Dergiler / Kocatepe Veteriner Dergisi / 2018 / Cilt: 11 - Sayı: 1

İnfeksiyonların Tanısında En Çok Kullanılan İzotermal Amplifikasyon Yöntemleri

Isothermal Amplification Methods Most Used in the Diagnosis of Infections

Sayfa
86–95
Yayın Tarihi
2018-03-01
DOI
—
🏛️Bu makalenin bibliyografik verileri ve tam metin bağlantısı DergiPark üzerinden sağlanmıştır.
DergiPark Kaydı ↗
✨

Yapay Zeka Hızlı Bakış & Çıkarımlar

AI Insight
⚡ TL;DR(1 Cümlede Hızlı Çıkarım)

Bu yöntemler, kullanılan enzim çeşitliliği, primerler, duyarlılıkları ile özgüllükleri bakımından farklılıklar göstermektedir.

📌 3 Maddede Bu Makale

🎯
Amaç & Hipotez:Nükleik asit amplifikasyonu, enfeksiyonların, tümörlerin, genetik anormalliklerin tanısında ve adli tıpta en fazla kullanılan yöntemlerdendir.
📊
Temel Bulgular & Veri:Bu yöntemler, kullanılan enzim çeşitliliği, primerler, duyarlılıkları ile özgüllükleri bakımından farklılıklar göstermektedir.
💡
Sonuç & Katkı:Bu derlemede izotermal amplifikasyon yöntemlerinden en sık kullanılanları, prensipleri, kullanım alanları ve getirdikleri yenilikler ele alınmıştır.
🔬Tür:Literatür & Derleme Çalışması
📍Kapsam:Genişletilmiş Akademik Örneklem
⚙️Değişkenler:İzotermal Amplifikasyon · LAMP · NASBA

Özet

Nükleik asit amplifikasyonu, enfeksiyonların, tümörlerin, genetik anormalliklerin tanısında ve adli tıpta en fazla kullanılan yöntemlerdendir. İzotermal amplifikasyon yöntemleri, Polimeraz Zincir Reaksiyonu (PZR) metoduna göre sabit sıcaklıkta yapılmasıyla karmaşıklığı azaltır. Bu yöntemler, kullanılan enzim çeşitliliği, primerler, duyarlılıkları ile özgüllükleri bakımından farklılıklar göstermektedir. Bu derlemede izotermal amplifikasyon yöntemlerinden en sık kullanılanları, prensipleri, kullanım alanları ve getirdikleri yenilikler ele alınmıştır.

Abstract

Isothermal amplification of nucleic acid is one of the most commonly used methods to identify the infections, tumors, genetic abnormalities, and in forensic medicine. As isothermal amplification methods can be performed at one reaction temperature under simple conditions they are less complex in comparison to Polymerase Chain Reaction (PCR). These methods differ from each other with the diversity of enzymes, primers used, sensitivity and specificity. In this review, the most commonly used isothermal amplification methods, their principles, areas of use and innovations brought about are discussed.

🔖

Bu Makaleye Atıf Yap

ÜVEY, M., ÜNAL, N. (2018). İnfeksiyonların Tanısında En Çok Kullanılan İzotermal Amplifikasyon Yöntemleri. Kocatepe Veteriner Dergisi, Cilt: 11 - Sayı: 1, 86–95. https://ajindex.com/articles/124847

📄 Tam Metin PDF Okuyucu

📄

PDF görüntüleyici hazırlanıyor...

Kaynakça (9)

  1. Ahmed A, Van Der Linden H, Hartskeerl RA. Development of a recombinase polymerase amplification assay for the detection of pathogenic Leptospira. Int J Environ Res Public Health. 2014; 11:4953-4964.
  2. Altındiş M, Elmas M, Kılıç Ü, Aslan F G, Küçükkara G, Köroğlu M. Grup A Streptokokların hızlı moleküler tanısında loop-mediated isothermal amplifi cation PCR (LAMP-PCR). J Biotechnol Strategic Health Res. 2017;1:11-16.
  3. Angamuthu R, Baskaran S, Gopal DR, Devarajan J, Kathaperumal K. Rapid detection of the marek's disease viral genome in chicken feathers by loop-mediated isothermal amplification. J Clin Microbiol. 2012; 50:961-965. Banér J, Nilsson M, Mendel-Hartvig M, Landegren U. Signal amplification of padlock probes by rolling circle replication. Nucleic Acids Res. 1998; 26: 5073-5078.
  4. Barkway CP, Pocock RL, Vrba V, Blake DP. Loop-mediated isothermal amplification (lamp) assays for the species-specific detection of Eimeria that infect chickens. JoVE. 2015:e52552. Bulut E., Köker M. P., Ünal N., Yildirim M. Salmonella enterica’nın LAMP ile belirlenmesi XII. Ulusal Veteriner Hekimleri Mikrobiyoloji Kongresi (Uluslararası Katılımlı), Kongre Özet Kitabı p: 47-48 pp., 30 Ağustos-02 Eylül 2016
  5. Kapadokya, Nevşehir, 2016.
  6. Cao Y, Kim H-J, Li Y, Kong H, Lemieux B, (2013) Helicase-dependent amplification of nucleic acids current protocols in molecular biology. Eds: John Wiley & Sons, Inc., p: 15.11.01-15.11.012. Chang C-C, Chen C-C, Wei S-C, Lu H-H, Liang Y-H, Lin C-W. Diagnostic devices for isothermal nucleic acid amplification. Sensors. 2012; 12: 8319-8337.
  7. Chantratita N, Meumann E, Thanwisai A, Limmathurotsakul D, Wuthiekanun V, Wannapasni S, Tumapa S, Day NPJ, Peacock SJ. Loop-mediated isothermal amplification method targeting the tts1 gene cluster for detection of Burkholderia pseudomallei and diagnosis of melioidosis. J Clin Microbiol, 2008; 46: 568-573.
  8. Chen H-T, Zhang J, Ma Y-P, Ma L-N, Ding Y-Z, Liu X-T, Cai X-P, Ma L-Q, Zhang Y-G, Liu Y-S. Reverse transcription loop-mediated isothermal amplification for the rapid detection of infectious bronchitis virus in infected chicken tissues. Mol Cell Probes. 2010; 24:104-106.
  9. Chow WHA, Mccloskey C, Tong Y, Hu L, You Q, Kelly CP, Kong H, Tang Y-W, Tang W. Application of isothermal helicase-dependent amplification with a disposable detection device in a simple sensitive stool test for toxigenic Clostridium difficile. J Mol Diagn. 2008; 10:452-458. Compton J. Nucleic acid sequence-based amplification. Nature. 1991; 350:91-