Complete Genome Sequence of a Novel Duck Parvovirus

Bu bulguların, doğada Muscovy ördek sürülerinde rekombinasyon yoluyla dolaşan yeni ördek parvovirusu olduğu değerlendirilmektedir ki, bunlar da su kuşu parvovirusunun moleküler özelliklerini ve evrimsel çeşitliliğini anlamamızı sağlar.

📌 3 Maddede Bu Makale

🎯

Amaç & Hipotez:Bu çalışmada, Fujian, Güneydoğu Çin'de Muscovy ördeklerinden türetilmiş yeni bir ördek parvovirus izolatlarını (NM100) sıralayıp tam genomlarını analiz ettik.

📊

Temel Bulgular & Veri:Tam genom ve VP1 genine dayalı filogenetik analize göre, yeni ördek parvovirus suşu NM100'ün MDPV kümelerine ait olduğunu, oysa VP3 geni, NM100 suşunun GPV kümelerine ait olduğunu gösterdi.

💡

Sonuç & Katkı:Bu bulguların, doğada Muscovy ördek sürülerinde rekombinasyon yoluyla dolaşan yeni ördek parvovirusu olduğu değerlendirilmektedir ki, bunlar da su kuşu parvovirusunun moleküler özelliklerini ve evrimsel çeşitliliğini anlamamızı sağlar.

🔬Tür:Araştırma Makalesi

📍Kapsam:Genişletilmiş Akademik Örneklem

⚙️Değişkenler:Alan Parametreleri

Özet

Bu çalışmada, Fujian, Güneydoğu Çin'de Muscovy ördeklerinden türetilmiş yeni bir ördek parvovirus izolatlarını (NM100) sıralayıp tam genomlarını analiz ettik. Tam genom ve VP1 genine dayalı filogenetik analize göre, yeni ördek parvovirus suşu NM100'ün MDPV kümelerine ait olduğunu, oysa VP3 geni, NM100 suşunun GPV kümelerine ait olduğunu gösterdi. Benzerlik alanları analizi kullanılarak, iki olası genetik rekombinasyon olayları tespit edildi. Bu bulguların, doğada Muscovy ördek sürülerinde rekombinasyon yoluyla dolaşan yeni ördek parvovirusu olduğu değerlendirilmektedir ki, bunlar da su kuşu parvovirusunun moleküler özelliklerini ve evrimsel çeşitliliğini anlamamızı sağlar.

Abstract

In the present study, we sequenced and analysed the complete genomes of a novel duck parvovirus (NM100) isolates derived from Muscovy ducks in Fujian, Southeast China. According to the phylogenetic analysis, based on the complete genome and VP1 gene showed that novel duck parvovirus strain NM100 belong to the MDPV clusters, whereas the VP3 gene showed that strain NM100 belong to the GPV clusters. Two putative genetic recombination events were detected using similarity plots analysis. These findings suggest that a novel duck parvovirus circulating in Muscovy duck flocks with recombination in nature, which enable us to understand the molecular characteristics and evolutionary diversity of waterfowl parvoviruses.

🔖

Bu Makaleye Atıf Yap

WAN, C., FU, Q., CHEN, C., CHEN, H., CHENG, L., FU, G., SHI, S., LIU, R., LIN, Q., HUANG, Y. (2016). Complete Genome Sequence of a Novel Duck Parvovirus. Kafkas Üniversitesi Veteriner Fakültesi Dergisi, Cilt: 22 - Sayı: 6, 971–975. https://ajindex.com/articles/272447

📄 Tam Metin PDF Okuyucu

Yeni Sekmede Aç ↗

↗Yeni Sekme

📄

PDF görüntüleyici hazırlanıyor...

Kaynakça (6)

Zádori Z, Stefancsik R, Rauch T, Kisary J: Analysis of the complete nucleotide sequences of goose and muscovy duck parvoviruses indicates common ancestral origin with adeno-associated virus 2. Virology, 212, 573, 1995.
Shien J, Wang Y, Chen C, Shieh H, Hu C, Chang P: Identification of sequence changes in live attenuated goose parvovirus vaccine strains developed in Asia and Europe. Avian Pathol, 37, 499-505, 2008. DOI: 1080/03079450802356979 Liu H, Wang H, Tian X, Zhang S, Zhou X, Qi K, Pan L: Complete genome sequence of goose parvovirus Y strain isolated from Muscovy ducks in China. Virus Genes, 48, 199-202, 2014. DOI: 10.1007/s11262-013- 4 Wan C, Chen H, Fu Q, Fu G, Cheng L, Shi S, Huang Y, Hu K: Genomic characterization of goose parvovirus and Muscovy duck parvovirus co- infection in Fujian, China. Kafkas Univ Vet Fak Derg, 21, 923-928, 2015. DOI: 9775/kvfd.2015.13848 Shao H, Lv Y, Ye J, Qian K, Jin W, Qin A: Isolation of a goose parvovirus from swan and its molecular characteristics. Acta Virol, 58,194-198, 2014.
Chen H, Dou Y, Tang Y, Zhang Z, Zheng X, Niu X, Yang J, Yu X, Diao Y: Isolation and genomic characterization of a duck-origin GPV-related Parvovirus from Cherry Valley Ducklings in China. PLoS One, 10, e0140284, DOI: 10.1371/journal.pone.0140284 Wan C, Huang Y, Shi S, Fu G, Cheng L, Chen H, Fu Q, Chen C, Hu K: Complete genome sequence of goose Parvovirus isolated from Anser cygnoides in China. Kafkas Univ Vet Fak Derg, 22, 155-158, 2016. DOI: 9775/kvfd.2015.14242 Wan C, Chen H, Fu Q, Shi S, Fu G, Cheng L, Chen C, Huang Y, Hu K: Development of a restriction length polymorphism combined with direct PCR technique to differentiate goose and Muscovy duck parvoviruses. J Vet Med Sci, 78, 855-858, 2016. DOI: 10.1292/jvms.15-0326
Wang J, Duan J, Meng X, Gong J, Jiang Z, Zhu G: Cloning of the genome of a goose parvovirus vaccine strain SYG61v and rescue of infectious virions from recombinant plasmid in embryonated goose eggs. J Virol Methods, 200, 41-46, 2014. DOI: 10.1016/j.jviromet.2014.02.014 Chen S, Lin T, Hu Q, Li Y, Zhou W, Wu Z: Isolation and identification of a muscovy duckling parvovirus. Bing Du Xue Bao, 9, 228-235, 1993.
Cheng Y, Hu Q, Li Y, Chen S: Selection of attenuated vaccine strain of muscovy duckling parvovirus and its biological characteristics. Chin J Vet Sci, 16, 118-121, 1996.
Wang S, Cheng X, Chen S, Zhu X, Chen S, Lin F, Li Z: Genetic characterization of a potentially novel goose parvovirus circulating in Muscovy duck flocks in