Dergiler / Mediterranean Agricultural Sciences / 2016 / Cilt: 29 - Sayı: 1

Domates güvesinin [Tuta absoluta (Meyrick) (Lepidoptera: Gelechiidae)] Batı Akdeniz Bölgesi populasyonlarının mitokondrial cytochrome oxidase subunit I (mtCOI)’e göre genetik varyasyonunun incelenmesi

Determination of genetic variation of tomato leafminer [Tuta absoluta (Meyrick) (Lepidoptera: Gelechiidae)] populations from west mediterreanean region of Turkey based on mitochondrial cytochrome oxidase I (mtCOI)

Sayfa
0–0
Yayın Tarihi
2016-05-23
DOI
—
🏛️Bu makalenin bibliyografik verileri ve tam metin bağlantısı DergiPark üzerinden sağlanmıştır.
DergiPark Kaydı ↗
✨

Yapay Zeka Hızlı Bakış & Çıkarımlar

AI Insight
⚡ TL;DR(1 Cümlede Hızlı Çıkarım)

Gen bankasından elde edilen verilere göre Türkiye popülasyonları ile Güney Amerika ve bazı Avrupa popülasyonları arasında yüksek benzerlik olduğu gözlemlenmiştir.

📌 3 Maddede Bu Makale

🎯
Amaç & Hipotez:Bu çalışmada Tuta absoluta`nın genetik varyasyonu mtCOI gen bölgesinin dizi analizine göre belirlenmiştir.
📊
Temel Bulgular & Veri:Bu amaçla zararlının ergin bireyleri Batı Akdeniz bölgesinden Anamur, Gazipaşa, Serik, Antalya-Konyaaltı, Kumluca, Demre, Kınık ve Fethiye popülasyonlarından denemelerde kullanılmak üzere 2011 yılında domates bitkisinden toplanmıştır.
💡
Sonuç & Katkı:Gen bankasından elde edilen verilere göre Türkiye popülasyonları ile Güney Amerika ve bazı Avrupa popülasyonları arasında yüksek benzerlik olduğu gözlemlenmiştir.
🔬Tür:Deneysel Tarla Denemesi
📍Kapsam:2011 · 10 birey
⚙️Değişkenler:DNA etiketleme · mtCOI · Tuta absoluta

Özet

Bu çalışmada Tuta absoluta`nın genetik varyasyonu mtCOI gen bölgesinin dizi analizine göre belirlenmiştir. Bu amaçla zararlının ergin bireyleri Batı Akdeniz bölgesinden Anamur, Gazipaşa, Serik, Antalya-Konyaaltı, Kumluca, Demre, Kınık ve Fethiye popülasyonlarından denemelerde kullanılmak üzere 2011 yılında domates bitkisinden toplanmıştır. Tek bir bireyden DNA izolasyonları yapılmış ve her bir popülasyondan en az 10 bireyden DNA izolasyonu yapılmıştır. DNA`lar mtCOI gen bölgesine spesifik “C1-J-2195 Forward ve TL2-N-3014 Reverse” primerleriyle çoğaltılmıştır. Sekans analizi sonunda yaklaşık olarak 747 bazlık sekans dizilimi Mega 4 programı ile dizi doğrulaması yapılarak analiz edilmiştir. Analizler sonucunda popülasyonlar arasında ve popülasyon içindeki bireyler arasında genetik farklılığın olmadığı belirlenmiştir. Gen bankasından elde edilen verilere göre Türkiye popülasyonları ile Güney Amerika ve bazı Avrupa popülasyonları arasında yüksek benzerlik olduğu gözlemlenmiştir. Sekans verileri ayrıca gen banka kaydedilmiştir.

Abstract

In this study, the genetic variation of Tuta absoluta was studied based on the sequences of mtCOI gene region. For this purpose, the samples of the adult pest were collected from tomato plants grown in Anamur, Gazipaşa, Serik, Antalya-Konyaaltı, Kumluca, Demre, Kınık and Fethiye district of western Mediterranean region in 2011. Minimum ten DNA was extracted individually from each. The mtCOI gene was amplified and sequenced with the primer pair “C1-J-2195 and TL2-N-3014 specific to this region. The sequences were aligned and analyzed by using Mega 4 software program. An approximately 747 base pair of informative sequences were obtained and used in the analyses. The results of the analysis showed that there was no inter and intra-population polymorphism in the sequences of individuals among the populations studied here. A high sequence similarity was found when the sequences of Turkish populations were compared with the Gen bank sequences of the South American and some European populations of the pest. Sequences were deposited in Gene bank.

