Dergiler / Kafkas Üniversitesi Veteriner Fakültesi Dergisi / 2020 / Cilt: 26 - Sayı: 3

Generation of Ectodysplasin A (eda)-targeted Knockout Zebrafish Via the CRISPR/Cas9 System

CRISPR/Cas9 Sistemi Kullanılarak Ectodysplasin A (eda) İfade Etmeyen Zebra Balığı Üretimi

Sayfa
371–376
DOI
—
🏛️Bu makalenin bibliyografik verileri ve tam metin bağlantısı DergiPark üzerinden sağlanmıştır.
DergiPark Kaydı ↗
✨

Yapay Zeka Hızlı Bakış & Çıkarımlar

AI Insight
⚡ TL;DR(1 Cümlede Hızlı Çıkarım)

This provides a good model for elucidating the function of EDA in the development of fish scales.

📌 3 Maddede Bu Makale

🎯
Amaç & Hipotez:Ectodysplasin A (EDA) plays a vital role in the development of skin appendages, especially in fish scales.
📊
Temel Bulgular & Veri:Zebrafish model with the mutation of eda was found using CRISPR/Cas9 system.
💡
Sonuç & Katkı:This provides a good model for elucidating the function of EDA in the development of fish scales.
🔬Tür:Modelleme & Sayısal Simülasyon
📍Kapsam:Genişletilmiş Akademik Örneklem
⚙️Değişkenler:Alan Parametreleri

Özet

Ectodysplasin A (EDA) plays a vital role in the development of skin appendages, especially in fish scales. Zebrafish model with the mutation of eda was found using CRISPR/Cas9 system. CRISPR/Cas9 nucleases targeting to two loci in exon 4 of eda, were constructed and injected into zebrafish embryos, respectively. CRISPR-Cas9 mediated mutation frequency toward eda exon 4 was approximately 16%, which was relatively low compared with that of other genes in zebrafish. Five eda mutant types were obtained in F0 generation including a deletion of 5 bp, 6 bp, 8 bp and 87 bp, and an insertion of 11 bp around the targeted site respectively, and all of which happened just in one allele. But the scales of all F0 founders were normal compared with their wild counterparts. In the F1 generation, five scale loss mutants with few scales covered were achieved that were all caused by bi-allelic 11-bp insertion in eda. The insertion results in frameshift mutation of eda and leads to loss of expression and function inactivation of EDA as determined by western blotting. This provides a good model for elucidating the function of EDA in the development of fish scales.

Abstract

Ektodisplasin A (EDA) deri uzantılarının gelişiminde, özellikle balık pullarında, hayati bir rol oynar. CRISPR/Cas9 sistemi kullanılarak eda mutasyonlu zebra balığı modeli bulundu. Eda’nın ekson 4’ünde iki lokusu hedefleyen CRISPR/Cas9 nükleazları oluşturuldu ve zebra balığı embriyolarına enjekte edildi. Eda ekson 4’e yönelik CRISPR-Cas9 aracılı mutasyon sıklığı yaklaşık %16 idi; bu, zebra balığındaki diğer genlerinkine kıyasla nispeten düşüktü. F0 jenerasyonunda, hedeflenen bölge etrafında sırasıyla 5 bp, 6 bp, 8 bp ve 87 bp’lik bir silme ve 11 bp’lik bir ekleme dahil olmak üzere beş eda mutant türü elde edildi ve bunların hepsi sadece bir allelde gerçekleşti. Ancak tüm F0 üyelerinin pulları yabani akranlarına kıyasla normaldi. F1 jenerasyonunda, tamamı eda’ya bi-allelik 11-bp ilavesinden kaynaklanan az sayıda pulla çevrili beş adet pulsuz mutant elde edildi. Ekleme, eda’nın çerçeve kayması mutasyonuna neden olur ve Western Blot tekniği ile belirlendiği üzere EDA’nın ekspresyonunda azalma ve fonksiyon inaktivasyonuna yol açar. Bu çalışma, balık pullarının gelişiminde EDA’nın işlevini açıklamak için iyi bir model oluşturmaktadır.

