Journals / Türk Mikrobiyoloji Cemiyeti Dergisi / 2022 / Cilt: 52 - Sayı: 3
Clonal Relationships and Antibiotic Resistance Profiles of Carbapenem- Resistant Acinetobacter baumannii Strains Associated with Healthcare- Related Infections in Eastern Anatolia Region, Turkey
- Pages
- 158–167
- DOI
- —
Abstract
Objective: Huge increase of carbapenem-resistant Acinetobacter baumannii strains associated with healthcareassociated infections is a leading cause of treatment failures. In our study, we aimed to evaluate the genotypic relationships and epidemic risks of carbapenem-resistant Acinetobacter baumannii strains in eastern provinces of Turkey, such as Van, Iğdır, Ağrı, Kars and Ardahan. We also aim to contribute to the surveillance of these infections in the eastern border provinces of Turkey, with our study. Methods: A total of 84 carbapenem-resistant Acinetobacter baumannii strains, which were previously identified according to their phenotypes by conventional culture methods were then confirmed genotypically using blaOXA-51-like genes by PCR. Their antibiotic susceptibility profiles were determined by liquid microdilution method. The phylogenetic relationship between the isolates was assessed using the ApaI-PFGE method. The PFGE band profiles were analized by using the Gel COMPARE-II software system based on a similarity rate of 80% and above. Results: Twenty two of 84 carbapenem-resistant Acinetobacter baumannii isolates showed 100% clonal relationship in eight different pulsotypes. It was observed that 100% similar isolates formed a pulsotype among themselves in the same provinces, where the highest similarity was within the strains from Van province. Conclusion: Association of carbapenem-resistant Acinetobacter baumannii clones should be considered as an indication that Turkey dominates the Eastern Anatolia Region as well. When compared to similar studies from different regions of our country, it was observed that antibiotic resistance of isolated Acinetobacter baumannii strains had lower incidence than other regions. However, the finding of similar clones in different hospitals supports the common fear of carbapenem-resistant Acinetobacter baumannii strains: “certain resistant clones will dominate hospitals and society all over the world”.
Özet
Amaç: Sağlık hizmeti ile ilişkili enfeksiyonlara neden olan karbapenem dirençli Acinetobacter baumannii suşlarının hızlı yayılması, tedavide başarısızlıklara yol açmaktadır. Çalışmamızda, Van, Iğdır, Ağrı, Kars ve Ardahan gibi Türkiye’nin doğu illerinde karbapenem dirençli Acinetobacter baumannii suşları arasındaki genotipik ilişkileri ve salgın riskinin değerlendirilmesi amaçlanmıştır. Çalışmamızla Türkiye’nin doğu sınır illerinin enfeksiyon sürveyansına önemli katkı sağlamayı amaçladık. Yöntem: Konvansiyonel kültür yöntemleriyle fenotipik olarak tanımlanmış 84 karbapenem dirençli Acinetobacter baumannii suşu, blaOXA-51-benzeri gen bölgesi de PCR yöntemiyle tespit edilerek doğrulanmış ve antibiyotik duyarlılıkları sıvı mikrodilüsyon yöntemi ile belirlenmiştir. İzolatlar arasındaki filogenetik ilişki ApaI-PFGE yöntemi ile yapılmıştır. PFGE bant profilleri, %80 ve üzeri benzerlik oranına dayalı olarak Gel COMPARE-II yazılım sistemi kullanılarak analiz edilmiştir. Bulgular: Karbapenem dirençli 84 Acinetobacter baumannii izolatlarının 22 tanesi sekiz farklı pulsotipte %100 klonal ilişki bulunmuş ve %100 benzer izolatların aynı illerde kendi aralarında pulsotip oluşturduğu gözlemlenmiştir. En fazla benzerliğin Van suşlarına ait olduğu tespit edilmiştir. Sonuç: Karbapenem dirençli Acinetobacter baumannii klonlarının ilişkisi Türkiye’nin Doğu Anadolu bölgesine de hâkim olduğunun bir göstergesi olarak değerlendirilmelidir. Ülkemizin farklı bölgelerinde yapılan araştırmalar ile kıyaslandığında, izole edilen Acinetobacter baumannii suşlarının antibiyotik direncinin diğer bölgelere oranla daha düşük insidans da ancak farklı hastanelerde benzer klonların görülmesinin, karbapenem dirençli Acinetobacter baumannii için düşünülen “belirli dirençli klonlar bütün dünyada hastanelere ve topluma hâkim olacak” korkusunu destekler niteliktedir.