Dergiler / Gülhane Tıp Dergisi / 2003 / Cilt: 45 - Sayı: 2

Spinal kord yaralanmalı hastalardan izole edilen Escherichia coli suşlarının random amplifiye polimorfik DNA-PCR (RAPD) yöntemi ile genetik analizi

Genetic analysis of Escherichia coli strains isolated from patients with spinal cord injury by random amplified polymorphic DNA-PCR (RAPD) method

Sayfa
143–146
DOI
—
🏛️Bu makalenin bibliyografik verileri ve tam metin bağlantısı DergiPark üzerinden sağlanmıştır.
DergiPark Kaydı ↗
✨

Yapay Zeka Hızlı Bakış & Çıkarımlar

AI Insight
⚡ TL;DR(1 Cümlede Hızlı Çıkarım)

Çalışmaya alınan 61 suşun 32 (%52.4)'sinin birden fazla antibiyotiğe dirençli olduğu tespit edilmiştir.

📌 3 Maddede Bu Makale

🎯
Amaç & Hipotez:Spinal kord yaralanması (SKY) nedeniyle yatan hastaların idrarlarından hastane infeksiyonu etkeni olarak izole edilen çoklu antibiyotik dirençli Escherichia coli suşlarının Random Amplifiye Polimorfik DNA-PCR (RAPD) yöntemi ile birbirlerine olan genetik yakınlıkları ve yöntemin uygulanabilirliğinin tespit edilmesi amaçlanmıştır.
📊
Temel Bulgular & Veri:Klasik yöntemlerle tanımlanmış olan suşlara 17 antibiyotik için duyarlık testi yapılmıştır.
💡
Sonuç & Katkı:Çalışmaya alınan 61 suşun 32 (%52.4)'sinin birden fazla antibiyotiğe dirençli olduğu tespit edilmiştir.
🔬Tür:Araştırma Makalesi
📍Kapsam:Genişletilmiş Akademik Örneklem
⚙️Değişkenler:Rastgele genişletilmiş polimorfik DNA tekniği · Escherichia coli · Antibiyotikler

Özet

Spinal kord yaralanması (SKY) nedeniyle yatan hastaların idrarlarından hastane infeksiyonu etkeni olarak izole edilen çoklu antibiyotik dirençli Escherichia coli suşlarının Random Amplifiye Polimorfik DNA-PCR (RAPD) yöntemi ile birbirlerine olan genetik yakınlıkları ve yöntemin uygulanabilirliğinin tespit edilmesi amaçlanmıştır. Klasik yöntemlerle tanımlanmış olan suşlara 17 antibiyotik için duyarlık testi yapılmıştır. Çalışmaya alınan 61 suşun 32 (%52.4)'sinin birden fazla antibiyotiğe dirençli olduğu tespit edilmiştir. Bu 32 suş RAPD yöntemi ile genotiplendirilmiştir. Elde edilen bant paternleri ile suşların SPSS 10.0 programında dendrogramları çıkarılmış ve birbirlerine olan genetik yakınlıkları tespit edilmiştir. Buna göre E.coli suşları 12 gruba ayrılırken en geniş grupta altı ve üç grupta da birer sus yer almıştır. Sonuç olarak, E.coli suşlarının genetik olarak birbirlerinden farklı oldukları ve tek kaynaktan köken almadıkları görülmüş, RAPD-PCR yönteminin epidemiyolojik araştırılmalarda uygulanması kolay ve hızlı bir yöntem olduğu sonucuna varılmıştır.

Abstract

Genetic Analysis of Escherichia coli Strains Isolated From Patients With Spinal Cord Injury by Random Amplified Polymorphic DNA-PCR (RAPD) Method It was aimed to find out the genetic relationship in between multipl antibiotic resistant Escherichia.coli strains isolated as nosocomial agents from uriners of patients with spinal cord injury by Random Amplified Polymorphic DNA-PCR (RAPD) and the practicability of this method. The strains identified by convantional methods were performed antimicrobial susceptibility testing for 17 kinds of antibiotic. 32 of 61 (52.4 %) strains were resistant to more than one antibiotic. Those of 32 strains were genotyped by RAPD method. Dendrogram of the strains has been performed on SPSS 10.0 program by using the band patterns and genetic relationship of them was determined. While having six strains in the most extensive group and three groups with only one strains, E.coli strain were described in 12 groups. As regard to genetic differences it was concluded that E.coli strains were not originated from sole source and RAPD was an easy and rapid method for epidemiological researches.

