Dergiler / Hacettepe Journal of Biology and Chemistry / 2014 / Cilt: 42 - Sayı: 3

Buğdaydan DNA Ekstraksiyonu için Altı Ticari DNA Ekstraksiyon Kitinin Karşılaştırılması

Comparison of Six Commercial DNA Extraction Kits for DNA Extraction from Wheat

Sayfa
395–400
Yayın Tarihi
2014-09-01
DOI
—
🏛️Bu makalenin bibliyografik verileri ve tam metin bağlantısı DergiPark üzerinden sağlanmıştır.
DergiPark Kaydı ↗
✨

Yapay Zeka Hızlı Bakış & Çıkarımlar

AI Insight
⚡ TL;DR(1 Cümlede Hızlı Çıkarım)

Sonuçlar, SIGMA GenElute™ Plant Genomic DNA Miniprep ve QIAGEN DNeasy Plant Mini kitlerinin buğday tohumundan ve yapraklarından DNA izolasyonunda en etkili ticari kitler olduğunu göstermiştir

📌 3 Maddede Bu Makale

🎯
Amaç & Hipotez:B u çalışmada, 6 adet DNA ekstraksiyon kiti DNA verimi, DNA saflığı, amplifikasyon etkinliği, harcanan zaman ve ekstraksiyon başına düşen fiyat açısından karşılaştırılmıştır.
📊
Temel Bulgular & Veri:DNA örneklerinin PCR etkinliğini değerlendirmek için, ekstrakte edilen DNA örnekleri 18SrRNA kloroplast ve trnL–trnF genler arasındaki bölgenin amplifikasyonları için kalıp olarak kullanılmıştır.
💡
Sonuç & Katkı:Sonuçlar, SIGMA GenElute™ Plant Genomic DNA Miniprep ve QIAGEN DNeasy Plant Mini kitlerinin buğday tohumundan ve yapraklarından DNA izolasyonunda en etkili ticari kitler olduğunu göstermiştir
🔬Tür:Araştırma Makalesi
📍Kapsam:6 adet
⚙️Değişkenler:Buğday · DNA ekstraksiyon kitleri · DNA izolasyonu

Özet

B u çalışmada, 6 adet DNA ekstraksiyon kiti DNA verimi, DNA saflığı, amplifikasyon etkinliği, harcanan zaman ve ekstraksiyon başına düşen fiyat açısından karşılaştırılmıştır. Ekstrakte edilen DNA örnekleri, agaroz jel elektroforezi ve spektrofotometrik ölçümler ile kontrol edilmiştir. DNA örneklerinin PCR etkinliğini değerlendirmek için, ekstrakte edilen DNA örnekleri 18SrRNA kloroplast ve trnL–trnF genler arasındaki bölgenin amplifikasyonları için kalıp olarak kullanılmıştır. Sonuçlar, SIGMA GenElute™ Plant Genomic DNA Miniprep ve QIAGEN DNeasy Plant Mini kitlerinin buğday tohumundan ve yapraklarından DNA izolasyonunda en etkili ticari kitler olduğunu göstermiştir

Abstract

In this study, six commercial DNA extraction kits were compared with each other in terms of DNA yield, DNA purity, amplification efficiency, the time spent and the cost per extraction. Extracted DNA samples were controlled by agarose gel electrophoresis and spectrophotometric measurement. The DNA samples were used as a template for 18SrRNA and chloroplast trnL–trnF intergenic spacer region amplifications to evaluate the PCR efficiency of DNA samples. Results showed that SIGMA GenEluteTM Plant Genomic DNA Miniprep Kit and QIAGEN DNeasy Plant Mini Kit are the most efficient commercial kits for DNA isolation from both wheat seed and leaf samples.

🔖

Bu Makaleye Atıf Yap

KARAASLAN, Ç., AKEL, H., ÜNLÜ, S., PERÇİN, I. (2014). Buğdaydan DNA Ekstraksiyonu için Altı Ticari DNA Ekstraksiyon Kitinin Karşılaştırılması. Hacettepe Journal of Biology and Chemistry, Cilt: 42 - Sayı: 3, 395–400. https://ajindex.com/articles/256149

📄 Tam Metin PDF Okuyucu

📄

PDF görüntüleyici hazırlanıyor...

Kaynakça (13)

  1. A. Varma, H. Padh, N. Shrivastava, Plant genomic DNA isolation: An art or a science. Biotechnol. J., 2 (2007) 386
  2. L. Zhang, B. Wang, L. Pan, J. Peng, Recycling isolation of plant DNA, a novel method. J. Genet. Genomics, 40 (2013) 45
  3. K. Takakura, T. Nishio, Safer DNA extraction from plant tissues using sucrose buffer and glass fiber filter. J. Plant Res., 125 (2012) 805
  4. L.D. Shepherd, T.G. McLay. Two micro-scale protocols for the isolation of DNA from polysaccharide-rich plant tissue. J. Plant Res., 124 (2011) 311
  5. C.A. Whitehouse, H.E. Hottel, Comparison of five commercial DNA extraction kits for the recovery of Francisella tularensis DNA from spiked soil samples. Mol. Cell Probes, 21 (2007) 92
  6. N. Mahmoudi, G.F. Slater, R.R. Fulthorpe, Comparison of commercial DNA extraction kits for isolation and purification of bacterial and eukaryotic DNA from PAHcontaminated soils, Can. J. Microbiol., 57 (2011) 623
  7. N. Sagi, K. Monma, A. Ibe, K. Kamata, Comparative evaluation of three different extraction methods for rice (oryza sativa l.) genomic DNA, J. Agric. Food Chem., 57 (2009) 2745
  8. T. Mornkham, P.P. Wangsomnuk, P. Wangsomnuk, S. Jogloy, A. Pattanothai, Y.B. Fu, Comparison of five DNA extraction methods for molecular analysis of Jerusalem artichoke (Helianthus tuberosus), Genet. Mol. Res. 11 (2012) 572
  9. A. Pirondini, U. Bonas, E. Maestri, G. Visioli, M. Marmiroli, N. Marmiroli, Yield and amplificability of different DNA extraction procedures for traceability in the dairy food chain, Food Control, 21 (2010) 663
  10. M. Akkurt, Comparison between modified DNA extraction protocols and commercial isolation kits in grapevine (Vitis vinifera L.), Genet. Mol. Res., 11 (2012) 2343
  11. S. Mafra, S.A. Silva, E.J.M.O. Moreira, C.S. Ferreira da Silva, M. Beatriz, P.P. Oliveira, Comparative study of DNA extraction methods for soybean derived food products, Food Control, 19 (2008) 1183
  12. J. Sambrock, E.F. Fritsch, T. Maniatis,. Molecular cloning-a laboratory manual. Cold Spring Harbor Laboratory Press, 1989
  13. A. Zimmermann, J. Lüthy, U. Pauli, Quantitative and qualitative evaluation of nine different extraction methods for nucleic acids on soya bean food samples, Z. Lebensm. Unters. Forsch. A, 207 (1998) 81.