Dergiler / Mediterranean Agricultural Sciences / 2019 / Cilt: 32 - Sayı: 3

Biber hafif benek virüs’üne (PMMoV) karşı L4 dayanıklılık durumunun taranması ve moleküler yöntemlerle karakterizasyonu

Screening of L4 resistance status to pepper mild mottle virus (PMMoV) and characterization by molecular methods

Sayfa
297–305
Yayın Tarihi
2019-12-01
DOI
—
🏛️Bu makalenin bibliyografik verileri ve tam metin bağlantısı DergiPark üzerinden sağlanmıştır.
DergiPark Kaydı ↗
✨

Yapay Zeka Hızlı Bakış & Çıkarımlar

AI Insight
⚡ TL;DR(1 Cümlede Hızlı Çıkarım)

Dünyanın farklı bölgelerinde L4 geni vasıtasıyla sağlanan dayanıklılığı kıran virüs izolatının rapor edilmesi, ülkemizde de PMMoV’nin epidemi durumunun araştırılması gerekliliğini ortaya koymuştur.

📌 3 Maddede Bu Makale

🎯
Amaç & Hipotez:Biber hafif benek virüsü (Pepper mild mottle virus- PMMoV) Tobamovirüsler içerisinde yer alan dünya genelinde biber üretim alanlarında en sık karşılaşılan virüslerden biridir.
📊
Temel Bulgular & Veri:Dünyanın farklı bölgelerinde L4 geni vasıtasıyla sağlanan dayanıklılığı kıran virüs izolatının rapor edilmesi, ülkemizde de PMMoV’nin epidemi durumunun araştırılması gerekliliğini ortaya koymuştur.
💡
Sonuç & Katkı:Dayanıklı olarak seçilen bitkiler üzerinde herhangi bir PMMoV simptomunun oluşmaması üzerine en başarılı çalışan L4 markırlarını belirlemeye yönelik primerlerin belirlenmesi tez çalışmasının seyrini belirlemiş ve en başarılı markırın AP-7/AP-8 ve P118/119primer çiftleri olduğu tespit edilmiştir.
🔬Tür:Araştırma Makalesi
📍Kapsam:Genişletilmiş Akademik Örneklem
⚙️Değişkenler:L4 geni · Dayanıklılığın kırılması · Biber hafif benek virüsü

Özet

Biber hafif benek virüsü (Pepper mild mottle virus- PMMoV) Tobamovirüsler içerisinde yer alan dünya genelinde biber üretim alanlarında en sık karşılaşılan virüslerden biridir. Bu virüs çoğu zaman hasat dönemine kadar gizli kalabilmekte ve en büyük zararlarını hasat döneminde meyveler üzerinde meydana getirebilmektedir. Bölgemizde son yıllarda biber üretim alanlarında sıklıkla karşılaşılan bir problem olarak karşımıza çıkmaktadır. Dünyanın farklı bölgelerinde L4 geni vasıtasıyla sağlanan dayanıklılığı kıran virüs izolatının rapor edilmesi, ülkemizde de PMMoV’nin epidemi durumunun araştırılması gerekliliğini ortaya koymuştur. L4 dayanıklılığının etkinliğini belirleyebilmek için bölgemizden biber üretim alanlarında PMMoV ile şüpheli örnekler toplanmıştır. RT-PCR tekniği ile doğrulanan bu örnek PMMoV-Kum olarak kodlanmıştır ve Gen bankasına kaydı yapılarak erişim numarası (MK806437) alınmıştır. PMMoV-Kum izolatı 1 hassas (B1) ve 5 dayanıklı (L4B1, L4B2, L4B3, L4B4, L4B5) bitkilerine mekanik inokulasyon yöntemi ile bulaştırılmıştır. Yapılan fenotipik gözlemler neticesinde PMMoV-Kum izolatının L4 genine bağlı dayanıklılığı kıramadığı biyolojik testler ile doğrulanmıştır. Dayanıklı olarak seçilen bitkiler üzerinde herhangi bir PMMoV simptomunun oluşmaması üzerine en başarılı çalışan L4 markırlarını belirlemeye yönelik primerlerin belirlenmesi tez çalışmasının seyrini belirlemiş ve en başarılı markırın AP-7/AP-8 ve P118/119primer çiftleri olduğu tespit edilmiştir.

