Dergiler / Hacettepe Journal of Biology and Chemistry / 2016 / Cilt: 44 - Sayı: 3

Katı Faz Ayırma Yöntemiyle DNA Saflaştırılması

DNA Purification by Solid Phase Extraction SPE Methods

Sayfa
259–266
Yayın Tarihi
2016-09-01
DOI
—
🏛️Bu makalenin bibliyografik verileri ve tam metin bağlantısı DergiPark üzerinden sağlanmıştır.
DergiPark Kaydı ↗
✨

Yapay Zeka Hızlı Bakış & Çıkarımlar

AI Insight
⚡ TL;DR(1 Cümlede Hızlı Çıkarım)

Bu çalışmada; özellikle DNA’nın saflaştırılması için SPE yönteminin uygulamaları üzerinde durulmuş ve bilimsel çalışmalar özetlenmiştir

📌 3 Maddede Bu Makale

🎯
Amaç & Hipotez:D NA’nın saflaştırılması veya izole edilmesi moleküler biyoloji, tıbbi çalışmalar ve gen tedavi çalışmaları için önem taşır.
📊
Temel Bulgular & Veri:Çözücü ekstraksiyonu kolay uygulanabilir olmasına rağmen; toksisite, yüksek oranda çözücü ihtiyacı, yöntemin uzun zaman alması ve düşük özgüllüğü gibi birtakım kısıtlamalar mecvuttur.
💡
Sonuç & Katkı:Bu çalışmada; özellikle DNA’nın saflaştırılması için SPE yönteminin uygulamaları üzerinde durulmuş ve bilimsel çalışmalar özetlenmiştir
🔬Tür:Araştırma Makalesi
📍Kapsam:Genişletilmiş Akademik Örneklem
⚙️Değişkenler:DNA · DNA ayrılması · DNA saflaştırılması

Özet

D NA’nın saflaştırılması veya izole edilmesi moleküler biyoloji, tıbbi çalışmalar ve gen tedavi çalışmaları için önem taşır. Özellikle PCR çalışmaları için yüksek saflıkta DNA molekülüne ihtiyaç duyulmaktadır. Nükleik asitlerin saflaştırılmasında sırasıyla çözücü özütlemesi ve katı faz özütlemesi olmak üzere iki yöntem kulanılır. Çözücü ekstraksiyonu kolay uygulanabilir olmasına rağmen; toksisite, yüksek oranda çözücü ihtiyacı, yöntemin uzun zaman alması ve düşük özgüllüğü gibi birtakım kısıtlamalar mecvuttur. Günümüzde çeşitli örneklerden DNA’nın saflaştırılması için katı faz özütlemesi SPE yaygın olarak kullanılmaktadır. Bu çalışmada; özellikle DNA’nın saflaştırılması için SPE yönteminin uygulamaları üzerinde durulmuş ve bilimsel çalışmalar özetlenmiştir

Abstract

DNA isolation/purification is a widely used procedure for molecular biology, medical studies, gene therapy and especially PCR studies which needs high quality or extremely pure nucleic acid samples. Nucleic acid separation was mainly achieved by two methods; solvent extraction and solid phase extraction SPE methods. Although solvent extraction method is the simplest method, there are some drawbacks such as toxicity, more solvent requirement, time-consuming procedure and low specificity. Nowadays, there is a wide use of solid phase matrices to extract DNA from a variety of samples. In this review article; we basically focused on SPE for DNA purification methods.

🔖

Bu Makaleye Atıf Yap

TOPÇU, A. A., AŞIR, S., TÜRKMEN, D. (2016). Katı Faz Ayırma Yöntemiyle DNA Saflaştırılması. Hacettepe Journal of Biology and Chemistry, Cilt: 44 - Sayı: 3, 259–266. https://ajindex.com/articles/255960

📄 Tam Metin PDF Okuyucu

📄

PDF görüntüleyici hazırlanıyor...

Kaynakça (7)

  1. D. Cortes-Chosan, R.L. Griffits, Methods for extracting genomic DNA from whole blood samples: current perspectives, J. Biorepository Sci. App. Med, 2 (2014)
  2. B. Rittich, A, Spanova, SPE and purification of DNA using magnetic particles, J. Sep. Sci., 36 (2013) 2472. N. Ludwig, Nucleic acid techniques in bacterial systematics and identification, Int. J. Food. Microbiol., 120 (2007) 225. X.Y. Sun, P.Z. Li, B. Ai, Y.B. Wang, Surface modification of MCM-41 and its application in DNA adsorption, Chinese Chem. Lett., 27 (2016) 139. N.M. Fahrenkopf, P.Z. Rice, M. Bergkvist, N.A. Deskins, and N.C. Cady, Immobilization mechanisms of deoxyribonucleic acid (DNA) to hafnium dioxide (HfO2) surfaces for biosensing applications, Appl. Mater. Interfaces., 4 (2012) 5360. M.D. Costioli, I. Fisch, F. Flaudy-Garret, F. Hilbrig, R. Freitag, DNA purification by triple-helix affinity precipitation, Biotechnol. Bioeng., 81 (2003) 535. B. Rittich, A. Spanova, SPE and purification of DNA using magnetic particles, J. Sep. Sci., 36 (2013) 2472. J. Sambrook, D.W. Russel, Molecular Cloning, 3rd Ed., Cold Spring Harbor Laboratory Press,
  3. NY, USA (2001).
  4. M. Wink, An introduction to molecular biotechnology, 2nd Ed, Wiley-VCH Verlag GmbH&Co, KGaA (2011).
  5. M. Deng, C. Jiang, L. Jia, N-Methylimidazolium modified magnetic particles as adsorbents for solid phase extraction of genomic deoxyribonucleic acid from genetically modified soybeans, Anal. Chim. Acta., 771 (2013) 31. C.F. Poole, New trends in solid-phase extraction, Trends. Anal. Chem., 22 (2003) 362. E. Yavuz, Ş. Tokalıoğlu, H. Şahan, Ş. Patat, Nanosized spongelike MnO as an adsorbent for 34 preconcentration by vortex assisted solid phase extraction of copper and lead in various food and herb samples, Food Chem., 19 (2016) 463. N. Bereli, K. Köse, D. Türkmen, A. Denizli, A., Glutamic acid containing supermacroporous poly(hydroxyethyl methacrylate) cryogel disks for uranium removal, Mater. Sci. and Eng. C., 32 (2012) 2052.
  6. C. Armutcu, N. Bereli, E. Bayram, L. Uzun, R. Say, A. Denizli, Aspartic acid incorporated monolithic columns for affinity glycoprotein purification, Colloids and Surfaces B: Biointerfaces., 114, 67-74, 2014.
  7. R. Üzek, L. Uzun, S. Şenel, A. Denizli, Nanospines incorporation into the structure of the hydrophobic cryogels via novel cryogelation method: An alternative sorbent for plasmid DNA purification, Colloid. Surface. B., 102 (2013) 243. C.L. Chiang, C.S. Sung, C.Y. Chen, Application of silica–magnetite nanocomposites to