Quinolone Resistant Escherichia coli Isolates Investigation of Resistance Rates to Other Antibiotics

Kinolon Dirençli Escherichia coli İzolatlarında Diğer Antibiyotiklere Direnç Oranlarının Araştırılması

Abstract

AbstractEscherichia coli, found in the normal intestinal flora of humans, is an opportunistic pathogen that causes infection in many tissues and organs. Although E. coli is mainly responsible for community-acquired urinary tract infections, it may also be a causative agent of nosocomial infections in patients with underlying severe disease. The widespread use of quinolone antibiotics in recent years has increased the resistance rates to these antibiotics. The aim of this study was to investigate the resistance rate of quinolone resistant E.coli clinical isolates to other antibiotic groups. A total of 153 quinolone resistant E. coli strains isolated from various clinical specimens in the Microbiology Laboratory of Recep Tayyip Erdoğan University Training and Research Hospital were included in the study. The identification of strains was confirmed by conventional methods. Antibiotic susceptibility tests were evaluated by the Kirby-Bauer disc diffusion method according to CLSI (2010) criteria. Bacterial colonies obtained from 18-20 hours of fresh culture passages were dried on a commercially obtained 4 mm thick Müller Hinton agar surface and the bacterial suspension prepared according to 0.5 MacFarland scales was spread to the plate surface with sterile swab. The discs were placed at least 24 mm apart at a maximum of 12 discs in 150 mm diameter plates and incubated at 35-37 ° C for 18-24 hours. After the incubation of the antibiograms, zone diameters were measured according to CLSI (2010) standards and reported as susceptible, moderately sensitive and resistant. Between June 2016 and July 2017, antibiotic resistance percentages of 153 quinolone resistant E. coli isolates were obtained from 82 outpatient clinics, 38 outpatient clinics, and 33 from intensive care units. The antibiotic resistance rates were as follows; norfloxacine 100%, levofloxacin and ofloxacine 97.4%, amikacine 3.3%, gentamicin 37.2%, ceftazidime 58.2%, ceftriaxone 62.7%, imipeneme and meropeneme 1.3%, amoxicillin/clavulanic acid 41.2%, sulbactam/ampicillin 62.1%, piperacillin/tazobactam 17.6%, colistin and tigecycline were found as 2.61%.

Özet

Özet İnsanların normal bağırsak florasında bulunan Escherichia coli birçok doku ve organda enfeksiyona sebep olan fırsatçı bir patojendir. E. coli daha çok toplum kökenli üriner sistem enfeksiyonlarından sorumlu olmakla birlikte, altta yatan ağır hastalığı olan hastalarda hastane enfeksiyonu etkeni de olabilmektedir. Son yıllarda kinolon grubu antibiyotiklerin yaygın olarak kullanılmasıyla bu antibiyotiklere karşı da direnç oranlarını giderek arttırmaktadır. Bu çalışmanın amacı, kinolon dirençli E.coli klinik izolatlarının diğer antibiyotik gruplarına direnç oranını araştırmaktır. Recep Tayyip Erdoğan Üniversitesi Eğitim ve Araştırma Hastanesi Mikrobiyoloji Laboratuvarına Haziran 2016 ile Temmuz 2017 tarihleri arasında 82’si polikliniklerden, 38’i servislerden ve 33’ü de yoğun bakım ünitelerinden gelen örnekler olmak üzere toplam 153 kinolon dirençli E. coli suşu çalışmaya alındı. Suşların identifikasyonları, konvansiyonel yöntemler kullanılarak doğrulandı. Antibiyotik duyarlılık testleri CLSI(2010) kriterlerine göre Kirby-Bauer disk difüzyon yöntemi ile yapılarak değerlendirildi. 18-20 saatlik taze kültür pasajlarından elde edilen bakteri kolonileri 0,5 Mac Farland eşeline göre hazırlanarak, 150 mm’lik Müller Hinton agar plaklarına steril eküvyonla yayıldı. Antibiyotik diskleri, plaklara en fazla 12 disk ve diskler arasında en az 24 mm olacak şekilde yerleştirilerek 35-37 °C etüvde 18- 24 saat arasında inkübe edildi. Sonuçlar; CLSI standartlarına göre ölçülerek duyarlı, orta duyarlı ve dirençli olarak rapor edilmiştir. Recep Tayyip Erdoğan Üniversitesi Eğitim ve Araştırma Hastanesi Mikrobiyoloji Laboratuvarında çeşitli klinik örneklerden izole edilen toplam 153 kinolon dirençli E. coli izolatının antibiyotik direnç yüzdeleri; siprofloksasin ve norfloksasin %100, levofloksasin ve ofloksasin %97,4, amikasin %3,3, gentamisin %37,2, seftazidim %58,2, seftriakson %62,7, imipenem ve meropenem %1,3, amoksisilin/klavulanikasit %41,2, sulbaktam/ampisilin %62,1, piperasilin/tazobaktam %17,6, kolistin ve tigesiklin %2,6 olarak bulundu.