Yapay Zeka Hızlı Bakış & Çıkarımlar
AI InsightHCV genotip dağılımı coğrafi ve epidemiyolojik farklılık göstermektedir.
📌 3 Maddede Bu Makale
Özet
Hepatit C virusu (HCV), yüksek kronikleşme oranı, ciddi karaciğer hastalıklarına neden olması, kesin bir tedavi ve etkin bir aşısının olmaması gibi nedenlerden dolayı tüm dünyada ciddi bir sağlık sorunudur. HCV genomu yüksek derecede değişkenlik göstermekte olup, filogenetik olarak HCV’nin en az altı majör genotipi ve birçok alt tipinin bulunduğu bilinmektedir. HCV genotip dağılımı coğrafi ve epidemiyolojik farklılık göstermektedir. Doz ve tedavi süresi farklı genotipler için değişken olabileceğinden, tedavi öncesinde genotiplerin belirlenmesi klinik açıdan önemlidir. Bu çalışmada, hastanemizde izlenen kronik hepatit C’li hastalarda HCV genotiplerinin belirlenmesi amaçlanmıştır. Çalışmaya, Antalya Eğitim ve Araştırma Hastanesi Mikrobiyoloji Laboratuvarına, 01 Ocak 2011-30 Haziran 2013 tarihleri arasında, farklı servislerden gönderilen anti-HCV ve HCV-RNA pozitif toplam 148 kronik hepatit C’li hasta (67 kadın, 81 erkek; yaş ortalaması: 50.5 ± 10.8, yaş aralığı: 17-73 yıl) dahil edilmiştir. Hastaların epidemiyolojik verileri ve HCV genotip çalışmaları retrospektif olarak değerlendirilmiştir. Viral genotipler gerçek zamanlı polimeraz zincir reaksiyonu (Rt-PCR) yöntemiyle (Abbott Molecular Diagnostic, ABD) belirlenmiştir. Bu yöntemle her örnek, 6 genotip (Gt) ve alt tip 1a ve 1b için test edilmiştir. Hastaların 119 (%80.4)’unda Gt-1 saptanmış; bunların %15.9 (19/119)’u 1a, %75.6 (90/119)’sı 1b olarak tiplendirilmiştir. Gt-2, -3 ve -4 prevalans oranları sırasıyla %3.4 (n= 5), %11.5 (n= 17) ve %2 (n= 3) olarak bulunmuş; Gt-6’ya ise rastlanmamıştır. Rt-PCR yöntemiyle çalışılan hastaların 4 (%2.7)’ünde karışık tip tespit edilmiş; bu örnekler RFLP (Restriction Fragment Length Polymorphism) ve dizi analizi yöntemiyle çalışıldığında üçü Gt-1, biri ise Gt-2 olarak tiplendirilmiştir. Çalışmamızda saptanan yüksek Gt-3 prevalansının (%11.5), yabancı uyruklu 13 hastanın yedisinde saptanan Gt-3 pozitifliğinden kaynaklanmış olabileceği düşünülmüştür. Bu çalışmada kullanılan Rt-PCR yöntemi, kullanıcıdan bağımsız, standart otomatize ve hızlı sonuç veren güvenilir bir yöntemdir; ancak karışık tip saptanan örneklerin başka bir yöntemle doğrulanması gerekmektedir. Sonuç olarak, hastanemizde izlenen kronik hepatit C’li hastalar arasında en yaygın genotipin Gt-1b olduğu, Gt-3’ün ise şimdiye kadar bildirilmiş en yüksek oran olduğu söylenebilir.
Abstract
Hepatitis C virus (HCV) infection is a major global health problem due to high chronicity rates, occurrence of severe hepatic diseases, and absence of an accurate therapy and effective vaccine. It is well known that viral genome is highly variable and HCV has at least six genotypes, each of them containing a series of subtypes. HCV genotypes exhibit geographical and epidemiological distribution. Genotype identification is clinically important to decide the dosage and duration of treatment since different geno- types exhibit variable response to treatment. The aim of this study was to determine the HCV genotypes in chronic HCV patients who were followed-up in Antalya Research and Training Hospital, Turkey. Anti- HCV and HCV-RNA positive blood samples obtained from 148 chronic hepatitis C patients (67 female, 81 male; mean age: 50.5 ± 10.8, age range: 17-73 years) who were admitted to Antalya Research and Training Hospital Microbiology Laboratory during January 2011-June 2013, were included in the study. Epidemiological data of the patients and HCV genotype results were evaluated retrospectively. Viral genotypes were determined by real-time (Rt) PCR assay (Abbott Molecular Diagnostic, USA). HCV genotype (Gt)-1 was detected in 119 (80.4%) of the patients, of them 15.9% (19/119) were identified as subtype 1a and 75.6% (90/119) were subtype 1b. The prevalence rates of Gt-2, -3, and -4 were found as 3.4% (n= 5), 11.5% (n= 17), and 2% (n= 3), respectively. Gt-6 was not detected in our patients. Mixed infection with HCV types was detected in four patients (2.7%) by Rt-PCR; of these three were detected as Gt-1 and one was Gt-2 by RFLP (Restriction Fragment Length Polymorphism) and sequenc- ing. The high prevalence of Gt-3 (11.5%) obtained in this study was attributed to the determination of Gt-3 in seven of 13 foreign national subjects. Rt-PCR method used in this study is user independent, standardized, automated, rapid and reliable method, however in case of detection of mixed types, the samples should be confirmed by other methods. In conclusion, we reported that the majority of the chronic hepatitis C infected patients had Gt-1b, and Gt-3 exhibited the highest rate ever reported by other studies from Turkey.