KaydedilenlerDerginizi ekleyin

Dergiler / TSK Koruyucu Hekimlik Bülteni / 2014 / Cilt: 13 - Sayı: 5

Mikrobiyoloj ik Tanımlamada MALDI-TOF MS Uygulamaları

Applications of MALDI-TOF MS in Microbiological İdentification

Soner YILMAZ
Serhat DUYAN
CUMHUR ARTUK
Hüsrev DİKTAŞ
Sayfa
421–426
DOI
—
🏛️Bu makalenin bibliyografik verileri ve tam metin bağlantısı DergiPark üzerinden sağlanmıştır.
DergiPark Kaydı ↗
✨

Yapay Zeka Hızlı Bakış & Çıkarımlar

AI Insight
⚡ TL;DR(1 Cümlede Hızlı Çıkarım)

Konvansiyonel ve moleküler tanımlama yöntemleri ile kıyaslanacak olursa MALDI-TOF MS örnek başı maliyeti ve tanımlama için geçen süre yönünden çok daha etkin görülmektedir.

📌 3 Maddede Bu Makale

🎯
Amaç & Hipotez:MALDI-TOF MS (Matriks assisted laser desorption ionization time of flight mass spectrometry) günümüzde mikroorganizma tanımlanmasında kullanılan yeni bir yöntemdir.
📊
Temel Bulgular & Veri:Tanımlama için temel alınan mikroorganizma proteinleri ise esasen çevresel koşullardan az etkilenen ribozomal proteinlerden oluşmaktadır.
💡
Sonuç & Katkı:Konvansiyonel ve moleküler tanımlama yöntemleri ile kıyaslanacak olursa MALDI-TOF MS örnek başı maliyeti ve tanımlama için geçen süre yönünden çok daha etkin görülmektedir.
🔬Tür:Araştırma Makalesi
📍Kapsam:Genişletilmiş Akademik Örneklem
⚙️Değişkenler:Alan Parametreleri

Özet

MALDI-TOF MS (Matriks assisted laser desorption ionization time of flight mass spectrometry) günümüzde mikroorganizma tanımlanmasında kullanılan yeni bir yöntemdir. Bu yöntem, mikroorganizmaların protein yapılarını iyonize ettikten sonra elektrik alandan geçirerek protein profillerinin çıkarılması esasına dayanır. Elde edilen profiller sistemin kütüphanesindeki verilerle karşılaştırılarak tanımlama yapılır. Tanımlama için temel alınan mikroorganizma proteinleri ise esasen çevresel koşullardan az etkilenen ribozomal proteinlerden oluşmaktadır. MALDI-TOF MS ile yapılacak tanımlama çalışmaları tercihen taze kültürlerden yapılmalıdır. Eski kültürlerde ribozomal proteinlerde bozulmalar meydana gelmektedir. Rutin bakteri izolatlarında %84,1 ile %95,2 arasında değişen oranda doğru tanımlama yapmaktadır. Maya tanımlamasında da başarı oranı %85 ile %100 arasında değişmektedir. Pozitif kan kültür şişelerinden, subkültüre gerek olmadan tanımlama yapabilmektedir. İdrar örneklerinde mikrolitrede 105 ve üzeri bakteri olduğunda da direkt örnekten tanımlama yapabilmektedir. Konvansiyonel ve moleküler tanımlama yöntemleri ile kıyaslanacak olursa MALDI-TOF MS örnek başı maliyeti ve tanımlama için geçen süre yönünden çok daha etkin görülmektedir.

