Investigation of the Mating-Type Gene Locus of Candida albicans

Müge Arıbal ÇELİK, Aylin DÖĞEN, Deniz AKTAŞ, Süleyha Hilmioğlu POLAT, Macit İLKİT

Abstract

Objective: Mating in Ascomycete fungi is governed by mating type gene region called the MAT locus. The MAT locus contains idiomorphic sequences that are dissimilar in two opposite mating types.In fungi belonging to the Pezizomycotina subphylum, each MAT idiomorph encodes an alpha domain and an HMG (High Mobility Group) domain transcription factor. Although the alpha domain and the HMG domain transcription factor genes are indispensable components, the structure of the MAT locus (length), the gene content, and the transcriptional directions of the genes differ among fungi. This study aimed to evaluate the characterization of mating type of Candida albicans isolated from blood samples in our labouratory culture collection. Method: Using the multiplex PCR technique, 486 bp and 515 bp of the DNA region of MTLa and MTLα primers in the C. albicans genome were determined, respectively. Results: 156 C. albicans isolates showed 155 MTLa/α (99.4%) and 1 MTLα/α (0.6%). Conclusion: Determination of MTL is essential both for making molecular genetic studies more efficient and for understanding the nature of this pathogenic fungus.

Özet

Amaç: Askomiset mantarlarda çiftleşme, MAT lokus adı verilen bir eşey tipi gen bölge-si ile yönetilir. MAT lokus, zıt iki eşey tipinde birbirine benzemeyen hatta tamamenfarklı idiomorf dizilimler içerir. Pezizomycotina alt şubesine dâhil olan mantarlarda herbir MAT idiomorfu, bir alfa domain, bir de HMG (High Mobility Group) domain trans-kripsiyon faktörünü kodlar. Alfa domain ve HMG domain transkripsiyon faktör genleriMAT lokusun olmazsa olmaz parçaları olsa da her bir mantarın MAT lokus yapısı, yaniuzunluğu, gen içeriği ve genlerin transkripsiyon yönleri kendilerine özgüdür. Bu çalış-mada, laboratuvarlarımızın kültür koleksiyonunda bulunan ve kan kültürlerinden izoleedilen Candida albicans’ın eşey tipi gen bölgesinin karakterizasyonunun belirlenmesiamaçlanmıştır.Yöntem: Candida albicans genomunda yer alan MTLa (Mating Type Locus)ve MTLαprimerlerinin 485 bp ve 515 bp’lik DNA bölgesi multiplex PCR tekniği ile belirlendi.Bulgular: Toplam, 156 C. albicans kökeninin 155 (%99.4)’i MTLa/α, 1 (%0.6) köken iseMTLα/α olarak bulundu.Sonuç: MTL karakterizasyonun belirlenmesi çalışmaları hem moleküler genetik çalış-malarının daha kolay ve çabuk yapılabilmesi hem de bu patojen mantarın doğasınınanlaşılması yönünden önemlidir