Abstract

Pepper mild mottle virus (PMMoV) is one of the most common Tobamoviruses can be found in worldwide. This virus has potential to cause economic losses and has kept secret infections until harvest time causing great damages on pepper fruits at this period. During 2016-2019 production periods, it has been frequently seen in pepper grown areas. Several isolates reported from different regions of the world regarding resistance with L4 gene fights against this virus disease. In this study, we aimed to investigate how the PMMoV increased and understood its incidence pepper grown areas in Turkey. In order to determine the effectiveness of L4 resistance, PMMoV and other suspected pepper samples were isolated. The collected samples were studied by RT-PCR technique using PMMoV-Kum isolate and its gene bank’s access number (MK806437) was registered. A sensitive (B1) and 5 resistant (L4B1, L4B2, L4B3, L4B4, L4B5) plants were mechanically inoculated with the PMMoV-Kum isolate and their phenotypic observations were recorded. The PMMoV-Kum isolate was confirmed as avirulent in biological tests, the PMMoV could not overcome L4 gene mediated resistance. Furthermore, a successful primer set has determined as AP-7 / AP-8 in L4 gene mediated resistance against occurrence of any PMMoV symptoms on the tested plants. Determining new PMMoV isolates which break the L4 gene mediated resistance, phylogenetic analyzes was performed to determine its place among the world’s isolates.

🔖

Bu Makaleye Atıf Yap

FİDAN, H., BARUT, M. (2019). Biber hafif benek virüs’üne (PMMoV) karşı L4 dayanıklılık durumunun taranması ve moleküler yöntemlerle karakterizasyonu. Mediterranean Agricultural Sciences, Cilt: 32 - Sayı: 3, 297–305. https://ajindex.com/articles/122997

📄 Tam Metin PDF Okuyucu

📄

PDF görüntüleyici hazırlanıyor...

Kaynakça (13)

  1. Antignus Y, Lachman O, Pearlsman M, Maslenin L, Rosner A (2008) A New Pathotype of Pepper mild mottle virus (PMMoV) Overcomes the L4 Resistance Genotype of Pepper Cultivars. Plant Disease 92(7): 1033–1037. Berzal-Herranz A, de la Cruz A, Tenllado F, Díaz-Ruíz JR, López L, Sanz AI, Vaquero C, Serra MT, García-Luque I (1995) The Capsicum L3 gene-mediated resistance against the Tobamoviruses is elicited by the coat protein. Virology 209: 498-505.
  2. Boukema IW (1980) Allelism of genes controlling resistance to TMV in Capsicum L. Euphytica 29: 433–439.
  3. Boukema IW (1983) Research on the location of the gene for resistance to TMV in Capsicum chacoense Hunz. and male sterility in progenies from the cross C. chacoense×C. annuum L. Proceedings Vth Meeting Capsicum and Eggplant Working Group of Eucarpia, Bulgaria, p. 84-87.
  4. Boukema IW (1984) Resistance to TMV in Capsicum chacoense Hunz. is governed by an allele of the L-locus. Capsicum Newsletter 3: 47-48.
  5. Choi GS, Choi SK, Cho JD, Cho IS (2013) A pathotype of Pepper Mild Mottle Virus causing necrotic spot symptoms in paprika fruit. Research in Plant Disease 19: 124-127.
  6. Choi GS, Choi SK, Cho IS, Kwon SJ (2014) Resistance screening to Pepper Mild Mottle iVrus pathotypes in paprika cultivars. Research in Plant Disease 20: 299-302.
  7. Csillery G, Tobias I, Rusko J (1983) A New Pepper Strain of Tomato Mosaic Virus. Acta Phytopathologica Academiae Scientiarum Hungaricae 18: 195-200.
  8. Çağlar BK, Fidan H, Elbeaino T (2012) Detection and Molecular Characterization of Pepper Mild Mottle Virus from Turkey. Journal of Phytopathology 161(6): 434-438.
  9. FAOSTAT (2018) Statistical database. http://www. fao.org/faostat/en/#data/QC. Accessed 11 May 2018.
  10. Fidan H, Sarı N (2019) Molecular Characterization of Resistance-Breaking Tomato Spotted Wilt Virus (TSWV) Isolate Medium Segment in Tomato. Applıed Ecology and Environmental Research 17(2): 5321-5339.
  11. Genda Y, Kanda A, Hamada H, Sato K, Ohnishi J, Tsuda S (2007) Two amino acid substitutions in the coat protein of Pepper mild mottle virus are responsible for overcoming the L4 gene-mediated resistance in Capsicum spp. Phytopathology 97: 787-793.
  12. Hall TA (1999) BioEdit: a user-friendly biological sequence alignment editor and analysis program for Windows 95/98/NT. Oxford University Prees, Nucleic Acids Syposium Series No.41: 95-98.
  13. Janzac B, Fabre MF, Palloıx A, Moury B (2009) Phenotype and spectrum of action of the Pvr4 resistance in pepper against potyviruses, and selection of virulent vari