Abstract

MALDI-TOF MS (Matriks assisted laser desorption ionization time of flight mass spectrometry) is a new metohod for identification of microorganisms nowadays. This method is based revealing of microorganisms protein profile with ionization of protein structure and these ionized mass pass through the electrical field. Profiles which were obtained from microorganisms compare with database of system thus identification is made by this way. Ribosomal proteins are used in identification which are less affected by enviromental conditions. Fresh culture should preferably use in MALDI-TOF MS identification. Ribosomal proteins can be deteriorate in old cultures. The correct identification rates are changing between 84,1% to 95,2% in routine bacterial isolates. The correct identification rates in yeasts are changing between 85% to 100%. It makes identification in positive blood culture bottles without the need of subculture, also makes identification on urine samples without the need of culture which has greater than 105 microorganisms in a microliter. When it compared with conventional and molecular identification methods, it is more effective on per sample costs and elapsed time on working.

🔖

Bu Makaleye Atıf Yap

YILMAZ, S., DUYAN, S., ARTUK, C., DİKTAŞ, H. (2014). Mikrobiyoloj ik Tanımlamada MALDI-TOF MS Uygulamaları. TSK Koruyucu Hekimlik Bülteni, Cilt: 13 - Sayı: 5, 421–426. https://ajindex.com/articles/127578

📄 Tam Metin PDF Okuyucu

📄

PDF görüntüleyici hazırlanıyor...

Kaynakça (13)

  1. Croxatto A, Prod'hom G, Greub G. Applications of MALDI-TOF mass spectrometry in clinical diagnostic microbiology. FEMS Microbiol Rev. 2012;36(2): 380-407
  2. Wieser A, Schneider L, Jung J, Schubert S. MALDI-TOF MS in microbiological diagnostics- identification of microorganisms and beyond. Appl Microbiol Biotechnol. 2012;93(3):965-74
  3. Anhalt JP, Fenselau C. Identification of bacteria using mass spectrometry. Anal Chem. 1975;47: 219-25
  4. Heller DN, Cotter RJ, Fenselau C, Uy OM. Profiling of bacteria by fast atom bombardment mass spectrometry. Anal Chem. 1987; 59: 2806-09
  5. Claydon MA, Davey SN, Edwards-Jones, Gordon DB. The rapid identification of intact microorganisms using mass spectrometry. Nat Biotechnol. 1996;14: 1584–86
  6. Holland RD, Wilkes JG, Rafii F, et al. Rapid identification of intact whole bacteria based on spectral patterns using matrixassisted laser desorption/ionization with time-of-flight mass spectrometry. Rapid Commun Mass Spectrom. 1996;10: 1227–32
  7. Marvin LF, Roberts MA, Faya LB. Matrix-assisted laser desorption/ionization time-of-flight mass spectrometry in clinical chemistry. Clin Chim Acta. 2003;337(1-2):11–21
  8. Bizzini A, Jaton K, Romo D, Bille J, Prod’hom G, Greub G. Matrix-assisted laser desorption ionization-time of flight mass spectrometry as an alternative to 16S rRNA gene sequencing for identification of difficult-to-identify bacterial strains. J Clin Microbiol. 2011;49: 693–96
  9. Suh MJ & Limbach PA. Investigation of methods suitable for the matrix-assisted laser desorption/ ionization mass spectrometric analysis of proteins from ribonucleoprotein complexes. Eur J Mass Spectrom (Chichester, Eng). 2004;10: 89–99
  10. Valentine N, Wunschel S, Wunschel D, Petersen C, Wahl K. Effect of culture conditions on microorganism identification by matrix-assisted laser desorption ionization mass spectrometry. Appl Environ Microbiol. 2005;71: 58–64
  11. Eigner U, Holfelder M, Oberdorfer K, Betz-Wild U, Bertsch D, Fahr AM. Performance of a matrix- assisted laser desorption ionizationtime- of-flight mass spectrometry system for the identification of bacterial isolates in the clinical routine laboratory. Clin Lab. 2009; 55: 289–96
  12. Seng P, Drancourt M, Gouriet F, et al. Ongoing revolution in bacteriology: routine identification of bacteria by matrix-assisted laser desorption ionization time-of-flight mass spectrometry. Clin Infect Dis. 2009; 49: 543–51
  13. Holler JG, Pedersen LK, Calum H, et al. Using MALDI-TOF mass spe