Dergiler / Osmaniye Korkut Ata Üniversitesi Fen Bilimleri Enstitüsü Dergisi / 2026 / Cilt: 6 Sayı: 1

Türkiye’nin Doğu Akdeniz Kıyılarında Yayılım Gösteren İki Diplodus Tür Populasyonunda DNA Barkodlama ve Filogenetik analiz

DNA barcoding and phylogenetic analysis of two species populations of Diplodus from the eastern Mediterranean coasts of Turkey

Makbule Baylan(ÇUKUROVA ÜNİVERSİTESİ, SU ÜRÜNLERİ FAKÜLTESİ)0000-0003-0549-0662
Gamze Mazı(Çukurova Üniversitesi Su Ürünleri Fakültesi)0000-0002-3160-2480
B. Devrim Özcan(Çukurova Üniversitesi Ziraat Fakültesi)0000-0002-9198-656X
Sedat Gundogdu(Çukurova Üniversitesi Su Ürünleri Fakültesi)0000-0002-4415-2837
Dilek Tekdal(Mersin Üniversitesi Fen Edebiyat Fakültesi)0000-0002-4545-9005
Sayfa
806–817
Yayın Tarihi
2023-03-10
🏛️Bu makalenin bibliyografik verileri ve tam metin bağlantısı DergiPark üzerinden sağlanmıştır.
DergiPark Kaydı ↗
✨

Yapay Zeka Hızlı Bakış & Çıkarımlar

AI Insight
⚡ TL;DR(1 Cümlede Hızlı Çıkarım)

Sonuç olarak, COI geninin haplotip ve nükleotit çeşitliklerine dayalı olarak populasyonlar arasında düşük bir genetik varyasyona sahip olduğu saptanmıştır.

📌 3 Maddede Bu Makale

🎯
Amaç & Hipotez:Türkiye üç tarafı denizlerle çevrili ve farklı iklimsel özelliklere sahip olduğundan biyoçeşitlilik açısından son derece zengin bir ülke konumundadır.
📊
Temel Bulgular & Veri:Bu amaçla, Sparidae (Mercan balıkları) familyasına ait iki türün (Diplodus vulgaris ve Diplodus sargus) populasyonları arasındaki polimorfizm, 652 baz çiftine sahip mitokondriyal sitokrom c oksidaz I (COI) geninin nükleotid dizisi kullanılarak belirlenmiştir. 143 Diplodus örneği Doğu Akdeniz (İskenderun ve Mersin) ve Batı Akdeniz (Antalya) lokalitelerinden toplanmıştır.
💡
Sonuç & Katkı:Sonuç olarak, COI geninin haplotip ve nükleotit çeşitliklerine dayalı olarak populasyonlar arasında düşük bir genetik varyasyona sahip olduğu saptanmıştır.
🔬Tür:Laboratuvar & Saha Deneyi
📍Kapsam:Genişletilmiş Akademik Örneklem
⚙️Değişkenler:Diplodus vulgaris · Diplodus sargus · COI geni

Özet

Türkiye üç tarafı denizlerle çevrili ve farklı iklimsel özelliklere sahip olduğundan biyoçeşitlilik açısından son derece zengin bir ülke konumundadır. Deniz ekosistemi için büyük öneme sahip balık tür ve çeşitlerinin tespiti gerek son yıllarda yadsınamaz derecede hissedilen kuraklık koşulları nedeni ile bu türlerin korunması ve gerekse de insan besin proteini açısından bu türlerin kullanılması bakımından önemlidir. Sunulan bu çalışmada, balık türleri içerisinde önemi en az bilinen türlerden olan Diplodus türlerinin Türkiye denizlerindeki genetik çeşitliliğinin belirlenmesi amaçlanmıştır. Bu amaçla, Sparidae (Mercan balıkları) familyasına ait iki türün (Diplodus vulgaris ve Diplodus sargus) populasyonları arasındaki polimorfizm, 652 baz çiftine sahip mitokondriyal sitokrom c oksidaz I (COI) geninin nükleotid dizisi kullanılarak belirlenmiştir. 143 Diplodus örneği Doğu Akdeniz (İskenderun ve Mersin) ve Batı Akdeniz (Antalya) lokalitelerinden toplanmıştır. Balık örneklerinden kas dokusu alınarak DNA izolasyonu yapılmıştır. PCR ile COI geni çoğaltılarak bu lokuslara ait genetik farklılık analizleri yapılmış ve farklılığın yüksek olduğu izolatlarda ilişkileri göstermek için filogenetik ağaç oluşturulmuştur. Sonuç olarak, COI geninin haplotip ve nükleotit çeşitliklerine dayalı olarak populasyonlar arasında düşük bir genetik varyasyona sahip olduğu saptanmıştır.