🔖

Bu Makaleye Atıf Yap

ZHANG, C., HU, L., LIU, S., WANG, W. (2020). Generation of Ectodysplasin A (eda)-targeted Knockout Zebrafish Via the CRISPR/Cas9 System. Kafkas Üniversitesi Veteriner Fakültesi Dergisi, Cilt: 26 - Sayı: 3, 371–376. https://ajindex.com/articles/195694

📄 Tam Metin PDF Okuyucu

📄

PDF görüntüleyici hazırlanıyor...

Kaynakça (1)

  1. Li J, Zhang BB, Bu JW, Du JL: Intron-based genomic editing: A highly efficient method for generating knockin zebrafish. Oncotarget, 6, 17891- 17894, 2015. DOI: 10.18632/oncotarget.4547 2. Kowalczyk-Quintas C, Schneider P: Ectodysplasin A (EDA) - EDA receptor signalling and its pharmacological modulation. Cytokine Growth Factor Rev, 25 (2): 195-203, 2014. DOI: 10.1016/j.cytogfr.2014.01.004 3. Koguchi-Yoshioka H, Wataya-Kaneda M, Yutani M, Murota H, Nakano H, Sawamura D, Katayama I: Atopic diathesis in hypohidrotic/ anhidrotic ectodermal dysplasia. Acta Derm Venereol, 95 (4): 476-479, 2015. DOI: 10.2340/00015555-1978 4. Cluzeau C, Hadj-Rabia S, Jambou M, Mansour S, Guigue P, Masmoudi S, Bal E, Chassaing N, Vincent MC, Viot G, Clauss F, Maniere MC, Toupenay S, Le Merrer M, Lyonnet S, Cormier-Daire V, Amiel J, Faivre L, de Prost Y, Munnich A, Bonnefont JP, Bodemer C, Smahi A: Only four genes (EDA1, EDAR, EDARADD, and WNT10A) account for 90% of hypohidrotic/anhidrotic ectodermal dysplasia cases. Hum Mutat, 32 (1): 70-72, 2011. DOI: 10.1002/humu.21384 5. Srivastava AK, Pispa J, Hartung AJ, Du YZ, Ezer S, Jenks T, Shimada T, Pekkanen M, Mikkola ML, Ko MSH, Thesleff I, Kere J, Schlessinger D: The Tabby phenotype is caused by mutation in a mouse homologue of the EDA gene that reveals novel mouse and human exons and encodes a protein (ectodysplasin-A) with collagenous domains. Proc Natl Acad Sci USA, 94 (24): 13069-13074, 1997. DOI: 10.1073/pnas.94.24.13069 6. Harris MP, Rohner N, Schwarz H, Perathoner S, Konstantinidis P, Nusslein-Volhard C: Zebrafish eda and edar mutants reveal conserved and ancestral roles of ectodysplasin signaling in vertebrates. Plos Genet, 4 (10):e1000206, 2008. DOI: 10.1371/journal.pgen.1000206 7. Schneider P, Street SL, Gaide O, Hertig S, Tardivel A, Tschopp J, Runkel L, Alevizopoulos K, Ferguson BM, Zonana J: Mutations leading to X-linked hypohidrotic ectodermal dysplasia affect three major functional domains in the tumor necrosis factor family member ectodysplasin-A. J Biol Chem, 276 (22): 18819-18827, 2001. DOI: 10.1074/ jbc.M101280200 8. Pääkkönen K, Cambiaghi S, Novelli G, Ouzts LV, Penttinen M, Kere J, Srivastava AK: The mutation spectrum of the EDA gene in X-linked anhidrotic ectodermal dysplasia. Hum Mutat, 17 (4): 349, 2001. DOI: 10.1002/humu.33 9. Bayes M, Hartung AJ, Ezer S, Pispa J, Thesleff I, Srivastava AK, Kere J: The anhidrotic ectodermal dysplasia gene (EDA) undergoes alternative splicing and encodes ectodysplasin-A with