Journals / Türk Klinik Biyokimya Dergisi / 2015 / Cilt: 13 - Sayı: 3
The need of urine culture requests: Can it be reduced by automated urine analyzer?
- Pages
- 107–113
- DOI
- —
Abstract
Purpose: Urinary tracts infections (UTI) are the most common cause of bacterial and hospital based infections. The gold standard in the diagnosis of UTI is urine culture. Patients with suspected UTI are usually requested for urinalysis simultaneously with urine culture. In general practice only 20-25 % of urine culture tests are found to be positive. In our study we assessed the need for urine culture requests by considering some urinalysis parameters on a software for iRICELL 2000 automated urine analyzer. Material and Methods: We performed our study on 493 volunteers samples which were simultaneously requested for urinalysis together with urine culture. Samples are analyzed for both urinalysis and urine culture. The principal of the software we used was to consider the count of microscopic analyze parameters; leukocyte, bacteria, all small particles (ASP) and chemical analyze parameters; leukocyte esterase and nitrite positivity to alarm us for the further need of urine culture requests. The cut-offs of these parameters are as follows; leukocyte ≥ 5 /hpf, presence of bacteria, ASP ≥ 7000 /microliter, positivity of leukocyte esterase and nitrite. In addition to the parameters considered on this software we also assessed the protein, erytrocyte, epitelial cells which are known to be increased in UTI. Results: We determined positive urine culture (culture (+)) results in 24.1 % of total sample. Leukocyte, ASP, eritrocyte values were statistically significant in culture (+) group comparing to culture (-) group (p=0.0001). Odds ratio values (95 % CI: Confidence Interval) for leukocyte esterase, nitrite (+), bacteria (+), leucocyte> 5 and ASP>7000 were found to be 5.63, 34.02, 8.18, 4.48, 2.17 respectively. In 91.6 % culture (+) group all 5 parameters examined were above the determined cut-offs and they were considered to be iRICELL (+). The probability of positive urine cultures in İRICELL (+) group was 6.52 times greater than İRICELL (-) group. Accepting the urine culture results as gold standard we found sensitivity 91.6 %, specifity 62 %, PPV 32 %, NPV 93 %, accuracy 50 % for iRICELL 2000 method. Conclusion: When high sensitivity and negative predictive values of urinalysis are considered automated urinalysis can be used for negative screening by reducing the need for urine culture requests.
Özet
ÖZET Amaç: Üriner sistem enfeksiyonları (ÜSE) erişkinlerde görülen bakteriyel enfeksiyonların ve hastane kökenli enfeksiyonların en sık nedenidir. ÜSE tanısında altın standart idrar kültürüdür. ÜSE klinik belirtileriyle hekime başvuran birçok hastadan tam idrar analiziyle eş zamanlı idrar kültürü de istenmektedir ve bu kültür tetkiklerinin sadece % 20-25inde üreme olmaktadır. Biz bu çalışmamızda iRICELL 2000 tam otomatik idrar analizörüne yüklenen bir yazılım programıyla tam idrar analizi parametrelerinden faydalanarak idrar kültürü gereksiniminin azaltılıp azaltılamayacağını irdelemeyi hedefledik. Materyal ve Metod: Hastanemiz polikliniklerine başvuran ve eş zamanlı tam idrar tetkiki ve idrar kültürü istenen 493 hasta çalışmaya dahil edilmiştir. İdrar örneklerinde eş zamanlı olarak tam idrar ve kültür analizi gerçekleştirilmiştir. Tam otomatik idrar cihazına yüklenen yazılım programının esası mikroskobik analizde: lökosit, bakteri, tüm küçük partiküllerin sayısı ve kimyasal analizde: lökosit esteraz ve nitrit parametrelerinin tamamını kullanarak idrar kültürüne gereksinimin olmadığı yönünde bir uyarı vermesidir. Bu parametreler için belirlenen cut-off değerleri; Lökosit ≥ 5 /HPF, bakteri varlığı, ASP ≥ 7000 μl, lökosit esteraz ve nitrit pozitifliğidir. Bu yazılım programının belirlediği parametrelere ek olarak ÜSE durumlarında idrarda arttığı görülebilen; eritrosit ve yassı epitel hücrelerini de değerlendirmeye aldık. Bulgular: Kültür incelemesinde % 24.1 (n=119) hastada üreme saptanmıştır. Üreme (+) grubunun lökosit, tüm küçük partikül sayısı, eritrosit değerleri üreme (-) grubundan istatistiksel olarak anlamlı derecede yüksek bulunmuştur (p= 0.0001). İncelenen 5 parametre için idrar kültüründe üreme olma riski % 95 güven aralığında Odds Oranları: Lökosit esteraz (+)liğinde 5.63, nitrit (+)liğinde 34.02, bakteri varlığında 8,18, lökosit > 5 iken 4.48, ASP > 7000 iken 2.17dir. Üreme (+) olan grubun % 91.6sında incelenen 5 parametrenin birden belirlenen cut-off değerlerinin üzerinde olduğu görülmüştür ve iRICELL sonucu (+) olarak değerlendirilmiştir. iRICELL sonucu (+) olanların idrar kültüründe üreme olma riski İRICELL (-) olanlardan 6.52 kat daha fazladır. Kültürde üreme varlığı ile IRICELL 2000 sonucunun (5 parametrenin toplu değerlendirmesi) duyarlılığı % 91.6, özgüllüğü % 62, pozitif kestirim değeri % 32, negatif kestirim değeri % 93, testin doğruluğu % 50 bulunmuştur. Sonuç:Yüksek duyarlılık ve negatif kestirim değeri oranları dikkate alındığında tam otomatik idrar cihazı, kültür gereksinimi açısından etkin bir negatif tarama aracı olarak değerlendirilebilir.