Abstract

Since Turkey is surrounded by seas on three sides and has different climatic characteristics, it has an extremely rich biodiversity. Identifying fish species and varieties is of great importance for protecting them from drought conditions seen in recent years and using them as a source of human food protein. The purpose of this study was to identify the genetic diversity of Diplodus, one of the fish species the importance of which is under appreciated, in Turkish seas. To this end, the polymorphism between the populations of two species (Diplodus vulgaris and Diplodus sargus) from the Sparidae (Coral fish) family was determined using the nucleotide sequence of the mitochondrial cytochrome c oxidase I (COI) gene, which is 652 base pairs long. 143 specimens of Diplodus were collected from the locations in the Eastern Mediterranean (İskenderun and Mersin) and Western Mediterranean (Antalya). The COI gene was amplified by PCR, genetic diversity analyses of these loci were carried out, and a phylogenetic tree was created to show the relationships between the isolates with a high difference. In conclusion, based on the haplotype and nucleotide diversity patterns, it was found that the COI gene had a low genetic variation among the populations.

🔖

Bu Makaleye Atıf Yap

Baylan, M., Mazı, G., Özcan, B. D., Gundogdu, S., Tekdal, D. (2023). Türkiye’nin Doğu Akdeniz Kıyılarında Yayılım Gösteren İki Diplodus Tür Populasyonunda DNA Barkodlama ve Filogenetik analiz. Osmaniye Korkut Ata Üniversitesi Fen Bilimleri Enstitüsü Dergisi, Cilt: 6 Sayı: 1, 806–817. https://doi.org/10.47495/okufbed.1201878

📄 Tam Metin PDF Okuyucu

📄

PDF görüntüleyici hazırlanıyor...

Kaynakça (8)

  1. Abbas EM., Soliman T., El-Magd MA., Farrag MMS., Ismail RF., Kato M. Phylogeny and DNA barcoding of the family Sparidae inferred from mitochondrial DNA of the Egyptian waters phylogeny and DNA barcoding of the family Sparidae inferred from mitochondrial DNA of the Egyptian waters. Journal of Fisheries and Aquatic Science 2017; 12(2): 73-81.
  2. Acarli D., Kara A., Bayhan B., Çoker T. Catch composition and catch efficiency of species caught from Homa Lagoon (Izmir Bay, Aegean Sea). Ege Journal of Fisheries and Aquatic Sciences 2009; 26(1): 39-47.
  3. Ali MA., Gyulai G., Hidvégi N., Kerti B., Al Hemaid FMA., Pandey AK. The changing epitome of species identification-DNA barcoding. Saudi Journal of Biological Sciences 2014; 21(3): 204-231.
  4. Aravind K., Ravikanth G., Shaanker RU., Chandrashekara K., Kumar ARV., Ganeshaiah KN. DNA barcoding: An exercise in futility or utility?. Current Science 2007; 92(9): 1213-1216.
  5. Bardeleben C., Moore RL., Wayne K. A molecular phylogeny of the Canidae based on six nuclear loci. Molecular Phylogenetics and Evolution 2005; 37(3): 815-831.
  6. Bernatchez L., Guyomard R., Bonhomme F. DNA sequence variation of the mitochondrial control region among geographically and morphologically remote European brown trout Salmo trutta populations. Molecular Ecology 1992; 1: 161-173.
  7. Billington N., Barrette R.J., Hebert PDN. Management implications of mitochondrial DNA variation in walleye stocks. North American Journal of Fisheries Management 1992; 12(2):276-284.
  8. Charles H. Godfray J. Challenges for taxonomy. Nature 2002; 417(6884): 17-19.