Dergiler / Mediterranean Agricultural Sciences / 2017 / Cilt: 30 - Sayı: 1

Türkiye’de nohutta solgunluğa neden olan Fusarium spp.’nin moleküler tanımlaması ve Fusarium redolens’in ilk raporu

Molecular identification of Fusarium spp. causing wilt of chickpea and the first report of Fusarium redolens in Turkey

Sayfa
27–33
Yayın Tarihi
2017-04-04
DOI
—
🏛️Bu makalenin bibliyografik verileri ve tam metin bağlantısı DergiPark üzerinden sağlanmıştır.
DergiPark Kaydı ↗
✨

Yapay Zeka Hızlı Bakış & Çıkarımlar

AI Insight
⚡ TL;DR(1 Cümlede Hızlı Çıkarım)

Bu, Türkiye’de nohutta solgunluğa neden olan F. redolens’in ilk raporudur.

📌 3 Maddede Bu Makale

🎯
Amaç & Hipotez:Nohut (Cicer arietinum L.) önemli bir yemeklik baklagil türüdür ve Fusarium oxysporum f. sp. ciceris tarafından neden olunan Fusarium solgunluğu Türkiye’de en önemli nohut hastalıklarından biridir.
📊
Temel Bulgular & Veri:Nohutta solgunluğa neden olan kırkbeş Fusarium spp. izolatı 2007’den 2009’a kadar Türkiye’deki 10 ilden elde edilmiştir.
💡
Sonuç & Katkı:Bu, Türkiye’de nohutta solgunluğa neden olan F. redolens’in ilk raporudur.
🔬Tür:Araştırma Makalesi
📍Kapsam:2007 Verileri
⚙️Değişkenler:Nohut · Fusarium oxysporum · Fusarium redolens

Özet

Nohut (Cicer arietinum L.) önemli bir yemeklik baklagil türüdür ve Fusarium oxysporum f. sp. ciceris tarafından neden olunan Fusarium solgunluğu Türkiye’de en önemli nohut hastalıklarından biridir. Fusarium redolens’in bazı ülkelerde nohutta solgunluk benzeri hastalığa neden olduğu bilinmektedir, ancak Türkiye’den rapor edilmemiştir. Patojen tür ve ırklarının doğru tanımlanması, hastalık yönetimi için dayanıklı çeşit geliştirme ve kullanımında önemlidir. Nohutta solgunluğa neden olan kırkbeş Fusarium spp. izolatı 2007’den 2009’a kadar Türkiye’deki 10 ilden elde edilmiştir. Bu izolatların tür seviyesinde tanımlamaları F. oxysporum f. sp. ciceris ve F. redolens için spesifik PCR primerleri ve Translation Elongation Factor 1-α (Ef-1α) gen bölgesinin sekanslanması ile yapılmıştır. İzolat koleksiyonunda, tür spesifik primerlerle yapılan PCR’a göre, sekiz izolat F. redolens ve onbir izolat F. oxysporum f. sp. ciceris olarak tanımlanmıştır. Onbir F. oxysporum f. sp. ciceris izolatının yedisi ırk-spesifik primerlerle yapılan PCR’a göre ırk 0 olarak tanımlanmıştır. Ayrıca, F. oxysporum f. sp. ciceris ırk-spesifik ve F. redolens tür-spesifik primerlerle ürün vermeyen izolatların tanımlamalarında Ef-1α bölgesinin sekans verisi kullanılmıştır. Bu, Türkiye’de nohutta solgunluğa neden olan F. redolens’in ilk raporudur.

Abstract

Chickpea (Cicer arietinum L.) is an important food legume crop and Fusarium wilt caused by Fusarium oxysporum f. sp. ciceris is one of the most important diseases of chickpea in Turkey. Fusarium redolens is known to cause wilt-like disease of chickpea in other countries, but has not been reported from Turkey. Accurate identification of pathogen species and races is important for managing the disease in developing and deploying resistant cultivars. Forty five Fusarium spp. isolates caused wilt of chickpea were obtained from 10 provinces in Turkey from 2007 to 2009. Species level identification of these isolates was done using PCR primers specific for F. oxysporum f. sp. ciceris and F. redolens along with sequencing of the Translation Elongation Factor 1-α (Ef-1α) gene region. Among the isolate collection, eight isolates were identified as F. redolens, and eleven isolates as F. oxysporum f. sp. ciceris, based on PCR with species-specific primers. Seven of the eleven F. oxysporum f. sp. ciceris isolates were further identified as race 0, based on PCR with race-specific primers. Moreover, sequence data of Ef-1α region were used to identify any isolate that did not give amplification with F. oxysporum f. sp. ciceris race specific primers and F. redolens specific primers. This is the first report of F. redolens causing chickpea wilt in Turkey.

