Comparison of auxanogramme media with and without indicator with an alternative assimilation method for the reliable and rapid identification of yeasts

Mayaların güvenilir ve hızlı tanısı için indikatörlü ve indikatörsüz oksanogram besiyerlerinin ve bir alternatif asimilasyon yönteminin karşılaştırılması

Abstract

Rapid and reliable identification of the causative agent contributes to the management of antifungal treatment in severe systemic yeast infections. In spite of the wide spectrum of clinical yeast species encountered and the development of various identification systems, the kits are capable of identifying a limited range of taxa. In this study, the modification of the Wickerham medium devised by Adams and Cooper was used both in test tubes and also alternatively in Petri dishes with sugar embedded disks to compare with the classical auxonographic plate method. The tests were performed using totally 33 yeast strains including 17 standard ATCC strains of Candida, Cryptococcus, Trichosporon, Saccharomyces species together with ones isolated from different clinical and natural sources. The medium with indicator gave rapid, reliable, measurable, reproduceable, objective results and was easier to read than the conventional methods. The alternative method was quicker to read than the later and was also economic with using only one plate to test several carbon sources together. However, using individual test tubes for every carbon source permits to make unlimited test combinations for any suspected yeast taxon, and it was evaluated as suitable for systemic mycology laboratories.

Özet

Yaşamı tehdit eden sistemik maya infeksiyonlarında etkenin doğru ve hızlı olarak tanımlanması tedaviye yön verebilmektedir. Karşılaşılabilen mantarlar çok çeşitlilik gösterebilmekte, etkenin sınırlı bir yelpazede kalacağı varsayımı ile hızlı sonuç veren ürünlerle yapılan tanımlar ise sırasında yetersiz kalabilmektedir. Bu çalışmada; güvenilir, hızlı, daha az zahmetli ve ucuz alternatif tanım yöntemleri aranması amacıyla Petri kutularında hazırlanmış indikatörlü besiyerlerinde şeker çözeltileri emdirilmiş pulcuklar kullanarak yapılan oksanogram deneyleri, Petrilerdeki klasik indikatörsüz ve ayrıca Adams ve Cooper'in tanımladıkları tüplerde indikatörlü besiyerleri kullanılarak karşılaştırılmıştır. Deneylerde 17'si ATCC'den seçilmiş, diğerleri çeşitli doğal ve klinik örneklerden ayrılmış Candida, Cryptococcus. Trichosporon ve Saccharomyces türlerinden oluşan toplam 33 köken kullanılmıştır. İndikatörlü oksanogram besiyeri; okumanın hızlı, güvenilir, kolay, ölçülebilir, tekrarlanabilir ve objektif olması nedeniyle rutin kullanım için elverişli bulunmuştur. İndikatörlü besiyerlerinin Petrilerde hazırlanıp pulcuklara emdirilmiş şeker çözeltilerinin kullanılması daha ekonomik ve daha az zaman alıcı bulunmakla beraber tüplerde uygulamanın çok geniş bir yelpazedeki çeşitli maya taksonlarının tanımlanmasında kullanılabilmesi dolayısıyla, yararlı ve özellikle sistemik mikoloji laboratuvarlarında kullanılmaya elverişli görülmüştür.