🔖

Bu Makaleye Atıf Yap

KILIÇ, A., YAPAR, M., SARAÇLI, M. A., BAYSALLAR, M., DOĞANCI, L. (2003). Spinal kord yaralanmalı hastalardan izole edilen Escherichia coli suşlarının random amplifiye polimorfik DNA-PCR (RAPD) yöntemi ile genetik analizi. Gülhane Tıp Dergisi, Cilt: 45 - Sayı: 2, 143–146. https://ajindex.com/articles/225752

📄 Tam Metin PDF Okuyucu

📄

PDF görüntüleyici hazırlanıyor...

Kaynakça (9)

  1. Montgomerie, J.Z.: Infection in Patients with Spinal Cord Injuries. Clin Infect Dis;25:1285- 1292,1997
  2. Waites, K.B., Canupp, K.C., Devivo, M.J.: Phagocytosis of Urinary Pathogens in Persons With Spinal Cord Injury. Arch Phys Med Rehabil;75:63-66,1994
  3. Sobel, J.D., Donal, K.: Urinary Tract Infection. Eds.: Mandell GL, Bennett JE, Dolin R. Principles and Practice of Infectious Diseases. 5th Edition, Philedelphia, Churchill Livingstone, 2000, pp 773-805 4. Ramsoota, P., Krovacek, K., Chansiripornchai, N., Mörner, A.P., Svenson, S.B.: Identification of Escherichia coli Recovered from Milk of Sows wıth Coliform Mastitis by Random Amplified Polymorphic DNA (RAPD) Using Standardized Reagents. Acta Vet Scand;41(3):249-259, 2000
  4. Maurer, J.J., Lee, M.D., Lobsinger, C., Brown, T., Maier, M., Thayer, S.G.: Molecular Typing of Avian Escherichia coli Isolates by Random Amplification of Polymorphic DNA. Avian Dis;(42):431-451, 1998
  5. Cavé, H., Bingen, E., Elion, J., Denamur, E.: Differentiation of Escherichia coli strains using randomly amplified polymorphic DNA analysis. Res Microbiol;145:141-150, 1994
  6. Birch, M., Denning, D.W., Law, D.: Rapid Genotyping of Escherichia coli O157 Isolates by Random Amplification of Polymorphic DNA. Eur. J Clin Microbiol nfect Dis;15(4):297-302, 1996
  7. Osek, J.: Genetic Diversity Among Escherichia coli O149:K91 strains solated From Pigs With Diarrhoea Determined by Randomly Amplified Polymorphic DNA Analysis. Research in Veterinary Science;67(2):197-198, 1999
  8. Pacheco, A.B.F., Guth, B.E.C., Almedia, D.F., Ferreira, L.S.C.: Characterization of Enterotoxigenic Escherichia coli by Random Amplification of Polymorphic DNA. Res Microbiol;147(3):175-182, 1996
  9. Bilgehan, H.: Enterobacteriaceae. Eds.: Bilgehan, H.: Klinik Mikrobiyolojik Tanı. 2 nci Baskı, İzmir, Barış Yayınları Fakülteler Kitabevi, 1995, s.425-50 11. Koneman, E.W., Allen, S.D., Janda, W.M., Schreckenberger, P.C., Winn, W.C.: Guidelines for the Collection, Transport, Processing, Analysis, and Reporting of Cultures From Spesific Specimen Sources. Color Atlas and Textbook of Diagnostic Microbiology. 5th edition, Philadelphia, JB Lippincott Co, 1997, pp 121-162 12. National Committee for Clinical Laboratory Standarts. Performans Standarts for Antimicrobial Disk Susceptibility Test. Sixth Edition. Approved Standart M2-A6 1996; Vol 17 No.1, NCCLS. 146 13. Sambrook, J., Fritsch, E.H., Maniatis, T.: B16 Preparation of Reagents and Buffers Used in Molecular Clon