Dergiler / Kafkas Üniversitesi Veteriner Fakültesi Dergisi / 2018 / Cilt: 24 - Sayı: 6

Y-Chromosome Polymorphisms in 12 Native, Karagül, Karacabey Merino Breeds from Turkey and Anatolian Mouflon (Ovis gmelinii anatolica)

Türkiye’den 12 Yerli, Karagül, Karacabey Merinosu ve Anadolu Yaban Koyununda (Ovis gmelinii anatolica) Y-Kromozom Polimorfizmleri

Sayfa
821–828
DOI
—
🏛️Bu makalenin bibliyografik verileri ve tam metin bağlantısı DergiPark üzerinden sağlanmıştır.
DergiPark Kaydı ↗
✨

Yapay Zeka Hızlı Bakış & Çıkarımlar

AI Insight
⚡ TL;DR(1 Cümlede Hızlı Çıkarım)

H4 haplotype seemed to be associated with fat tailed sheep migrating to Turkey, entering from south east of Turkey, which may be related with the arrival of nomadic Turks.

📌 3 Maddede Bu Makale

🎯
Amaç & Hipotez:In this study, 182 male animals from 12 native sheep breeds, as well as Karacabey Merino and Karagül breeds of Anatolia, wild sheep Anatolian Mouflon (Ovis gmelinii anatolica) were used as the study material.
📊
Temel Bulgular & Veri:Based on SRY and SRYM18 regions on the Y-chromosome, haplotypes of the populations were analyzed using DNA sequence analyses.
💡
Sonuç & Katkı:H4 haplotype seemed to be associated with fat tailed sheep migrating to Turkey, entering from south east of Turkey, which may be related with the arrival of nomadic Turks.
🔬Tür:Araştırma Makalesi
📍Kapsam:Genişletilmiş Akademik Örneklem
⚙️Değişkenler:Alan Parametreleri

Özet

In this study, 182 male animals from 12 native sheep breeds, as well as Karacabey Merino and Karagül breeds of Anatolia, wild sheep Anatolian Mouflon (Ovis gmelinii anatolica) were used as the study material. Based on SRY and SRYM18 regions on the Y-chromosome, haplotypes of the populations were analyzed using DNA sequence analyses. The SRY region, A-oY1 allele was observed in all of the individuals studied. On the other hand, four different alleles corresponding to four Y-chromosome haplotypes were detected at the SRYM18 microsatellite region. Among native Anatolian breeds (n=143), H6 haplotype (80.41%), H4 haplotype (9.09%), H8 haplotype (8.40%) and H12 haplotype (2.1%) were identified. H6 haplotype was observed in all 16 individuals of Ovis gmelinii anatolica. Pairwise FST values based on haplotype frequencies were calculated for domestic sheep, and the highest FST value was observed between Karagül and Kıvırcık along with Karagül and Ovis gmelinii anatolica with pairwise FST value of 0.43202 (P<0.01). Y chromosome polymorphism of sheep from Turkey were examined comparatively with the accumulated data in the literature. Out of seven haplotypes (H4, H5, H6, H7, H8, H12, H19) observed in Europe and Asia, 4 haplotypes (H4, H6, H8 and H12) were observed in Anatolia. H12 was a private haplotype of Sakız, H6 seems to be the predominant haplotype of domestic sheep (79.51%) as well as being the only haplotype observed in Ovis gmelini anatolica. H4 haplotype seemed to be associated with fat tailed sheep migrating to Turkey, entering from south east of Turkey, which may be related with the arrival of nomadic Turks.

Abstract

Bu çalışmada, Anadolu’dan yerli evcil koyun (Ovis aries) ırklarından 13 ırk ile kökeni Avrupa’dan olan Bandırma Merinosu koyun ırkı ve Anadolu Yaban Koyunu (Ovis gmelinii anatolica)’na ait olmak üzere toplam 182 erkek birey materyal olarak kullanılmıştır. Y kromozomunda bulunan SRY 5’promotor bölgesi ve Y kromozomuna özel bir mikrosatellit olan SRYM18 bölgeleri DNA dizi analizi yöntemleriyle incelenmiştir. SRY bölgesine ait analizlerde tüm bireylerde SNP A-oY1 alleline rastlanmıştır. SRYM18 mikrosatellit bölgesinde ise 4 farklı allel görülmüş ve toplamda 4 farklı babasal soy, haplotip, tespit edilmiştir. Yerli Anadolu ırklarında (n=143), H6 haplotipi (%80.41), H4 haplotipi (%9.09), H8 haplotipi (%8.40) ve H12 haplotipi (%2.1) belirlenmiştir. Ovis gmelinii anatolica’nın 16 bireyinde de sadece H6 haplotipi gözlenmiştir. Evcil koyunlar için haplotip frekanslarına dayalı FST değerleri hesaplanmış ve en yüksek FST değeri Karagül-Kıvırcık ve Karagül-Ovis gmelinii anatolica arasında FST değeri 0.43202 (P<0.01) gözlenmiştir. Türkiye koyunlarının Y kromozomu polimorfizmi literatürdeki birikmiş verilerle karşılaştırmalı olarak incelenmiştir. Avrupa ve Asya’da gözlenen yedi haplotipten (H4, H5, H6, H7, H8, H12, H19) dördü Anadolu’da (H4, H6, H8 ve H12) gözlenmiştir. H12, Sakız’ın özel bir haplotipi, H6 ise evcil koyunların baskın haplotipi (%79.51) ve Ovis gmelini anatolica’ nın tek haplotipi olarak görülmektedir. H4 haplotipinin Türkiye’ye güneydoğudan girmiş olabileceği düşünülen yağlı kuyruklu koyunla ilişkili olduğu görülmüştür ve bu koyunların göçebe Türklerin gelişi ile ilişkili olabileceği düşünülmektedir.