🔖

Bu Makaleye Atıf Yap

YÜKSELBABA, U., GÖÇMEN, H. (2016). Domates güvesinin [Tuta absoluta (Meyrick) (Lepidoptera: Gelechiidae)] Batı Akdeniz Bölgesi populasyonlarının mitokondrial cytochrome oxidase subunit I (mtCOI)’e göre genetik varyasyonunun incelenmesi. Mediterranean Agricultural Sciences, Cilt: 29 - Sayı: 1, 0–0. https://ajindex.com/articles/123361

📄 Tam Metin PDF Okuyucu

📄

PDF görüntüleyici hazırlanıyor...

Kaynakça (12)

  1. Bettaibi A, Mezghani-Khemakhem M, Bouktila D, Makni H, Makni M, (2012) Genetic Variability of the tomato leaf miner (Tuta absoluta Meyrick; Lepidoptera: Gelechiidae), in Tunisia, inferred from RAPD-PCR. Chilean Journal of Agricultural Research 72(2) 212-216
  2. Cifuentes D, Chynoweth R, Bielza P (2011) Genetic study of Mediterranean and South American populations of tomato leafminer Tuta absoluta (Povolny, 1994) (Lepidoptera:Gelechiidae) using ribosomal and mitochondrial markers. Pest Management Science 67(9): 1155-1162
  3. Duric Z, Delic D, Hrncic S, Radonjic S, (2014) Distribution and molecular identification of Tuta absoluta (MEYRICK, 1917) (Lepidoptera, Gelechiidae) populations in Bosnia and Herzegovina and Montenegro. Polish journal of Entomology 83: 121-129
  4. Erler F, Can M., Erdogan M, Ateş AÖ, Pradier T (2010) New Record of Tuta absoluta (Meyrick) (Lepidoptera: Gelechiidae) on Greenhouse-Grown Tomato in Southwestern Turkey (Antalya). Journal of Entomological Science 45(4): 392-393
  5. Flores LV, Gilardon E, Gardenal CN (2003) Genetic Structure of populations of Tuta absoluta Meyrick (Lepidoptera: Gelechiidae). Journal of Basic & Applied Genetics 15(1): 29-32
  6. Guillemaud T, Blin A, Le Goff I, Desneux N, Reyes M, Tabone E, Tsagkarakou A, Nino L, Lambert E (2015)
  7. The tomato borer, Tuta absoluta invading the Mediterranean Basin, originates from a single introduction from Central Chile. Scientific reports. doi: 10.1038/srep08371 Kılıç T (2010) First record of Tuta absoluta in Turkey. Phytoparasitica 38: 243–244
  8. Kimpton CP, Gill P, Walton A, Urquhart A, Millican ES, Adams M (1993) Automated DNA profiling employing multiplex amplification of short tandem repeat loci. PCR methods and applications 3: 13-22. OEPP⁄EPPO (2005) Data sheets on quarantine pests: Tuta absoluta. EPPO Bulletin 35: 434–435.
  9. Proffit M, Birgersson G, Bengtsson M, Reis Jr. R, Witzgall P, Lima E (2011) Attraction and Oviposition of Tuta absoluta Females in Response to Tomato Leaf Volatiles. Journal of Chemical Ecology 37:565–574
  10. Salas J. (2004) Capture of Tuta absoluta (Lepidoptera: Gelechiidae) in traps baited with its sex pheromone. The Revista Colombiana de Entomología 30: 75–78.
  11. Simon C, Frati F, Bechenbach A, Crespi B, Liu H, Flook P (1994) Evolution, weighting, and phylogenetic utility of mitochondrial gene sequence and compilation of conserved polymerase chain reaction primers. Annals of the Entomological Society of America 87: 651-701.
  12. Suinaga FA, Casali VWD, Picanço M, Foster J (2004) Genetic