com/articles/298662

Kaynakça (15)

  1. von Eiff C, Peters G, Heilmann C. Pathogenesis of infections due to coagulase-negative staphylococci. Lan- cet Infect Dis 2002; 2(11): 677-85
  2. Kloos WE, Bannerman TL. Update on clinical significance of coagulase-negative staphylococci. Clin Micro- biol Rev 1994; 7(1): 117-40
  3. Thylefors JD, Harbarth S, Pittet D. Increasing bacteremia due to coagulase- negative staphylococci: fiction or reality? Infect Control Hosp Epidemiol 1998; 19(8): 581-9
  4. Livermore DM. Antibiotic resistance in staphylococci. Int J Antimicrob Agent 2000; 16(Suppl 1): S3-10
  5. Gür D. Bakterilerde antibiyotiklere karşı direnç, s: 182-92. Willke Topçu A, Söyletir G, Doğanay M (ed), Enfeksiyon Hastalıkları ve Mikrobiyolojisi, Cilt 1. 2002. Nobel Tip Kitabevleri, İstanbul
  6. Leclercq R. Mechanisms of resistance to macrolides and lincosamides: nature of the resistance elements and their clinical implications. J Clin Infect Dis 2002; 34(4): 482-92
  7. Fiebelkorn KR, Crawford SA, McElmeel ML, Jorgensen JH. Practical disk diffusion method for detection of inducible clindamycin resistance in Staphylococcus aureus and coagulase-negative staphylococci. J Clin Mic- robiol 2003; 41(10): 4740-4
  8. Delialioglu N, Aslan G, Ozturk C, Baki V, Sen S, Emekdas G. Inducible clindamycin resistance in staphylo- cocci isolated from clinical samples. Jpn J Infect Dis 2005; 58(2): 104-6
  9. Leblebicioğlu H. Makrolidler. İnfeksiyon Dergisi 2001; 15(2): 189-92
  10. Weisblum B. Macrolide resistance. Drug Resist Updat 1998; 1(1): 29-41
  11. Clinical and Laboratory Standards Institute. Performance standards for antimicrobial susceptibility testing. M100-S19, 2009. CLSI, Wayne, Pa
  12. Ida T, Okamoto R, Shimauchi C, Okubo T, Kuga A, Inoue M. Identification of aminoglycoside-modifying enzymes by susceptibility testing: epidemiology of methicillin-resistant Staphylococcus aureus in Japan. J Clin Microbiol 2001; 39(9): 3115-21
  13. Lina G, Quaglia A, Reverdy ME, Leclercq R, Vandenesch F, Etienne J. Distribution of genes encoding resis- tance to macrolides, lincosamides, and streptogramins among staphylococci. Antimicrob Agents Chemot- her 1999; 43(5): 1062-6
  14. Aktas Z, Aridogan A, Kayacan CB, Aydin D. Resistance to macrolide, lincosamide and streptogramin anti- biotics in staphylococci isolated in Istanbul, Turkey. J Microbiol 2007; 45(4): 286-90
  15. Cetin ES, Gunes H, Kaya S, Aridogan BC, Demirci M. Distribution of genes encoding resistance to macro- lides, lincosamides and streptogramins among clinical