🔖

Bu Makaleye Atıf Yap

TEKEOĞLU, M., ÖZKILINÇ, H., TUNALI, B., KÜSMENOĞLU, İ., CHEN, W. (2017). Türkiye’de nohutta solgunluğa neden olan Fusarium spp.’nin moleküler tanımlaması ve Fusarium redolens’in ilk raporu. Mediterranean Agricultural Sciences, Cilt: 30 - Sayı: 1, 27–33. https://ajindex.com/articles/123086

📄 Tam Metin PDF Okuyucu

📄

PDF görüntüleyici hazırlanıyor...

Kaynakça (12)

  1. Al-Taae AK, Hadwan HA, Al-Jobory SAE (2013) Physiological races of Fusarium oxysporum f. sp. ciceris in Iraq. Journal of Life Sciences 7: 1070-1075.
  2. Altschul SF, Gish W, Miller W, Myers EW, Lipman DJ (1990) Basic local alignment search tool. Journal of Molecular Biology 215: 403-410.
  3. Armstrong GM, Armstrong JK (1981) Formae speciales races of Fusarium oxysporum causing wilt diseases. In: Nelson PE, Toussoun TA, Cook RJ, editors. Fusarium: Diseases, Biology and Taxonomy, The Pennsylvania State University Press, University Park, p. 391-399.
  4. Asan A. (2011) Checklist of Fusarium species reported from Turkey. Mycotaxon 116: 479. Baayen RP, Van Dreven F, Krijger MC, Waalwijk C (1997) Genetic diversity in Fusarium oxysporum f. sp. dianthi and Fusarium redolens f. sp. dianthi. European Journal of Plant Pathol 103: 395–408.
  5. Baayen RP, O’Donnell K, Bonants PJM. Cigelnik E, Kroon LPN, Roebroeck EJA, Waalwijk C (2000) Gene genealogies and AFLP analyses in the Fusarium oxysporum complex identify monophyletic and non-monophyletic formae speciales causing wilt and rot diseases. Phytopathol 90: 891-900.
  6. Baayen RP, O’Donnell K, Breeuwsma S, Geiser DM, Waalwijk C (2001) Molecular relationships of fungi within the Fusarium redolens–F. hostae clade. Phytopathol, 91: 1037-1044.
  7. Bayraktar H, Dolar FS, Maden S (2008) Use of RAPD and ISSR Markers in Detection of Genetic Variation and Population Structure among Fusarium oxysporum f. sp. ciceris Isolates on Chickpea in Turkey. J Phytopathol, 156: 146–154.
  8. Bayraktar H, Dolar FS (2009) Genetic diversity of wilt and root rot pathogens of chickpea, as assessed by RAPD and ISSR. Turk. J. Agric. For., 33: 1-10.
  9. Bayraktar H, Dolar FS (2012) Pathogenic variability of Fusarium oxysporum f. sp. ciceris isolates from chickpea in Turkey. Pak. J. Bot., 44: 821-823.
  10. Bienapfl JC, Malvick DK, Percich JA (2010) First report of Fusarium redolens causing root rot of soybean in Minnesota. Plant Dis, 94: 1069. Bogale M, Wingfield BD, Wingfield MJ, Steenkamp ET (2006) Characterization of Fusarium oxysporum isolates from Ethiopia using AFLP, SSR, and DNA sequence analyses. Fungal Divers, 23: 51-66.
  11. Bogale M, Wingfield BD, Wingfield MJ, Steenkamp MJ (2007) Species-specific primers for Fusarium redolens and a PCR-RFLP technique to distinquish among three clades of Fusarium oxysporum. FEMS Microbiol Lett 271: 27-32.
  12. Booth C (1971) The Genus Fusarium. Commonwealth Mycological Institute, Kew. Booth C (1977) Fusarium Laboratory Guide to the Identification of t