Dergiler / Acta Aquatica Turcica / 2019 / Cilt: 15 - Sayı: 2

Marmara Denizi’nde Yayılış Gösteren Aurelia aurita Denizanası Türünün Filogenetik Analizi

Phylogenetic Analysis of Jellyfish Species of Aurelia aurita Distributed in the Sea of Marmara

Sayfa
163–170
Yayın Tarihi
2019-06-14
DOI
—
🏛️Bu makalenin bibliyografik verileri ve tam metin bağlantısı DergiPark üzerinden sağlanmıştır.
DergiPark Kaydı ↗
✨

Yapay Zeka Hızlı Bakış & Çıkarımlar

AI Insight
⚡ TL;DR(1 Cümlede Hızlı Çıkarım)

Filogenetik analizler GenBank’tan alınan dizilerle birlikte değerlendirilerek gerçekleştirilmiş ve türler arası ilişkiler belirlenmiştir.

📌 3 Maddede Bu Makale

🎯
Amaç & Hipotez:Çalışmamızda Marmara Denizi sahillerinde yayılış gösteren Knidliler şubesine ait Aurelia aurita denizanası türü filogenetik olarak incelenmiştir.
📊
Temel Bulgular & Veri:Bunun için Ekim 2017- Şubat 2018 tarihleri arasında Marmara Denizi’nin kuzey ve güney sahillerinden toplanan denizanası örneklerinden DNA’lar izole edilmiş ve mitokondrial Sitokrom Oksidaz Altünite I (COI), 16S rDNA, nüklear 18S rDNA ve Internal Transcribed Spacer 1 (ITS1) gen bölgeleri Polimeraz Zincir reaksiyonu (PCR) ile amplifiye edilmiş ve ardından dizi analizleri yapılmıştır.
💡
Sonuç & Katkı:Filogenetik analizler GenBank’tan alınan dizilerle birlikte değerlendirilerek gerçekleştirilmiş ve türler arası ilişkiler belirlenmiştir.
🔬Tür:Deneysel Tarla Denemesi
📍Kapsam:2017 Verileri
⚙️Değişkenler:Aurelia aurita · COI · 16S rDNA

Özet

Çalışmamızda Marmara Denizi sahillerinde yayılış gösteren Knidliler şubesine ait Aurelia aurita denizanası türü filogenetik olarak incelenmiştir. Bunun için Ekim 2017- Şubat 2018 tarihleri arasında Marmara Denizi’nin kuzey ve güney sahillerinden toplanan denizanası örneklerinden DNA’lar izole edilmiş ve mitokondrial Sitokrom Oksidaz Altünite I (COI), 16S rDNA, nüklear 18S rDNA ve Internal Transcribed Spacer 1 (ITS1) gen bölgeleri Polimeraz Zincir reaksiyonu (PCR) ile amplifiye edilmiş ve ardından dizi analizleri yapılmıştır. Filogenetik analizler GenBank’tan alınan dizilerle birlikte değerlendirilerek gerçekleştirilmiş ve türler arası ilişkiler belirlenmiştir.

Abstract

In our study, the species Aurelia aurita jellyfish belonging to the Cnidaria branch distributed in the coasts of the Marmara Sea were examined phylogenetically. For this purpose, DNAs were isolated from the jellyfish samples collected from the northern and southern coasts of the Marmara Sea between October 2017 and February 2018, and mitochondrial Cytochrome Oxidase Subunit I (COI), 16S rDNA, nuclear 18S rDNA and Internal Transcribed Spacer 1 (ITS1) gene regions were amplified by PCR and sequence analysis was performed. Phylogenetic analysis was carried out with the evaluation of the obtained results together with the sequences obtained from GenBank and inter-species relationships were determined.

🔖

Bu Makaleye Atıf Yap

GÜNEŞ, M., POLAT, F. (2019). Marmara Denizi’nde Yayılış Gösteren Aurelia aurita Denizanası Türünün Filogenetik Analizi. Acta Aquatica Turcica, Cilt: 15 - Sayı: 2, 163–170. https://ajindex.com/articles/18428

📄 Tam Metin PDF Okuyucu

📄

PDF görüntüleyici hazırlanıyor...

Kaynakça (10)

  1. Appeltans, W., Ahyong, S. T., Anderson, G., Angel, M. V., Artois, T., Bailly, N., Bamber, R., Barber, A., Batsch, I., & Berta, A. (2012). The Magnitude of Global Marine Species Diversity. Current Biology, 22, 2189-2202.
  2. Arai, M. N. (1996). Functional Biology of Scyphozoa, 1st ed., Chapman and Hall, New York. Batovska, J., Cogan, N. O., Lynch, S. E., & Blacket, M. J. (2017). Using Next-Generation Sequencing for DNA Barcoding: Capturing Allelic Variation in ITS2, G3 Genes/Genomes/Genetics, 7, 19-29.
  3. Bayha, K. M., Dawson, M. N., Collins, A. G., Barberitos, M. S., & Haddock, S. H. D. (2010). Evolutionary relationships among scyphozoan jellyfish families based on complete taxon sampling and phylogenetic analysis of 18S and 28S ribosomal DNA, Integrative and Comparative Biology, 50 (3), 436-455.
  4. Beauchamp, K. A., & Powers, D. A. (1996). Sequence variation of the first ınternal spacer (ITS1-1) of Ribosomal DNA in ahermatypic corals from California, Molecular marine biology and biotechnology., 5, 357-362.
  5. Bucklin, A., Steinke, D., & Blanco-Bercial L. (2011). DNA barcoding of marine metazoa. Annual Reviews of Marine Science. 3, 471-508.
  6. Chalwatzis, N., Bauer, A., Stetzer, E., Kinzelbach, R., & Zimmermann, F. K. (1995). Strongly expanded 18S rRNA genes correlated with a peculiar morphology in the ınsect order of Strepsiptera, Zoology, 98, 115-126.
  7. Chen, C. A., Willis, B. L., & Miller, D. J. (1996). Systematic relationships between tropical corallimopharians (Cnidaria: Anthozoa: Corallimorpharia): utility of the 5.8S and ınternal transcribed spacer (ITS) regions of the rDNA transcription unit, Bulletin of Marine Science, 59, 196-208.
  8. Coll, M., Piroddi, C., Steenbeek, J., Kaschner, K., Lasram, F. B. R., Aguzzi, J., Ballesteros, E., Bianchi, C. N., Corbera, J., & Dailianis, T. (2010). The biodiversity of the Mediterranean Sea: estimates, patterns and threads, PLoS, 5,11842. Çardak, M. (2002).
  9. Çanakkale Boğazı, Nara Burnu civarındaki scyphozoa ve ctenophora türleri ile bunların bölgedeki dağılımlarının araştırılması, Yüksek Lisans Tezi, Çanakkale Onsekiz Mart Üniversitesi, Fen Bilimleri Enstitüsü, ref. no: 121545. Dawson, M. N., & Jacobs, D. K. (2001). Molecular evidence for cryptic species of Aurelia aurita (Cnidaria, Scyphozoa), The Biological Bulletin, 200, 92-96.
  10. Dawson, M. N. (2005).Incipient speciation of Catostylus mosaicus (Scyphozoa, Rhizostomeae, Catostylidae), comparative phylogeography and biogeography in southeastern Australia, Journal of Biogeography 32, 5