🔖

Bu Makaleye Atıf Yap

PARMAKSIZ, A., OYMAK, S. A., YÜNCÜ, E., DEMİRCİ, S., BAŞTANLAR, E. K., ÜNAL, E. Ö., TOGAN, İ., ÖZER, F. (2018). Y-Chromosome Polymorphisms in 12 Native, Karagül, Karacabey Merino Breeds from Turkey and Anatolian Mouflon (Ovis gmelinii anatolica). Kafkas Üniversitesi Veteriner Fakültesi Dergisi, Cilt: 24 - Sayı: 6, 821–828. https://ajindex.com/articles/204673

📄 Tam Metin PDF Okuyucu

📄

PDF görüntüleyici hazırlanıyor...

Kaynakça (7)

  1. Roux JP: Türklerin Tarihi: Büyük Okyans’tan Akdeniz’e İki Bin Yıl. 5. Baskı.
  2. AD Yayıncılık, İstanbul, 1997. Toynbee AJ: The Western Question in Greece and Turkey. A Study in the Contact of Civilizations, 3rd ed., New York: Howard fertig, Inc; 1970.
  3. Berkman CC, Dinç H, Sekeryapan C, Togan I: Alu insertion polymorphisms and an assessment of the genetic contribution of Central Asia to Anatolia with respect to the Balkans. Am J Phys Anthropol, 136, 11- 18, 2008. DOI: 10.1002/ajpa.20772 Ocak E, Bingöl M, Gökdal Ö: Van yöresinde yetiştirilen Norduz koyunlarının süt bileşimi ve süt verim özellikleri. YYÜ Tar Bil Derg, 19, 85- 89, 2009.
  4. Ferencakovic M, Curik I, Pérez-Pardal L, Royo LJ, Cubric-Curik V, Fernández I, Álvarez I, Kostelic A, Sprem N, Krapinec K, Goyache F: Mitochondrial DNA and Y-chromosome diversity in East Adriatic sheep. Anim Genet, 44, 184-192, 2013. DOI: 10.1111/j.1365-2052.2012.02393.x Wang Y, Xu L, Yan W, Li S, Wang J, Liu X, Hu J, Luo Y: Y chromosomal haplotype characteristics of domestic sheep (Ovis aries) in China. Gene, 565, 242-245, 2015. DOI: 10.1016/j.gene.2015.04.015 Kdidi S, Yahyaoui MH, García-Manrique B, Sarto P, BEN SASSI M, Khorchani T, Calvo JH: Y chromosome haplotype characterization of Tunisian sheep breeds. Turk J Vet Anim Sci, 39, 333-337, 2015. DOI: 10.3906/vet-1405-95
  5. Zhang M, Peng WF, Yang GL, Lv FH, Liu MJ, Li WR, Liu YG, Li JQ, Wang F, Shen ZQ, Zhao SG, Hehua E, Marzanov N, Murawski M, Kantanen J, Li MH: Y-chromosome haplotype diversity of domestic sheep (Ovis aries) in northern Eurasia. Anim Genet, 45, 903-907, 2014. DOI: 10.1111/age.12214 Ouna AB, Kijas JW, Meadows JRS, Limo M, Hanotte O, Mburu D: Analysis of genetic diversity and relationship between African male sheep using two Y chromosome specific markers. In, Proceedings of the 30th International Conference on Animal Genetics on Biodiversity, the future pass through preservation. Belo Horizonte, Brazil: Colegio Brasileiro de Reproducao Animal, pp.20-25, 2006. TAGEM: Domestic Animal Genetic Resources in Turkey. Republic of Turkey Ministry of Food Agriculture and Livestock General Directorate of Agricultural Research and Policy, Ankara, 2011.
  6. Excoffier L, Laval G, Schneider S: Arlequin (ver. 3.0): An integrated software package for population genetics data analysis. Evol Bioinform Online, 1, 47-50, 2005.
  7. Bandelt J, Forster P, Rohl A: Median-joining networks for inferring intraspecific phylogenies. Mol Biol Evol, 16, 37-48, 1999. DOI: 10.1093/ oxfordjournals. molbev.a0